[发明专利]用于检测津优35号黄瓜杂交种子纯度的引物序列及检测方法无效
申请号: | 201110033318.6 | 申请日: | 2011-01-31 |
公开(公告)号: | CN102168135A | 公开(公告)日: | 2011-08-31 |
发明(设计)人: | 张桂华;杜胜利;王全;崔兴华;李鹏宇;李加旺;韩毅科;魏爱民;刘楠 | 申请(专利权)人: | 天津科润农业科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 天津市北洋有限责任专利代理事务所 12201 | 代理人: | 陆艺 |
地址: | 300475 天津*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 35 黄瓜 杂交 种子 纯度 引物 序列 方法 | ||
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体地涉及一种用于检测津优35号黄瓜杂交种子纯度的引物序列及检测方法。
背景技术
种子纯度鉴定是保证种子质量的关键环节。随着育种进程的加快,黄瓜新品种数量不断增加,需要进行品种纯度鉴定的材料量将会越来越大。以往常规的纯度鉴定都是在田间进行,结瓜期由专家到田间观察品种的特征特性及一致性,存在周期长、工作量大、易受环境因素的影响、表型特征会有一定程度偏差等问题,可能影响品种纯度鉴定的准确性,并直接影响到到良种的推广;此外由于鉴定周期长,当年生产的种子往往要到次年才能销售,造成商机丧失。
分子标记技术的诞生,为种子纯度的分子鉴定奠定了技术基础。分子标记可以直接以DNA的形式表现,在生物体的各个组织、各个发育阶段均可检测到,不受季节、环境限制,不存在表达与否等问题。尤其是微卫星(SSR)技术,微卫星DNA数量多且均匀分布在基因组中,具有丰富的多态性,并且微卫星位点检测可以显示纯合子和杂合子,易检测、重复性好、省时,适合于大通量分析。目前黄瓜种子纯度的SSR鉴定方法尚未见报道。
发明内容
本发明的目的是提供一种用于检测津优35号黄瓜杂交种子纯度的引物序列。
本发明的另一个目的是克服现有技术的不足,提供一种能快速地检测津优35号黄瓜杂交种子纯度的方法。
本发明的技术方案概述如下:
用于检测津优35号黄瓜杂交种子纯度的引物序列,它由上游引物和下游引物组成,所述上游引物是序列表中SEQ ID NO.1所述的核苷酸序列,所述下游引物是序列表中SEQ ID NO.2所述的核苷酸序列。
检测津优35号黄瓜杂交种子纯度的方法,包括如下步骤:
(1)提取津优35号黄瓜杂交种子基因组DNA;
(2)进行PCR扩增:在PCR扩增专用薄壁管中加入津优35号黄瓜杂交种子基因组DNA10~20ng,再加入序列表中SEQ ID NO.1所述的核苷酸序列15~30ng、序列表中SEQ ID NO.2所述的核苷酸序列15~30ng、1倍的含Mg2+的PCR缓冲液、dNTP 2mmol、Taq DNA聚合酶0.5~1单位,加无菌重蒸馏水至10μl;将PCR扩增专用薄壁管放入PCR仪中扩增,扩增条件为:94℃预变性180秒;94℃变性30秒,50-55℃退火30秒,72℃延伸60秒,30个循环;再72℃延伸7min,扩增完成;
(3)PCR扩增产物的凝胶电泳分析:将扩增产物采用6%变性聚丙烯酰胺凝胶进行电泳分离;在扩增产物中加入变性凝胶上样缓冲液,上样于经30分钟预电泳的变性聚丙烯胺凝胶上,70W恒功率电泳至溴酚兰刚刚到达凝胶的另一端,凝胶经硝酸银染色后在可见光下观察、照相;
(4)依据被鉴定样品在凝胶上条带的相对位置,检测津优35号黄瓜杂交种子纯度。
本发明具有快速、简便、稳定、可靠、低成本、不受环境条件影响等优点,对津优35号黄瓜杂交种子纯度进行鉴定只需要5-6小时就可以完成一个批次的鉴定。节省了大量人力、地力,鉴定结果快速准确。在黄瓜种子纯度鉴定上具有很大的应用价值。
附图说明
图1为津优35号黄瓜PCR扩增产物的凝胶电泳图.
具体实施方式
下面结合附图及具体实施例对本发明作进一步的说明,下面的实施例可以使本专业技术人员更全面地理解本发明,但不以任何方式限制本发明。
实施例1
检测津优35号黄瓜杂交种子纯度的方法,包括如下步骤:
(1)提取津优35号黄瓜杂交种子发芽35小时后根尖的基因组DNA;
(2)进行PCR扩增:在PCR扩增专用薄壁管中加入津优35号黄瓜杂交种子基因组DNA10ng,再加入序列表中SEQ ID NO.1所述的核苷酸序列15ng、序列表中SEQ ID NO.2所述的核苷酸序列15ng、1倍的含Mg2+的PCR缓冲液、dNTP 2mmol、Taq DNA聚合酶0.5单位,加无菌重蒸馏水至10μl;将PCR扩增专用薄壁管放入PCR仪中扩增,扩增条件为:94℃预变性180秒;94℃变性30秒,50℃退火30秒,72℃延伸60秒,30个循环;再72℃延伸7min,扩增完成;
(3)PCR扩增产物的凝胶电泳分析:将扩增产物采用6%变性聚丙烯酰胺凝胶进行电泳分离;在扩增产物中加入变性凝胶上样缓冲液,上样于经30分钟预电泳的变性聚丙烯胺凝胶上,70W恒功率电泳至溴酚兰刚刚到达凝胶的另一端,凝胶经硝酸银染色后在可见光下观察、照相;
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