[发明专利]44个SNP位点多色荧光复合检测的方法及试剂盒有效
申请号: | 201010265870.3 | 申请日: | 2010-08-30 |
公开(公告)号: | CN101921860A | 公开(公告)日: | 2010-12-22 |
发明(设计)人: | 丛斌;李淑瑾;娄春光 | 申请(专利权)人: | 河北医科大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 石家庄国为知识产权事务所 13120 | 代理人: | 米文智 |
地址: | 050000 河北省石家庄*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 44 snp 多色 荧光 复合 检测 方法 试剂盒 | ||
1.44个SNP位点多色荧光复合检测的试剂盒,其包括a)扩增体系:PCR缓冲溶液、MgCl2、dNTPs、PCR引物、Taq DNA聚合酶、模板DNA,b)扩增产物纯化试剂:核酸外切酶Ⅰ及其缓冲溶液、虾碱性磷酸酶及其缓冲溶液,c)延伸反应试剂:延伸引物和SNaPshot反应混合液,d)测试试剂:Hi-Di甲酰胺和GeneScanTM Size Standards-120LIZ,其特征在于,所述PCR引物和延伸引物由44个SNP基因位点的引物组成,所述44个SNP基因位点在NCBI中SNP数据库的rs号分别为rs1109037,rs3780962,rs987640,rs9951171,rs430046,rs338882,rs2342747,rs10092491,rs1821380,rs321198,rs7041158,rs13218440,rs560681,rs445251,rs8078417,rs10488710,rs7520386,rs214955,rs4530059,rs13182883,rs722290,rs6811238,rs279844,rs9905977,rs6955448,rs4288409,rs315791,rs740598,rs2272998,rs7205345,rs10773760,rs221956,rs576261,rs1498553,rs2399332,rs1058083,rs993934,rs1336071,rs1294331,rs1523537,rs2269355,rs12997453,rs1736442和rs10776839。
2.根据权利要求1所述的44个SNP位点多色荧光复合检测的试剂盒,其特征在于所述44个SNP基因位点的PCR引物和延伸引物的序列参见表2。
3.根据权利要求1或2所述的44个SNP位点多色荧光复合检测的试剂盒,其特征在于同时复合扩增包含44个SNPs位点的DNA片段。
4.利用权利要求1所述的试剂盒进行个体识别的测试方法,其特征在于按照下列步骤进行:
a)提取DNA,得DNA提取液;
b)在扩增体系中加入步骤一所得的DNA提取液,然后在扩增仪中进行扩增,扩增条件为:95℃、5min预变性;然后依次在95℃、30s,60℃、30s,65℃、30s,进行35个循环;再在65℃保持7min;最终在4℃保存,获得扩增产物;
c)应用核酸外切酶Ⅰ和虾碱性磷酸酶纯化扩增产物,纯化反应条件:37℃、1h,然后80℃、15min,最终在4℃保存,得纯化后的扩增产物;
d)对纯化后的扩增产物进行延伸反应
将纯化后的扩增产物加入至所述的延伸反应试剂中进行延伸反应;所述的延伸反应的条件:依次在96℃、10s,50℃、5s,60℃、30s进行25个循环,最终保存在4℃,得延伸产物;
e)应用虾碱性磷酸酶纯化延伸产物
将延伸产物加入至虾碱性磷酸酶及其缓冲溶液的混合液中,在下列条件下进行纯化反应:37℃、1h,65℃、15min,最终保存在4℃,得纯化后的延伸产物;
f)检测、确定产物,
将步骤e)中得到的纯化后的延伸产物中加入至所述的测试试剂中,混匀;然后95℃变性3min,4℃迅速冷却后进行电泳检测;最后根据延伸产物峰的位置和颜色确定44个SNP基因位点的基因型。
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