[发明专利]塔式蚯蚓生态滤池复合填料微生物群落结构分析方法无效
申请号: | 201010608614.X | 申请日: | 2010-12-28 |
公开(公告)号: | CN102559857A | 公开(公告)日: | 2012-07-11 |
发明(设计)人: | 郭飞宏;郭敏;汪龙眠;王正芳;罗艳 | 申请(专利权)人: | 郭飞宏 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;G01N27/447 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 210046 江苏省南京市南京仙*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 塔式 蚯蚓 生态 滤池 复合 填料 微生物 群落 结构 分析 方法 | ||
1.一种塔式蚯蚓生态滤池复合填料微生物群落结构分析方法,其特征在于,具体步骤如下:
①分别在塔式蚯蚓生态滤池不同填料层取多种填料进行预处理;
②利用DNA提取试剂盒提取基因组总DNA;
③利用16S rDNAV3区引物对样品DNA进行巢式PCR扩增;
④利用变性梯度凝胶电泳即DGGE技术分析PCR扩增产物,得到的DGGE图谱利用Quantity one软件分析;
⑤特征DGGE条带切割回收,样品DNA再次PCR后测序分析,判定微生物种类。
2.根据权利要求1所述塔式蚯蚓生态滤池复合填料微生物群落结构分析方法,其特征为步骤①中所述多种填料预处理,包括塔式一级蚯蚓生态滤池、塔式二级蚯蚓生态滤池和塔式三级蚯蚓生态滤池中的土壤、砂石和碎青石填料。填料先经过-80℃的冷冻干燥然后研磨、最后100目过塞。
3.根据权利要求1所述塔式蚯蚓生态滤池复合填料微生物群落结构分析方法,其特征为步骤②中所述的DNA提取试剂盒,具体为MOBIO公司的Ultra Clean Soil DNA isolation KIT试剂盒,包括Bead SolutionTubes、2ml Collection Tubes、Spin Filter Units in 2ml Tubes、IRS solution、Solution S1、Solution S2、SolutionS3、Solution S4、Solution S5。
4.根据权利要求1所述塔式蚯蚓生态滤池复合填料微生物群落结构分析方法,其特征为步骤③中所述的16S rDNAV3区引物,设计的引物为63F和1387R(一次PCR);338F-GC和518R(二次PCR)。一次PCR扩增条件为预变性94℃5min,然后94℃变性45s,55℃退火1min,72℃延伸45s共30个循环,最后在72℃下延伸10min。二次PCR扩增条件为预变性95℃10min,然后95℃变性1min,63℃退火2min,72℃延伸1min共30个循环,最后在72℃下延伸10min。
5.根据权利要求1所述塔式蚯蚓生态滤池复合填料微生物群落结构分析方法,其特征为步骤④中利用DGGE分析所述PCR扩增产物的条件为:制备变性剂尿素浓度梯度50%-75%,丙烯酰胺凝胶浓度为10%的变性梯度凝胶电泳(DGGE),电泳电压90V,电泳时间12h,二溴乙锭染色15min,脱色25min。
6.根据权利要求1所述塔式蚯蚓生态滤池复合填料微生物群落结构分析方法,其特征为步骤⑤中特征条带回收DNA再次PCR,PCR引物为338F和518R,扩增条件:预变性94℃10min,然后94℃变性1min,62℃退火2min,72℃延伸1min共30个循环,最后在72℃下延伸10min。
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