[发明专利]用于检测染色体非整倍性的方法

权利要求书

1.用于检测孕妇怀有的胎儿中的染色体非整倍性的方法，所述方法包括下述步骤：

(a)测定取自所述孕妇的生物样品中胎儿来源的甲基化标志物的量，其中所述甲基化标志物位于与所述染色体非整倍性相关的染色体上或位于与所述染色体非整倍性相关的染色体的区段内，并且其中所述胎儿来源的甲基化标志物由于DNA差别甲基化而与其母体来源的对应物相区分；

(b)测定所述样品中胎儿来源的遗传标志物的量，其中所述遗传标志物位于参照染色体上，并且其中所述胎儿来源的遗传标志物由于多核苷酸序列的差别而与所述样品中其母体来源的对应物相区分，或所述遗传标志物不存在于母体基因组；

(c)测定来自(a)和(b)的所述量的比率；以及

(d)将所述比率与标准对照进行比较，其中所述比率高于或低于所述标准对照指示所述胎儿中存在所述染色体非整倍性。

2.如权利要求1所述的方法，其中所述胎儿来源的甲基化标志物来自胎盘。

3.如权利要求1所述的方法，其中所述母体来源的对应物来自所述孕妇的血细胞。

4.如权利要求1所述的方法，其中所述胎儿来源的甲基化标志物比其母体来源的对应物甲基化程度高。

5.如权利要求1所述的方法，其中所述胎儿来源的甲基化标志物比其母体来源的对应物甲基化程度低。

6.如权利要求1所述的方法，其中所述样品为母体全血、血清、血浆、尿液、羊水、生殖道灌洗液、胎盘组织样品、绒毛膜样品、或含有分离自母体血液的胎儿细胞的样品。

7.如权利要求1所述的方法，其中所述样品含有胎儿核酸。

8.如权利要求1所述的方法，其中所述甲基化标志物为全羧化酶合成酶(HLCS)基因的一部分或邻近全羧化酶合成酶(HLCS)基因。

9.如权利要求8所述的方法，其中所述甲基化标志物为所述HLCS基因的推定启动子。

10.如权利要求1所述的方法，其中所述甲基化标志物为标志物18A或标志物13A。

11.如权利要求1所述的方法，其中步骤(a)包括用差别修饰甲基化和非甲基化DNA的试剂处理所述样品。

12.如权利要求11所述的方法，其中所述试剂包括亚硫酸氢盐或者基于甲基化状态结合DNA的蛋白质或化学品。

13.如权利要求11所述的方法，其中所述试剂包括优先切割甲基化DNA的酶。

14.如权利要求11所述的方法，其中所述试剂包括优先切割非甲基化DNA的酶。

15.如权利要求1所述的方法，其中所述遗传标志物不存在于所述母体基因组中。

16.如权利要求15所述的方法，其中所述遗传标志物位于Y染色体上。

17.如权利要求1所述的方法，其中所述胎儿来源的遗传标志物由于遗传多态性与所述母体来源的遗传标志物相区分。

18.如权利要求17所述的方法，其中所述多态性包括单核苷酸多态性(SNP)、简单串联重复多态性、或插入-缺失多态性。

19.如权利要求1所述的方法，其中所述遗传标志物为锌指蛋白Y连锁(ZFY)基因。

20.如权利要求1所述的方法，其中所述遗传标志物包括TMED8基因中的SNP rs6636。

21.如权利要求1所述的方法，其中使用多于一种甲基化标志物或遗传标志物。

22.如权利要求1所述的方法，其中步骤(a)或(b)包括扩增所述甲基化标志物或遗传标志物。

23.如权利要求22所述的方法，其中所述扩增是通过聚合酶链式反应(PCR)。

24.如权利要求23所述的方法，其中所述PCR为甲基化特异性PCR。

25.如权利要求22所述的方法，其中所述扩增为核酸序列特异性扩增。

26.如权利要求1所述的方法，其中步骤(a)或(b)通过分子计数进行。