[发明专利]一种SNP复合检测体系和检测方法

权利要求书

1.一种SNP复合检测体系，其特征在于，包括48个SNP位点，扩增引物组、微测序引物组以及通用芯片；

所述扩增引物组中包括与所述48个SNP位点一一对应的48对扩增引物，每对扩增引物能扩增待检测DNA上包括其相应的SNP位点的突变型或野生型碱基在内的核苷酸序列；

所述微测序引物组中包括与所述48个SNP位点一一对应的48条微测序引物，每条微测序引物的5’端连有标签序列能与所述通用芯片的标签序列互补，3’端包括与待检测DNA上其相应的SNP位点之前的核苷酸序列互补的序列；

所述48个SNP位点为：rs8176747、rs10488710、rs2272998、rs689512、rs445251、rs5746846、rs9606186、rs3744163、rs722290、rs521861、rs1821380、rs2269355、rs7520386、rs10773760、rs13218440、rs560681、rs221956、rs4530059、rs338882、rs430046、rs13182883、rs9951171、rs1109037、rs1736442、rs159606、rs321198、rs4606077、rs1336071、rs1294331、rs3780962、rs9905977、rs1058083、rs740598、rs8176720、rs8176719、amelogenin、rs8078417、rs2342747、rs10092491、rs6444724、rs1498553、rs12997453、rs7041158、rs214955、rs6955448、rs993934、rs1523537、rs1053878。

2.根据权利要求1所述的SNP复合检测体系，其特征在于，所述扩增引物组为序列表中SEQ ID No.1至SEQ ID No.96的核苷酸序列；所述微测序引物组为序列表中SEQ ID No.97至SEQ ID No.144的核苷酸序列。

3.根据权利要求2所述的SNP复合检测体系，其特征在于，所述微测序引物5’端连有的标签序列分别为序列表中SEQ ID No.97至SEQ ID No.144的各条核苷酸序列的自5’末端的第1至20位的脱氧核苷酸；

4.根据权利要求1所述的SNP复合检测体系，其特征在于，所述通用芯片为：微测序反应通用芯片、固相微测序反应芯片或连接酶反应通用芯片。

5.一种利用权利要求1-4任一项所述SNP复合检测体系进行个体识别、ABO基因分型和性别鉴定的SNP复合检测方法，包括：

1)提取待检测样本的DNA作为模板；

2)使用所述扩增引物组对步骤1提取的DNA模板进行多重PCR扩增反应；

3)然后将步骤2得到的产物使用所述微测序引物组进行引物延伸反应，所述引物延伸反应中ddNTP为荧光标记的ddNTP；

4)将步骤3的产物和通用芯片进行杂交，根据芯片杂交结果进行个体识别、ABO基因分型和性别鉴定；

6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述多重PCR扩增反应在一管中进行或分多管进行。

7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述多重PCR扩增反应的模板为提取自全血、组织等检材的DNA。

8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，所述多重PCR扩增反应的循环参数为：95℃，15min；94℃，30sec；55℃，30sec；72℃，1min sec；40个循环；4℃保存。

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所述引物延伸反应的循环参数为：96℃，3min；94℃，20sec；40℃，11sec；46个循环；4℃保存。

10.根据权利要求9所述的方法，其特征在于，所述杂交的条件为：在密封的盒子中，温箱内42℃杂交，时间为2～2.5小时。