[发明专利]台勾霉素的生物合成基因簇及其应用有效
申请号: | 201010592416.9 | 申请日: | 2010-12-16 |
公开(公告)号: | CN102115757A | 公开(公告)日: | 2011-07-06 |
发明(设计)人: | 张长生;肖毅;李苏梅;牛四文;张光涛;张海波;胡涛;鞠建华 | 申请(专利权)人: | 中国科学院南海海洋研究所 |
主分类号: | C12N15/52 | 分类号: | C12N15/52;C12N15/31;C12N15/09;C12P7/42;C12P19/02;C12P19/62 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 余炳和 |
地址: | 510310 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 霉素 生物 合成 基因 及其 应用 | ||
1.一种台勾霉素的生物合成基因簇,其特征在于,该生物合成基因簇的核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示,包含31个基因,具体为:
1)聚酮合成酶基因,即tiaA1、tiaA2、tiaA3、tiaA4共4个基因:
tiaA1位于基因簇核苷酸序列第41491-57180个碱基处,长度为15690个碱基对,编码聚酮合成酶,5229个氨基酸;
tiaA2位于基因簇核苷酸序列第57186-66803个碱基处,长度为9618个碱基对,编码聚酮合成酶,3205个氨基酸;
tiaA3位于基因簇核苷酸序列第66829-71337个碱基处,长度为4509个碱基对,编码聚酮合成酶,1502个氨基酸;
tiaA4位于基因簇核苷酸序列第71361-81746个碱基处,长度为10386个碱基对,编码聚酮合成酶,3461个氨基酸;
2)脱氧糖基的生物合成基因,即tiaS1、tiaS2、tiaS3、tiaS4、tiaS5、tiaS6、tiaG1、tiaG2共8个基因:
tiaS1位于基因簇核苷酸序列第8508-7492个碱基处,长度为1017个碱基对,编码GDP-D-甘露糖4,6-脱水酶,338个氨基酸;
tiaS2位于基因簇核苷酸序列第9742-8534个碱基处,长度为1209个碱基对,编码C-甲基转移酶,402个氨基酸;
tiaS3位于基因簇核苷酸序列第10785-9787个碱基处,长度为999个碱基对,编码GDP-甘露糖4,6-脱水酶,332个氨基酸;
tiaS4位于基因簇核苷酸序列第21789-22820个碱基处,长度为1032个碱基对,编码GDP-甘露糖4,6-脱水酶,343个氨基酸;
tiaS5位于基因簇核苷酸序列第33022-34347个碱基处,长度为1326个碱基对,编码糖O-甲基转移酶,441个氨基酸;
tiaS6位于基因簇核苷酸序列第38882-40021个碱基处,长度为1140个碱基对,编码O-酰基转移酶,379个氨基酸;
tiaG1位于基因簇核苷酸序列第7441-6044个碱基处,长度为1398个碱基对,编码糖基转移酶,465个氨基酸;
tiaG2位于基因簇核苷酸序列第20351-21772个碱基处,长度为1422个碱基对,编码糖基转移酶,473个氨基酸;
3)2,4-二羟基-3,5-二氯-6-乙基苯甲酸合成酶基因,即tiaE、tiaF、tiaB、tiaM共4个基因:
tiaE位于基因簇核苷酸序列第14006-13260个碱基处,长度为747个碱基对,编码II型硫酯酶,248个氨基酸;
tiaF位于基因簇核苷酸序列第14189-15220个碱基处,长度为1032个碱基对,编码酰基载体蛋白合成酶/缩合酶,343个氨基酸;
tiaB位于基因簇核苷酸序列第15220-20349个碱基处,长度为5130个碱基对,编码可重复利用的聚酮合成酶,1709个氨基酸;
tiaM位于基因簇核苷酸序列第37305-38789个碱基处,长度为1485个碱基对,编码卤化酶,494个氨基酸;
4)异丁酰基合成基因,即tiaC、tiaD共2个基因:
tiaC位于基因簇核苷酸序列第11219-12280个碱基处,长度为1062个碱基对,编码支链α酮酸脱氢酶的E1α亚单元,353个氨基酸;
tiaD位于基因簇核苷酸序列第12277-13254个碱基处,长度为978个碱基对,编码支链α酮酸脱氢酶的E1β亚单元,325个氨基酸;
5)甲基丙二酰辅酶A和乙基丙二酰辅酶A合成基因,即tiaJ、tiaK、tiaL、tiaN共4个基因:
tiaJ位于基因簇核苷酸序列第27166-28398个碱基处,长度为1233个碱基对,编码3-羟乙酰基-辅酶A脱氢酶,410个氨基酸;
tiaK位于基因簇核苷酸序列第28395-29759个碱基处,长度为1368个碱基对,编码巴豆酰基-辅酶A还原酶/羧化酶,454个氨基酸;
tiaL位于基因簇核苷酸序列第29770-31200个碱基处,长度为1431个碱基对,编码丙酰-辅酶A羧化酶,476个氨基酸;
tiaN位于基因簇核苷酸序列第82097-83296个碱基处,长度为1200个碱基对,编码烯酰-辅酶A水合酶/异构酶,399个氨基酸;
6)环骨架后修饰基因,即tiaP1、tiaP2,共2个基因:
tiaP1位于基因簇核苷酸序列第32479-31301个碱基处,长度为1179个碱基对,编码细胞色素P-450氧化酶,392个氨基酸;
tiaP2位于基因簇核苷酸序列第41304-40105个碱基处,长度为1200个碱基对,编码细胞色素P-450氧化酶,399个氨基酸;
7)调节、抗性和未知功能基因,即tiaI、tiaR1、tiaR2、tiaT1、tiaT2、tiaT3、tiaT4共7个基因:
tiaI位于基因簇核苷酸序列第26853-24502个碱基处,长度为2352个碱基对,编码ATP-依赖的DNA解螺旋酶,783个氨基酸;
tiaR1位于基因簇核苷酸序列第34415-37186个碱基处,长度为2772个碱基对,编码LuxR家族转录调节因子,923个氨基酸;
tiaR2位于基因簇核苷酸序列第88114-88527个碱基处,长度为414个碱基对,编码TetR家族转录调节因子,137个氨基酸;
tiaT1位于基因簇核苷酸序列第24505-22880个碱基处,长度为1626个碱基对,编码膜转运蛋白,541个氨基酸;
tiaT2位于基因簇核苷酸序列第83304-84590个碱基处,长度为1287个碱基对,编码膜转运蛋白,428个氨基酸;
tiaT3位于基因簇核苷酸序列第85955-84642个碱基处,长度为1314个碱基对,编码NitT/TauT家族ABC转运蛋白,437个氨基酸;
tiaT4位于基因簇核苷酸序列第87757-86003个碱基处,长度为1755个碱基对,编码NitT/TauT家族ABC转运蛋白,584个氨基酸。
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