[发明专利]HLA高分辨基因测序试剂盒有效

专利信息
申请号: 201010239605.8 申请日: 2010-07-29
公开(公告)号: CN101892317A 公开(公告)日: 2010-11-24
发明(设计)人: 邱桥成 申请(专利权)人: 苏州大学;苏州大学附属第一医院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 代理人: 陶海锋
地址: 215123 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: hla 分辨 基因 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种人类白细胞抗原基因的分型方法,包括以下步骤:

(1)按照常规技术提取待测基因组DNA,使用PCR扩增引物扩增所要分析的目的基因片段;

(2)使用测序引物对步骤(1)所得PCR产物进行扩增,扩增各外显子,然后对扩增出的各外显子进行测序,并将测序结果与数据库中的标准序列进行比较,从而确定基因分型结果;

其特征在于,其中,步骤(1)中所述目的基因片段包括HLA-A的2,3,4外显子,HLA-B的2,3,4外显子和HLA-DRB1位点2外显子;

相应的PCR扩增引物对包括:HLA-A位点扩增引物,HLA-B位点扩增引物和HLA-DRB1位点扩增引物;

其中,所述HLA-A位点扩增引物包括:

正义引物,SEQ ID No.1:CCATTGGGTGTCGGGTTTC;

反义引物,SEQ ID No.2:CAGCAATGATGCCCACGATG;

所述HLA-B位点扩增引物包括:

正义引物1,SEQ ID No.3:CCCTGAGTTTCACTTCTTCTCCCA;

正义引物2,SEQ ID No.4:CCACGAGTTTCACTTCTTCTCCCA;

反义引物,SEQ ID No.5:CCAGCAACAATGCCCACGAT;

所述HLA-DRB1位点扩增引物包括:

G1,SEQ ID No.6:TGTAAAACGACGGCCAGTTCTTGTGGCAGCTTAAGTT;

G2,SEQ ID No.7:TGTAAAACGACGGCCAGTTCCTGTGGCAGCCTAAGAGG;

G3,SEQ ID No.8:TGTAAAACGACGGCCAGTTCTTGGAGTACTCTACGT;

G4,SEQ ID No.9:TGTAAAACGACGGCCAGTTCTTGGAGCAGGTTAAAC;

G7,SEQ ID No.10:GTAAAACGACGGCCAGTTCCTGTGGCAGGGTAAGTATA;

G8,SEQ ID No.11:TGTAAAACGACGGCCAGTTCTTGGAGTACTCTACGG;

G9,SEQ ID No.12:TGTAATACGACGGCCAGTTCTTGAAGCAGGATAAGTT;

G10,SEQ ID No.13:TGTAATACGACGGCCAGTTCTTGGAGGAGGTTAAGTT;

R,SEQ ID No.14:CAGGAAACAGCTATGACCGCTCACCTCGCCGCTGCAC;

R*09,SEQ ID No.15:CAGGAAACAGCTATGACCGCTTACCTCGCCTCTGCAC;

步骤(2)中,相应的测序引物包括:HLA-A位点的第2、3、4外显子测序引物,HLA-B位点的第2、3、4外显子测序引物和HLA-DRB1位点的第2外显子测序引物;

所述HLA-A位点的第2外显子测序引物包括:

A2F,SEQ ID No.16:CGGGGAGAAGCAASGG;

A2R,SEQ ID No.17:CGGACCCGGAGACTGTG;

所述HLA-A位点的第3外显子测序引物包括:

A3F,SEQ ID No.18:GGTTTCATTTTCAGTTTAGGC;

A3R,SEQ ID No.19:TTGTCTCCCCTCCTTGTGG;

所述HLA-A位点的第4外显子测序引物包括:

A4F,SEQ ID No.20:GGTGTCCTGTCCATTCTCAAG;

A4R,SEQ ID No.21:CAGAGAGGCTCCTGCT;

所述HLA-B位点的第2外显子测序引物包括:

B2F,SEQ ID No.22:CCCAGGCTCCCACTCCAT;

B2R,SEQ ID No.23:GGGGAGTCGTGACCTGC;

所述HLA-B位点的第3外显子测序引物包括:

B3F,SEQ ID No.24:GGCCAGGGTCTCACAC;

B3R,SEQ ID No.25:GGCGACATTCTAGCGC;

所述HLA-B位点的第4外显子测序引物包括:

B4F,SEQ ID No.26:AGATGCAAAGCGCCTGAA;

B4R,SEQ ID No.27:GGCTCCTGCTTTCCCTGA;

所述HLA-DRB1位点的第2外显子测序引物包括:

M13F,SEQ ID No.28:TGTAAAACGACGGCCAGT;

M13R,SEQ ID No.29:CAGGAAACAGCTATGACC;

Codon 86,SEQ ID No.30:CTGCACTGTGAAGCTCTCCA。

2.一种HLA高分辨基因测序试剂盒,含有PCR扩增引物和测序引物,其特征在于,所述PCR扩增引物分别具有SEQ ID No.1至SEQ ID No.15所述的碱基序列,所述测序引物分别具有SEQ ID No.16至SEQ ID No.30所述的碱基序列。

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