[发明专利]同时检测马铃薯甲虫AChE基因和Na+通道基因突变的引物及PASA方法有效
申请号: | 201010533079.6 | 申请日: | 2010-11-05 |
公开(公告)号: | CN101974518A | 公开(公告)日: | 2011-02-16 |
发明(设计)人: | 姜卫华;郭文超;卢伟平;熊满辉;王志田;李国清 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 徐冬涛 |
地址: | 210095 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 同时 检测 马铃薯 甲虫 ache 基因 na sup 通道 基因突变 引物 pasa 方法 | ||
1.一对用于扩增马铃薯甲虫乙酰胆碱酯酶基因的外引物,其特征在于该外引物的等位基因非特异性正向引物序列为SEQ ID NO:1,等位基因非特异性反向引物序列为SEQ ID NO:2。
2.一种可同时检测马铃薯甲虫乙酰胆碱酯酶基因S291G突变和Na+通道基因L1014F突变的PASA方法,其特征在于该方法包含以下几个步骤:
a、按常规方法提取马铃薯甲虫基因组DNA;
b、采用以下特异性和非特异性引物对步骤a中提取的马铃薯甲虫的基因组DNA进行PCR扩增:
乙酰胆碱酯酶基因
外引物
AF:SEQ ID NO:1
AR:SEQ ID NO:2
内引物
ARF:SEQ ID NO:3
ASR:SEQ ID NO:4
Na+通道基因
外引物
NF:SEQ ID NO:5
NR:SEQ ID NO:6
内引物
NRF:SEQ ID NO:7
NSR:SEQ ID NO:8;
c、琼脂糖凝胶电泳并根据电泳结果判断马铃薯甲虫乙酰胆碱酯酶基因S291G突变和Na+通道基因L1014F突变的情况。
3.根据权利要求2所述的可同时检测马铃薯甲虫乙酰胆碱酯酶基因S291G突变和Na+通道基因L1014F突变的PASA方法,其特征在于所述的步骤b中对马铃薯甲虫的基因组DNA进行PCR扩增时,PCR反应体系中各组分的体积百分数为:10%10×PCR Buffer、8%Mg2+(25mM)、4%单头马铃薯甲虫成虫基因组DNA、8%dNTPs(2.5mM)、10μM引物ARF和ASR各2%,其它10μM引物各4%、1%TaqE(5U/μl),加双蒸水至反应总体积为100%;
PCR扩增程序:94℃变性4分钟;进入循环,94℃变性30秒,57℃退火30秒,72℃延伸1分钟,16个循环;94℃变性30秒,57℃退火30秒,每循环降0.5℃,72℃延伸1分钟,2个循环;94℃变性30秒,56℃退火30秒,72℃延伸1分钟,15个循环;94℃变性30秒,56℃退火30秒,每循环降0.5℃,72℃延伸1分钟,2个循环;94℃变性30秒,55℃退火30秒,72℃延伸1分钟,9个循环;最后72℃延伸7分钟。
4.根据权利要求2所述的可同时检测马铃薯甲虫乙酰胆碱酯酶基因S291G突变和Na+通道基因L1014F突变的PASA方法,其特征在于所述的步骤c中如果扩增得到6条带:片段为720bp,299bp、456bp及273bp,177bp和100bp,表明该马铃薯甲虫个体为S291G及L1014F等位基因抗性杂合子RS;
如果扩增得到5条带:片段为720bp,299bp、456bp及273bp和177bp,表明该马铃薯甲虫S291G等位基因抗性杂合子RS,L1014F等位基因抗性纯合子RR;如果扩增的片段为720bp,299bp、456bp及273bp和100bp,表明该马铃薯甲虫个体为S291G等位基因抗性杂合子RS,L1014F等位基因敏感纯合子SS;片段为720bp和299bp及273bp,177bp和100bp,表明该马铃薯甲虫个体为S291G等位基因抗性纯合子RR,L1014F等位基因抗性杂合子RS;片段为720bp和456bp及273bp,177bp和100bp,表明该马铃薯甲虫个体为S291G等位基因敏感纯合子SS,L1014F等位基因抗性杂合子RS;
如果扩增得到4条带:片段为720bp,299bp、及273bp和100bp,表明该马铃薯甲虫个体为S291G等位基因抗性纯合子RR,L1014F等位基因敏感纯合子SS;片段为720bp,456bp、及273bp和177bp,表明该马铃薯甲虫个体为S291G等位基因敏感纯合子SS,L1014F等位基因抗性纯合子RR;片段为720bp,299bp、及273bp和177bp,表明该马铃薯甲虫个体为S291G及L1014F等位基因抗性纯合子RR;片段为720bp,456bp、及273bp和100bp,表明该马铃薯甲虫个体为S291G及L1014F等位基因敏感纯合子SS。
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