[发明专利]癌症的分类

权利要求书

1.一种将患者的癌症鉴定为属于癌症模块的方法，包括：

a.审视从所述患者取得的生物样本中一个或多个癌症模块的一个或多个基因成员的表达，所述一个或多个癌症模块选自：

i.表1-6的膀胱癌模块1–6中的一个或多个;

ii.表7-21的脑癌模块1–15中的一个或多个;

iii.表22-46的乳腺癌模块1–25中的一个或多个；

iv.表47-56的结肠癌模块1–10中的一个或多个;

v.表57-73的白血球过多症模块1–17中的一个或多个;

vi.表74-83的肝癌模块1–10中的一个或多个;

vii.表84-99的肺癌模块1–16中的一个或多个;

viii.表100-109的淋巴瘤模块1–10中的一个或多个;

ix.表110-116的黑素瘤模块1–7中的一个或多个;

x.表117-121的骨髓瘤模块1–5中的一个或多个;

xi.表122-131的卵巢癌模块1–10中的一个或多个;

xii.表132-136的胰腺癌模块1–5中的一个或多个;

xiii.表137-147的前列腺癌模块1–11中的一个或多个;

xiv.表148-152的肾癌模块1–5中的一个或多个;以及

xv.表153-161的肉瘤模块1–9中的一个或多个；以及

b.将患者的癌症鉴定为属于癌症模块，所述癌症模块具有与在所述生物样本中审视到的所述一个或多个基因成员的表达一致的基因表达模式。

2.一种用于预测癌症患者群体中药物反应性的方法，包括：

a.审视从训练组患者中取得的生物样本中一个或多个癌症模块的一个或多个基因成员的表达，所述一个或多个癌症模块选自：

i.表1-6的膀胱癌模块1–6中的一个或多个;

ii.表7-21的脑癌模块1–15中的一个或多个;

iii.表22-46的乳腺癌模块1–25中的一个或多个;

iv.表47-56的结肠癌模块1–10中的一个或多个;

v.表57-73的白血球过多症模块1–17中的一个或多个;

vi.表74-83的肝癌模块1–10中的一个或多个;

vii.表84-99的肺癌模块1–16中的一个或多个;

viii.表100-109的淋巴瘤模块1–10中的一个或多个;

ix.表110-116的黑素瘤模块1–7中的一个或多个;

x.表117-121的骨髓瘤模块1–5中的一个或多个;

xi.表122-131的卵巢癌模块1–10中的一个或多个;

xii.表132-136的胰腺癌模块1–5中的一个或多个;

xiii.表137-147的前列腺癌模块1–11中的一个或多个;

xiv.表148-152的肾癌模块1–5中的一个或多个;以及

xv.表153-161的肉瘤模块1–9中的一个或多个；以及

b.将每个训练患者的癌症鉴定为属于癌症模块，所述癌症模块具有与在所述患者生物样本中审视到的所述一个或多个基因的表达一致的基因表达模式；

c.将每个训练患者的癌症对测试药物的反应鉴定为对所述药物反应或不反应；

d.将一个或多个癌症模块鉴定为与训练患者对所述药物的反应性相一致；

e.将一个或多个癌症模块鉴定为与训练患者对所述药物的不反应性相一致；

f.将表达经鉴定与步骤d中训练患者反应性一致的癌症模块中的一个或多个基因成员的试验患者预测为对所述药物反应；和/或

g.将表达经鉴定与步骤e中训练患者不反应性一致的癌症模块中的一个或多个基因成员的试验患者预测为对所述药物不反应。