[发明专利]一种KCNQ1、KCNE2与KCNN3基因SNP检测特异性引物和液相芯片有效
| 申请号： | 201010590687.0 | 申请日： | 2010-12-16 |
| 公开（公告）号： | CN102533947A | 公开（公告）日： | 2012-07-04 |
| 发明（设计）人： | 许嘉森;秦会娟;陈少贤;刘志明 | 申请（专利权）人： | 广州益善生物技术有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人： | 万志香;胡杰 |
| 地址： | 510663 广东省广州市广州科*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 kcnq1 kcne2 kcnn3 基因 snp 检测 特异性 引物 芯片 | ||
1.一种KCNQ1、KCNE2与KCNN3基因SNP检测液相芯片，其特征在于：主要包括有：
(A).针对每种SNP分别设计的野生型和突变型的ASPE引物：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因SNP位点的特异性引物组成，所述野生型和突变型的特异性引物分别为：针对KCNQ1基因A184G SNP位点的SEQ ID NO.9及SEQ ID NO.10、针对KCNQ1基因A70C SNP位点的SEQ ID NO.11及SEQ ID NO.12、针对KCNE2基因G166A SNP位点的SEQ IDNO.13及SEQ ID NO.14、和/或针对KCNN3基因G107A SNP位点的SEQ ID NO.15及SEQ IDNO.16；所述tag序列选自SEQ ID NO.1～8；
(B).有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球，所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.17～SEQ ID NO.24中的序列，且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；
(C).用于扩增出需要检测的、具有相应SNP位点的目标序列的引物。
2.根据权利要求1所述的KCNQ1、KCNE2和KCNN3基因SNP检测液相芯片，其特征在于，所述扩增引物为：针对KCNQ1基因A184G SNP位点的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26、针对KCNQ1基因A70C SNP位点的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28、针对KCNE2基因G166ASNP位点的SEQ ID NO.29及SEQ ID NO.30、和/或针对KCNN3基因G107A SNP位点的SEQ IDNO.31及SEQ ID NO.32。
3.根据权利要求1所述的KCNQ1、KCNE2和KCNN3基因SNP检测液相芯片，其特征在于，所述ASPE引物为：由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.9组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ IDNO.10组成的序列、由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.11组成的序列及由SEQ ID NO.4和SEQ IDNO.12组成的序列、由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.13组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQ IDNO.14组成的序列、和/或由SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.15组成的序列及由SEQ ID NO.8和SEQID NO.16组成的序列。
4.根据权利要求1所述的KCNQ1、KCNE2和KCNN3基因SNP检测液相芯片，其特征在于，
(A).所述ASPE引物为：由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.9组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.10组成的序列、由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.11组成的序列及由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.12组成的序列、由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.13组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.14组成的序列、和由SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.15组成的序列及由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.16组成的序列；
(B).由anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球，所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.17～SEQ ID NO.24中的序列，且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；
(C).所述扩增引物为：针对KCNQ1基因A184G SNP位点的SEQ ID NO.25及SEQ IDNO.26、针对KCNQ1基因A70C SNP位点的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28、针对KCNE2基因G166A SNP位点的SEQ ID NO.29及SEQ ID NO.30、和针对KCNN3基因G107A SNP位点的SEQ ID NO.31及SEQ ID NO.32。
5.根据权利要求1-4任一项所述的KCNQ1、KCNE2和KCNN3基因SNP检测液相芯片，其特征在于，所述间隔臂为5-10个T。
6.一种用于KCNQ1、KCNE2和KCNN3基因SNP检测的特异性引物，其特征在于，包括有：针对KCNQ1基因A184G SNP位点的SEQ ID NO.9及SEQ ID NO.10、针对KCNQ1基因A70C SNP位点的SEQ ID NO.11及SEQ ID NO.12、针对KCNE2基因G166A SNP位点的SEQ IDNO.13及SEQ ID NO.14、和/或针对KCNN3基因G107A SNP位点的SEQ ID NO.15及SEQ IDNO.16。
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