[发明专利]检测H1和H3亚型流感病毒的核苷酸序列和试剂盒有效

专利信息
申请号: 201010526978.3 申请日: 2010-11-01
公开(公告)号: CN101962690A 公开(公告)日: 2011-02-02
发明(设计)人: 张鹤晓;高志强;乔彩霞;蒲静;谷强;张伟;刘环;张利峰;汪琳;柏亚铎;张向东 申请(专利权)人: 中华人民共和国北京出入境检验检疫局
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64;C12N15/11
代理公司: 北京正理专利代理有限公司 11257 代理人: 张文祎
地址: 100026*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 检测 h1 h3 流感病毒 核苷酸 序列 试剂盒
【权利要求书】:

1.一组检测H1和H3亚型流感病毒的核苷酸序列,其核苷酸序列如序列表SEQID NO:1至SEQ ID NO:6,其中序列SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2分别为检测H1亚型流感病毒HA基因的正义引物和反义引物,序列SEQ ID NO:3为检测H1亚型流感病毒HA基因的LNA修饰的荧光探针,序列SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5分别为检测H3亚型流感病毒HA基因的正义引物和反义引物,序列SEQ ID NO:6为检测H3亚型流感病毒HA基因的荧光探针。

2.根据权利要求1所述的检测H1和H3亚型流感病毒的核苷酸序列,其特征在于:所述探针序列SEQ ID NO:3的5’端标记报告荧光基团HEX,3’端标记淬灭荧光基团TAMRA,第5、7、9、11位的碱基用LNA进行修饰。

3.根据权利要求1所述的检测H1和H3亚型流感病毒的核苷酸序列,其特征在于:所述探针序列SEQ ID NO:6的5’端标记报告荧光基团FAM,3’端标记MGB基团。

4.一种检测H1和H3亚型流感病毒的试剂盒,由以下组分组成:

1)裂解液

2)H1亚型单重荧光RT-PCR反应液,包括:PCR缓冲液、RT缓冲液、MgCL2、dNTP、H1正义引物、H1反义引物和H1荧光探针

3)H3亚型单重荧光RT-PCR反应液,包括:RT缓冲液、MgCL2、dNTP、H3正义引物、H3反义引物和H3荧光探针

4)H1和H3双重荧光RT-PCR反应液,包括:RT缓冲液、MgCL2、dNTP、H1正义引物、H1反义引物、H1荧光探针,H3正义引物、H3反义引物、H3荧光探针

5)RT-PCR酶颗粒

6)Taq DNA聚合酶

7)DEPC水

8)阴性对照:流感病毒阴性组织样品,用0.01mol/L pH7.2PBS缓冲盐水制成20%悬液,70℃作用1小时;

9)阳性对照:为体外转录的非感染性RNA片段,其对应的DNA序列为序列表SEQID No.7和SEQ ID No.8所示的核苷酸序列;

其中,H1正义引物为序列表SEQ ID No.1所示的核苷酸序列,H1反义引物为序列表SEQ ID No.2所示的核苷酸序列,H1荧光探针为序列表SEQ ID No.3所示的核苷酸序列,其5’端标记报告荧光基团HEX,3’端标记淬灭荧光基团TAMRA,第5、7、9、11位的碱基用LNA进行修饰,H3正义引物为序列表SEQ ID No.4所示的核苷酸序列,H3反义引物为序列表SEQ ID No.5所示的核苷酸序列,H3荧光探针为序列表SEQID No.6所示的核苷酸序列,其5’端标记报告荧光基团FAM,3’端标记MGB基团。

5.根据权利要求4所述的检测H1和H3亚型流感病毒的试剂盒,其特征在于,所述H1亚型单重荧光RT-PCR反应液包括:0.5×PCR缓冲液、0.5×RT缓冲液、1.5mmol/L MgCL2、0.2mmol/L dNTP、0.3μmol/L H1正义引物、0.3μmol/L H1反义引物和0.3μmol/L H1荧光探针;

所述H3亚型单重荧光RT-PCR反应液包括:1×RT缓冲液、4mmol/L MgCL2、0.05mmol/L dNTP、0.4μmol/L H3正义引物、0.4μmol/L H3反义引物和0.2μmol/L H3荧光探针;

所述H1和H3双重荧光RT-PCR反应液,包括:1×RT缓冲液、4mmol/LMgCL2、0.05mmol/L dNTP、0.4μmol/L H1正义引物、0.4μmol/L H1反义引物、0.3μmol/L H1荧光探针、0.4μmol/L H3正义引物、0.4μmol/L H3反义引物、0.3μmol/L H3荧光探针。

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