[发明专利]使用阵列比较基因组杂交技术分析核酸突变的方法

权利要求书

1.一种使用阵列比较基因组杂交技术来分析核酸突变的方法，其包括：

步骤(a)：使用n组相同的探针核酸组，其中多个样点存在于一个核酸微阵列上并且彼此不同的探针核酸已经被固定在多个所述样点上，使n种标记的样品核酸S1至Sn逐个地与n组所述探针核酸组接触以实现杂交，

步骤(b)：选择已经固定有相同探针核酸的n个样点X1至Xn，所述样点X1至Xn选自n组所述探针核酸组，并且获得已经被杂交到n个相应的样点X1至Xn中的样品核酸的标记强度F1至Fn，

步骤(c)：将所述样点X1的标记值F1与所述标记值F2至Fn中的每个比较，由此获得n-1个比较值C2至Cn，并且确定所述比较值中的每个是否落入指定的数值范围内，以及

步骤(d)：确定在n-1个所述比较值中在所述步骤(c)中已经确定为未落入所述指定的数值范围内的比较值的数目是否超过指定数目，并且在超过所述指定数目的情况下，判断所述样点X1为阳性，

n是3以上的整数，所述样品核酸是分析物核酸或标准核酸，至少S1是分析物核酸，而X1是已经与S1接触的样点。

2.根据权利要求1的分析核酸突变的方法，其中在n种所述样品核酸中至少两种是分析物核酸。

3.根据权利要求1或2的分析核酸突变的方法，所述方法进一步包括：

步骤(c′)：确定从F2与F1的比较值至F2与Fn的比较值的n-1个比较值中的每个是否落入指定的数值范围，以及

步骤(d′)：确定n-1个比较值中在所述步骤(c′)中已经确定为未落入所述指定的数值范围内的比较值的数目是否超过所述指定数目，并且在超过所述指定数目的情况下，判断样点X2为阳性，样点X2是已经与不同于以上S1的样品核酸S2接触的样点。

4.根据权利要求1至3中任一项的分析核酸突变的方法，其中在n种所述样品核酸中至少一种是标准核酸。

5.根据权利要求1至3中任一项的分析核酸突变的方法，其中n种所述样品核酸都是分析物核酸。

6.根据权利要求1至5中任一项的分析核酸突变的方法，其中n种所述样品核酸是来源于属于分类学上相同物种的不同个体的核酸。

7.根据权利要求1至6中任一项的分析核酸突变的方法，其中

提供n个相同的探针核酸组NS1至NSn，

各探针核酸组NSi被提供在具有p个样点t_i1至t_ip的核酸微阵列上，i是整数并且满足1≤i≤n而p是整数并且满足2≤p，

将彼此不同的探针核酸固定在各探针核酸组NSi的p个所述样点t_i1至t_ip上，

各探针核酸组NSi的p个所述样点中的一个是样点Xi，

将相同的探针核酸固定到样点t_ij至t_nj上，j是整数并且满足1≤j≤p，

步骤(a)包括使所述标记的样品核酸Si与所述探针核酸组NSi接触，从而将所述样品核酸Si杂交到已经固定在所述探针核酸组NSi的p个所述样点上的核酸，

步骤(b)包括获得已经杂交到各探针核酸组NSi的所述样点t_i1至t_ip中的样品核酸的标记值F_i1至F_ip，

NS1和NSm选自所述探针核酸组NS1至NSn并且m是整数并且满足2≤m≤n，

所述步骤(c)包括以下步骤：

(c1)比较所述标记值F1j和Fmj以确定p个比较值C1″至Cp″，

(c2)计算所述比较值C1″至Cp″的平均值或中央值，以及

(c3)基于在所述步骤(c2)中获得的平均值或中央值，设定指定的数值范围并且判断所述比较值C1″至Cp″是否落入所述指定的数值范围内。

8.根据权利要求1至7中任一项的分析核酸突变的方法，其中所述样品核酸都用相同的标记物标记。

9.根据权利要求1至8中任一项的分析核酸突变的方法，其中步骤(b)中的所述标记强度F1至Fn是校正值。