[发明专利]一种BRAP与PSMA6基因SNP检测特异性引物和液相芯片有效
申请号: | 201010590998.7 | 申请日: | 2010-12-16 |
公开(公告)号: | CN102533951A | 公开(公告)日: | 2012-07-04 |
发明(设计)人: | 许嘉森;秦会娟;陈少贤;刘志明 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香;胡杰 |
地址: | 510663 广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 brap psma6 基因 snp 检测 特异性 引物 芯片 | ||
1.一种BRAP与PSMA6基因SNP检测液相芯片,其特征在于:主要包括有:
(A).针对每种SNP分别设计的野生型和突变型的ASPE引物:每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因SNP位点的特异性引物组成,所述野生型和突变型的特异性引物分别为:针对BRAP基因A96G SNP位点的SEQ ID NO.7及SEQ ID NO.8、针对BRAP基因A80GSNP位点的SEQ ID NO.9及SEQ ID NO.10、和/或针对PSMA6基因C157G SNP位点的SEQ IDNO.11及SEQ ID NO.12;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~6;
(B).有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.13~SEQ ID NO.18中的序列,且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对;
(C).用于扩增出需要检测的、具有相应SNP位点的目标序列的引物。
2.根据权利要求1所述的BRAP与PSMA6基因SNP检测液相芯片,其特征在于,所述扩增引物为:针对BRAP基因A96G SNP位点的SEQ ID NO.19及SEQ ID NO.20、针对BRAP基因A80G SNP位点的SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22、和/或针对PSMA6基因C157G SNP位点的SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24。
3.根据权利要求1所述的BRAP与PSMA6基因SNP检测液相芯片,其特征在于,所述ASPE引物为:由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.7组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.8组成的序列、由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.9组成的序列及由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.10组成的序列、和/或由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.11组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.12组成的序列。
4.根据权利要求1所述的BRAP与PSMA6基因SNP检测液相芯片,其特征在于,
(A).所述ASPE引物:由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.7组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.8组成的序列、由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.9组成的序列及由SEQ ID NO.4和SEQID NO.10组成的序列、和由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.11组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQID NO.12组成的序列;
(B).有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.13~SEQ ID NO.18中的序列,且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对;
(C).所述扩增出引物:针对BRAP基因A96G SNP位点的SEQ ID NO.19及SEQ IDNO.20、针对BRAP基因A80G SNP位点的SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22、和针对PSMA6基因C157G SNP位点的SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24。
5.根据权利要求1-4任一项所述的BRAP与PSMA6基因SNP检测液相芯片,其特征在于,所述间隔臂为5-10个T。
6.一种用于BRAP与PSMA6基因SNP检测的特异性引物,其特征在于,包括有:针对BRAP基因A96G SNP位点的SEQ ID NO.7及SEQ ID NO.8、针对BRAP基因A80G SNP位点的SEQ IDNO.9及SEQ ID NO.10、和/或针对PSMA6基因C157G SNP位点的SEQ ID NO.11及SEQ IDNO.12。
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