[发明专利]甘薯病毒病害SPVD的多重RT-PCR检测方法有效
申请号: | 201010565665.9 | 申请日: | 2010-11-30 |
公开(公告)号: | CN102108419A | 公开(公告)日: | 2011-06-29 |
发明(设计)人: | 张振臣;张德胜;乔奇;秦艳红;田雨婷;王永江 | 申请(专利权)人: | 河南省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
代理公司: | 郑州大通专利商标代理有限公司 41111 | 代理人: | 张爱军 |
地址: | 450002 *** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 甘薯 病毒 病害 spvd 多重 rt pcr 检测 方法 | ||
1.甘薯病毒病害SPVD的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,
(1)分别合成甘薯褪绿矮化病毒的引物CSV 1和CSV 2;甘薯羽状斑驳病毒的引物FMV 1和FMV 2;甘薯羽状斑驳病毒CH株系的上游引物FMVCH,甘薯羽状斑驳病毒CH2株系的上游引物FMVCH2,所述引物序列为:
CSV 1:5'-AGTGGTGAYGTAATAGTCGGTGG-3',
CSV 2:5'-GCTAACGATTCACADACAGACTTCA-3',
FMV 1:5'-GARCARTTYCRMGCATGGTATGA-3',
FMV 2:5'-GAAGTGYGTCATRATYTGCCTAA-3',
FMVCH:5'-GCGTGATACGAGCAAAGAAAAGG-3',
FMVCH2:5'- CCAAAAGGGGCATTTACAGCACC-3',
其中Y为C或T,D为G、A或T,R为A或G,M为A或C;
(2)提取感染SPVD的甘薯叶片的总RNA作为PCR模板,进行反转录;
(3)将所述CSV 1、CSV 2、FMV 1、FMV 2、FMVCH和FMVCH2引物置于PCR反应体系中,以反转录产物作为模板,进行PCR扩增;
(4)用琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物。
2.根据权利要求1所述的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,所述反转录时的反应体系为10μl,包括:2μl 5×RT buffer,1μl 浓度为25mmol/L的MgCl2,1μl浓度各为10mmol/L的 dNTP混合物,CSV 2引物0.5μl,FMV 2引物0.5μl,0.25μl浓度为40U/μl的抑制剂,0.5μl浓度为5U/μl的反转录酶,4.25μl 甘薯叶片的总RNA;所述CSV 2、FMV 2引物浓度均为10μmol/L。
3.根据权利要求1所述的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,所述PCR反应体系为25μl,包括:2.5μl 10×PCR buffer,0.3μl浓度为5U/μl 的Taq 酶,2μl浓度各为2.5mmol/L的 dNTP混合物,1.3μl 浓度为25mmol/L 的 MgCl2溶液,CSV 1引物0.5μl、CSV 2引物0.5μl、FMV 1引物0.2μl、FMV2引物1.3μl、FMVCH引物0.3μl、FMVCH2引物0.5μl,所述引物浓度均为10μmol/L,用2μl反转录产物作模板,用DEPC- H2O 补足至25μl。
4.根据权利要求1所述的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,所述反转录时反应程序为:42℃ 40min,99℃ 5min,5℃ 5min,反应后得到反转录产物。
5.根据权利要求1所述的多重RT-PCR检测方法,其特征在于,所述PCR反应程序为:94℃预变性3min,94℃变性30s,54℃退火30s,72℃延伸40s, 30个循环,最后72℃ 延伸10min。
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