[发明专利]乳酸杆菌整合膜蛋白活性片段检测方法有效
申请号: | 201010256877.9 | 申请日: | 2010-08-19 |
公开(公告)号: | CN102375062A | 公开(公告)日: | 2012-03-14 |
发明(设计)人: | 秦环龙;刘志华 | 申请(专利权)人: | 上海市第六人民医院 |
主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68;G01N33/569;G01N27/447;C12N15/31;C12N15/63;C07K14/195 |
代理公司: | 上海新天专利代理有限公司 31213 | 代理人: | 王敏杰 |
地址: | 200233 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乳酸 杆菌 整合 膜蛋白 活性 片段 检测 方法 | ||
1.一种乳酸杆菌整合膜蛋白活性片段的检测方法,其特征在于,以乳酸杆菌整合膜蛋白DNA作为模板,加入7组不同引物进行RT-PCR反应,构建出IMP455~755、以及N-末端或C-末端缺失的6种突变蛋白IMP455~515, IMP455~635,IMP455~575,IMP635~755,IMP575~755和IMP515~755共7种PCR扩增产物;具体步骤如下:
步骤1,加入所述引物,将所述膜蛋白进行PCR扩增反应;所述引物与PCR扩增产物对应关系如下:
步骤2,对PCR扩增产物进行电泳分离,凝胶回收后得到所述6个突变DNA和IMP455-755;
步骤3,加入核酸内切酶、IMP455-755分别对6个突变DNA进行酶切;然后将酶切产物与载体BL21(DE3)按10:1比例,在连接酶的作用下分别进行连接;
步骤4,加热至65℃将连接产物灭活,用TOP10感受态细胞、无抗LB培养基以及涂有Amp抗性的平皿进行转化,得到转化产物;
步骤5,取所述转化产物,用Rosetta(DE3)XplyE、无抗LB培养基以及涂有Ch1、Amp抗性的平皿进一步培养;挑取菌落接种于TB培养基,IPTG进行诱导表达;离心分离后悬浮,95℃煮20分钟,然后进行SDS-PAGE电泳纯化;
步骤6,将上述表达产物进行SDS-PAGE电泳,然后以HRP标记的黏蛋白为直标一抗,进行WB和拷马斯亮蓝染检测,通过WB结果与拷马斯亮蓝染结果进行对比;在WB检测结果呈阳性反应的DNA片段中,找出与呈阴性反应DNA片段没有重复区域的DNA片段1,和完全包含呈阴性反应DNA片段的DNA片段2;所述DNA片段1和2的重复区域为所述整合膜蛋白活性片段,其中所述HRP标记粘蛋白方法如下:
取黏蛋白溶解于碳酸盐缓冲液,配置成黏蛋白溶液;配置HRP溶液:HRP溶于水中,加入过碘酸盐溶液,进行搅拌;然后于乙酸盐缓冲液中,透析;向所述透析产物中加入碳酸盐缓冲液,调节PH值至9.0~9.5,制备出HRP溶液;将所述黏蛋白溶液与所述HRP溶液混合,搅拌;向步骤3所得混合溶液中加入硼氢化钠,然后置于硼酸缓冲溶液中透析;制备出HRP标记的黏蛋白。
2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述RT-PCR扩增反应体系包括:10X缓冲溶液,dNTP,引物,DNA模板,rTag聚合酶和重蒸水。
3.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述酶切过程中,反应体系包括:醋酸盐缓冲溶液,插入DNA目的片段,BSA和两种内切酶。
4.根据权利要求3所述的检测方法,其特征在于,所述两种内切酶为XhoⅠ和HindⅢ。
5.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述连接过程中,反应体系包括:载体,所插入的DNA片段,DNA连接酶及其10X缓冲溶液。
6.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于,所述DNA连接酶为T4 DNA连接酶。
7.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述乙酸盐缓冲溶液PH值为4.4。
8.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述透析均在4℃下进行。
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