[发明专利]用于定量生物样品中DNA的改良方法无效
申请号: | 201080033479.9 | 申请日: | 2010-06-18 |
公开(公告)号: | CN102482697A | 公开(公告)日: | 2012-05-30 |
发明(设计)人: | H.哈特 | 申请(专利权)人: | 先正达参股股份有限公司 |
主分类号: | C12P19/34 | 分类号: | C12P19/34;A61K31/70;C07H21/02 |
代理公司: | 北京市柳沈律师事务所 11105 | 代理人: | 张文辉 |
地址: | 瑞士*** | 国省代码: | 瑞士;CH |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 定量 生物 样品 dna 改良 方法 | ||
1.一种定量包含玉米核酸的生物样品中事件Bt11DNA的方法,该方法包括:
(a)使所述生物样品与包含由SEQ ID NO:1组成的第一引物和由SEQID NO:2组成的第二引物的第一对引物和包含SEQ ID NO:3的荧光染料标记探针接触,其中在具有来自事件Bt11玉米的基因组DNA的核酸扩增反应中使用时,所述第一对引物产生包含SEQ ID NO:4的第一扩增子并且其中所述第一扩增子用于确定事件Bt11;
(b)使所述生物样品与包含由SEQ ID NO:5组成的第一引物和由SEQID NO:6组成的第二引物的第二对引物和包含SEQ ID NO:7的第二荧光染料标记探针接触,其中在具有玉米基因组DNA的核酸扩增反应中使用时,所述第二对引物产生包含SEQ ID NO:8的第二扩增子,并且其中所述第二扩增子指示玉米adh1基因的存在;
(c)提供能够进行定量实时PCR的核酸扩增反应条件和PCR仪;
(d)使用(a)和(b)的引物和探针进行定量实时PCR,因而产生所述的第一扩增子和所述的第二扩增子;
(e)当所述第一扩增子和所述第二扩增子由所述PCR仪产生时,同时检测它们;并且
(f)与所述第二扩增子比较计算所述第一扩增子的相对量,因而所述第一扩增子的量指示Bt11DNA在所述生物样品中的量。
2.权利要求1所述的方法,其中所述方法具有小于或等于0.08%Bt11DNA浓度的定量限(LOQ)。
3.权利要求1所述的方法,其中所述方法具有小于或等于0.04%Bt11DNA浓度的检测限(LOD)。
4.权利要求1所述的方法,其中所述方法具有至少0.99的平均线性系数(R2)。
5.权利要求1所述的方法,其中所述方法在0.090%的Bt11DNA浓度具有24%或更小的相对重现性标准偏差(RSDR)。
6.权利要求1所述的方法,其中所述方法在0.090%的Bt11DNA浓度具有17%或更小的相对重复性标准偏差(RSDr)。
7.权利要求1所述的方法,其中所述方法在整个动态范围内具有±5%或更小的真实值。
8.包含由SEQ ID NO:1组成的第一引物和由SEQ ID NO:2组成的第二引物的一对引物,所述引物对在生物样品中存在玉米事件Bt11DNA模板的情况下一起发挥作用以产生用于确定玉米事件Bt11的扩增子。
9.一种由SEQ ID NO:3组成的多核苷酸探针。
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