[发明专利]去除逆转录和扩增反应中的核酸污染的方法有效
申请号: | 201080033460.4 | 申请日: | 2010-07-21 |
公开(公告)号: | CN102510904A | 公开(公告)日: | 2012-06-20 |
发明(设计)人: | 莫顿·艾尔得;欧拉乌·莱尼斯;达格·如尼·耶莱斯维克 | 申请(专利权)人: | 生物科技医药公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N9/22 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人: | 王达佐;洪欣 |
地址: | 挪威特*** | 国省代码: | 挪威;NO |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 去除 逆转录 扩增 反应 中的 核酸 污染 方法 | ||
1.从逆转录反应去除核酸污染的方法,其包括使用这样的DNase,该DNase通过在约50℃的温度加热5分钟会基本不可逆地失活并且基本对双链DNA是特异的。
2.从热启动PCR去除核酸污染的方法,其中所述反应是隔离热启动PCR装置和/或涉及热启动DNA聚合酶,所述方法包括使用这样的DNase,该DNase通过在约50℃的温度加热5分钟会基本不可逆地失活并且基本对双链DNA是特异的。
3.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中将逆转录反应混合物、热启动PCR装置、热启动PCR混合物或以上的任一种单独的组分在允许消化任何污染的双链DNA的条件下与DNase接触,以及此后将所述反应混合物加热以使所述DNase失活。
4.体外逆转录靶核酸的方法,其中所述方法包括在真正的逆转录反应开始之前,用DNase处理逆转录反应混合物的步骤,所述DNase通过在约50℃的温度加热5分钟会基本不可逆地失活并且基本对双链DNA是特异的。
5.如权利要求3或4所述的方法,其中所述逆转录反应混合物是完整的混合物,并且在逆转录酶的工作温度加热以使所述DNase失活。
6.如权利要求4或5所述的方法,所述方法包括一个或多个包含以下步骤中的一步或多步的循环:
(i)引物退火
(ii)从引发的多核苷酸的链延伸
(iii)多核苷酸双螺旋解链。
7.如权利要求1和3至6中任一项所述的方法,其中所述逆转录反应之后为核酸扩增反应。
8.如权利要求7所述的方法,其中所述核酸扩增反应是PCR、LCR、SDA、3SR或LAMP,优选PCR。
9.如权利要求7或8所述的方法,其中所述逆转录反应和所述扩增反应在一个反应容器中进行。
10.热启动PCR的方法,其中所述反应是隔离热启动PCR装置和/或涉及热启动DNA聚合酶,其中所述方法包括在热启动PCR开始之前,用DNase处理热启动PCR装置/混合物或热启动DNA聚合酶的步骤,所述DNase通过在约50℃的温度加热5分钟会基本不可逆地失活并且基本对双链DNA是特异的。
11.如权利要求8至10中任一项所述的方法,所述方法还包括多个包含以下步骤中的一步或多步的循环:
(i)多核苷酸双螺旋解链
(ii)引物退火
(iii)从引发的多核苷酸的链延伸。
12.DNase,其通过在约50℃的温度加热5分钟会基本不可逆地失活并且基本对双链DNA是特异的。
13.DNase或其酶活性片段,所述DNase具有SEQ ID No.1的序列或具有与SEQ ID No.1至少60%同一性的序列,但是其中SEQ ID No 1的第237位的脯氨酸残基或其它序列中的等同脯氨酸已被修饰、缺失或取代,所述DNase或其酶活性片段通过在约50℃的温度加热5分钟会基本不可逆地失活并且基本对双链DNA是特异的。
14.如权利要求13所述的DNase或其酶活性片段,其中所述DNase具有SEQ ID No.5的序列或具有与SEQ ID No.5至少60%同一性的序列,但是其中SEQ ID No 5的第214位的脯氨酸残基或其它序列中的等同脯氨酸已被修饰、缺失或取代,所述DNase或其酶活性片段通过在约50℃的温度加热5分钟会基本不可逆地失活并且基本对双链DNA是特异的。
15.如权利要求13或14所述的DNase或其酶活性片段,其中所述DNase具有获自来自节肢动物门的物种的DNase的序列,但是其中与SEQ ID No 1的第237位的脯氨酸等同的脯氨酸残基已被修饰、缺失或取代。
16.如权利要求15所述的DNase或其酶活性片段,其中所述DNase具有获自选自以下亚门的物种的DNase的序列:甲壳亚门、六足亚门、螯肢亚门或多足亚门,但是其中与SEQ ID No 1的第237位的脯氨酸等同的脯氨酸残基已被修饰、缺失或取代。
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