[发明专利]HLA高分辨基因测序试剂盒有效
申请号: | 201010239605.8 | 申请日: | 2010-07-29 |
公开(公告)号: | CN101892317A | 公开(公告)日: | 2010-11-24 |
发明(设计)人: | 邱桥成 | 申请(专利权)人: | 苏州大学;苏州大学附属第一医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 | 代理人: | 陶海锋 |
地址: | 215123 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | hla 分辨 基因 试剂盒 | ||
1.一种人类白细胞抗原基因的分型方法,包括以下步骤:
(1)按照常规技术提取待测基因组DNA,使用PCR扩增引物扩增所要分析的目的基因片段;
(2)使用测序引物对步骤(1)所得PCR产物进行扩增,扩增各外显子,然后对扩增出的各外显子进行测序,并将测序结果与数据库中的标准序列进行比较,从而确定基因分型结果;
其特征在于,其中,步骤(1)中所述目的基因片段包括HLA-A的2,3,4外显子,HLA-B的2,3,4外显子和HLA-DRB1位点2外显子;
相应的PCR扩增引物对包括:HLA-A位点扩增引物,HLA-B位点扩增引物和HLA-DRB1位点扩增引物;
其中,所述HLA-A位点扩增引物包括:
正义引物,SEQ ID No.1:CCATTGGGTGTCGGGTTTC;
反义引物,SEQ ID No.2:CAGCAATGATGCCCACGATG;
所述HLA-B位点扩增引物包括:
正义引物1,SEQ ID No.3:CCCTGAGTTTCACTTCTTCTCCCA;
正义引物2,SEQ ID No.4:CCACGAGTTTCACTTCTTCTCCCA;
反义引物,SEQ ID No.5:CCAGCAACAATGCCCACGAT;
所述HLA-DRB1位点扩增引物包括:
G1,SEQ ID No.6:TGTAAAACGACGGCCAGTTCTTGTGGCAGCTTAAGTT;
G2,SEQ ID No.7:TGTAAAACGACGGCCAGTTCCTGTGGCAGCCTAAGAGG;
G3,SEQ ID No.8:TGTAAAACGACGGCCAGTTCTTGGAGTACTCTACGT;
G4,SEQ ID No.9:TGTAAAACGACGGCCAGTTCTTGGAGCAGGTTAAAC;
G7,SEQ ID No.10:GTAAAACGACGGCCAGTTCCTGTGGCAGGGTAAGTATA;
G8,SEQ ID No.11:TGTAAAACGACGGCCAGTTCTTGGAGTACTCTACGG;
G9,SEQ ID No.12:TGTAATACGACGGCCAGTTCTTGAAGCAGGATAAGTT;
G10,SEQ ID No.13:TGTAATACGACGGCCAGTTCTTGGAGGAGGTTAAGTT;
R,SEQ ID No.14:CAGGAAACAGCTATGACCGCTCACCTCGCCGCTGCAC;
R*09,SEQ ID No.15:CAGGAAACAGCTATGACCGCTTACCTCGCCTCTGCAC;
步骤(2)中,相应的测序引物包括:HLA-A位点的第2、3、4外显子测序引物,HLA-B位点的第2、3、4外显子测序引物和HLA-DRB1位点的第2外显子测序引物;
所述HLA-A位点的第2外显子测序引物包括:
A2F,SEQ ID No.16:CGGGGAGAAGCAASGG;
A2R,SEQ ID No.17:CGGACCCGGAGACTGTG;
所述HLA-A位点的第3外显子测序引物包括:
A3F,SEQ ID No.18:GGTTTCATTTTCAGTTTAGGC;
A3R,SEQ ID No.19:TTGTCTCCCCTCCTTGTGG;
所述HLA-A位点的第4外显子测序引物包括:
A4F,SEQ ID No.20:GGTGTCCTGTCCATTCTCAAG;
A4R,SEQ ID No.21:CAGAGAGGCTCCTGCT;
所述HLA-B位点的第2外显子测序引物包括:
B2F,SEQ ID No.22:CCCAGGCTCCCACTCCAT;
B2R,SEQ ID No.23:GGGGAGTCGTGACCTGC;
所述HLA-B位点的第3外显子测序引物包括:
B3F,SEQ ID No.24:GGCCAGGGTCTCACAC;
B3R,SEQ ID No.25:GGCGACATTCTAGCGC;
所述HLA-B位点的第4外显子测序引物包括:
B4F,SEQ ID No.26:AGATGCAAAGCGCCTGAA;
B4R,SEQ ID No.27:GGCTCCTGCTTTCCCTGA;
所述HLA-DRB1位点的第2外显子测序引物包括:
M13F,SEQ ID No.28:TGTAAAACGACGGCCAGT;
M13R,SEQ ID No.29:CAGGAAACAGCTATGACC;
Codon 86,SEQ ID No.30:CTGCACTGTGAAGCTCTCCA。
2.一种HLA高分辨基因测序试剂盒,含有PCR扩增引物和测序引物,其特征在于,所述PCR扩增引物分别具有SEQ ID No.1至SEQ ID No.15所述的碱基序列,所述测序引物分别具有SEQ ID No.16至SEQ ID No.30所述的碱基序列。
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