[发明专利]沙门氏菌的PCR检测方法及引物对无效
申请号: | 201010277412.1 | 申请日: | 2010-09-09 |
公开(公告)号: | CN102399854A | 公开(公告)日: | 2012-04-04 |
发明(设计)人: | 丁国才 | 申请(专利权)人: | 上海海帝园艺有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/10;C12N15/11 |
代理公司: | 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 | 代理人: | 郭国中 |
地址: | 201109 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 沙门氏菌 pcr 检测 方法 引物 | ||
技术领域
本发明涉及一种检测技术领域的方法,具体是一种沙门氏菌的PCR检测方法及引物对。
背景技术
近年来,食源性疾病已成为当前突出、广泛的食品安全问题。沙门氏菌(Salmonella)为肠杆菌科沙门氏菌属成员,是条件性细胞内寄生的革兰氏阴性肠杆菌。沙门氏菌是细菌性食物中毒中发病率最高的一种,而且几乎所有的血清型都能致病。传统的沙门氏菌检测方法需要经选择性增菌培养,并通过生化反应及血清学测试来确定,这种检测方法虽然结果较为可靠,但是操作复杂,费时费力,通常需要3~5天才能得到检测结果,不利于及时诊断病因,查找病源,控制病情的蔓延。
发明内容
本发明的第一个目的在于提供一种沙门氏菌的PCR检测方法,包括如下步骤:
步骤一,根据沙门氏菌基因组DNA序列中的保守序列设计扩增引物;
步骤二,提取待检样品的DNA,PCR扩增;
步骤三,凝胶电泳检测扩增产物,判断样品中是否含有沙门氏菌;所述判断为:若电泳结果出现相应扩增条带,则说明样品中含有沙门氏菌。
优选地,步骤一中,所述保守序列的碱基序列如SEQ ID NO:1所示。
优选地,步骤二中,所述引物具体为:正向引物的碱基序列如SEQ ID NO:2所示,反向引物的碱基序列如SEQ ID NO:3所示。
优选地,步骤二中,所述PCR扩增中,25μL反应体系具体为:10×PCR反应缓冲液2.5μL,25mmol/L的Mg2+2.0μL,2.5mmol/L的dNTP 1.0μL,5uM引物对1μL,Taq酶1U,模板溶液取2~5μL,最后补水至25μL。
优选地,步骤二中,所述PCR扩增中的反应条件为:94℃ 5min,94℃30min,55℃ 30min,72℃ 30min,30个循环,72℃终延伸10min。
优选地,步骤二中,所述扩增条带为516bp条带。
本发明的第二个目的在于提供一种引物对,引物对中正向引物的碱基序列如SEQ ID NO:2所示,反向引物的碱基序列如SEQ ID NO:3所示。
本发明具有如下的有益效果:采用本发明的检测方法检测沙门氏菌,检测时间可缩短为10小时内,由于无需采用传统方法中必须使用的抗血清,降低了检测成本;同时,本发明的检测方法也可以用于检测某些抗血清不能检测出的菌株,如抗原不表达的菌株,弥补免疫检测的缺陷,更加具有实用性;本发明的检测靶点具有单一的特异性,检测结果特异,结果判断简单。
附图说明
图1为实施例1中样品检测电泳结果图;
图2为实施例2中不同血清型的沙门氏菌检测电泳结果图;
图3为实施例2中沙门氏菌和其他非沙门氏菌检测电泳结果图;
图4为实施例3中不同浓度DNA扩增后的检测电泳结果图;
图5为实施例4中混合培养物PCR扩增电泳图;
图6为实施例4中沙门氏菌培养物培养后PCR扩增电泳图。
具体实施方式
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件,例如Sambrook等分子克隆:实验室手册(New York:Cold Spring Harbor Laboratory Press,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
以下实施例中涉及的仪器及试剂为:
Tris-EDTA(TE)缓冲液,10×buffer,MgCl2,dNTP,Taq酶均购于捷瑞生物工程上海有限公司;
引物,琼脂糖凝胶,PTC-200PCR基因扩增仪购于美国M.J.Research公司;
5415D台式离心机:Eppendorf公司;电泳仪:北京六一仪器厂;电泳槽、TAT凝胶成像系统:BIO-RAD公司;
以下实施例中涉及的各种菌株均可通过公开的市售渠道获得。
实施例1
1、选择沙门氏菌基因组DNA序列中的保守序列并设计引物
从沙门氏菌基因组DNA序列中选择碱基序列如SEQ ID NO:1所示序列为保守序列。之后利用Primer Premier 5.0软件设计引物,引物序列如下:
正向引物的碱基序列为:gagttactga accaacagct(SEQ ID NO:2);
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