[发明专利]NAT2基因扩增用引物对、含有其的NAT2基因扩增用试剂及其用途无效
申请号: | 201110034647.2 | 申请日: | 2007-11-30 |
公开(公告)号: | CN102154274A | 公开(公告)日: | 2011-08-17 |
发明(设计)人: | 平井光春;间岛智史 | 申请(专利权)人: | 爱科来株式会社 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 北京林达刘知识产权代理事务所(普通合伙) 11277 | 代理人: | 刘新宇;李茂家 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | nat2 基因 扩增 引物 含有 试剂 及其 用途 | ||
1.一种探针,其特征在于,其为用于检测NAT2基因的多态性的探针,
其由下述(1)的寡核苷酸构成,
(1)与序列号1中的、以第1056位的鸟嘌呤碱基(G)作为第1碱基朝向3’方向至第13~19个碱基的区域互补的至少一个寡核苷酸,该寡核苷酸以与上述鸟嘌呤碱基(G)互补的胞嘧啶碱基为3’末端。
2.根据权利要求1所述的探针,所述寡核苷酸(1)为序列号87~92和116~123中任一个寡核苷酸。
3.根据权利要求2所述的探针,所述寡核苷酸(1)为选自由序列号90的寡核苷酸、序列号91的寡核苷酸、序列号118的寡核苷酸以及序列号122的寡核苷酸组成组中的至少一个寡核苷酸。
4.根据权利要求1所述的探针,所述探针为荧光标记探针。
5.一种试剂,其特征在于,其为用于检测NAT2基因的多态性的试剂,其含有权利要求1所述的探针。
6.根据权利要求5所述的试剂,其还包含由下述(2)的寡核苷酸构成的探针和由下述(3)的寡核苷酸构成的探针,
(2)与序列号1中的、以第1302位的胞嘧啶碱基(C)作为第1碱基朝向5’方向至第18~27个碱基的区域序列相同的至少一个寡核苷酸,该寡核苷酸以上述胞嘧啶碱基为5’末端,
(3)与序列号1中的、以第1583位的胞嘧啶碱基(C)作为第1碱基朝向5’方向至第16~21个碱基的区域序列相同的至少一个寡核苷酸,该寡核苷酸以上述胞嘧啶碱基为3’末端。
7.根据权利要求6所述的探针,所述(2)的寡核苷酸为序列号93~102中任一个寡核苷酸,所述(3)的寡核苷酸为序列号103~108中任一个寡核苷酸。
8.根据权利要求7所述的探针,所述(2)的寡核苷酸为由序列号99的碱基序列构成的寡核苷酸;所述(3)的寡核苷酸为选自由序列号105的碱基序列构成的寡核苷酸、以及由序列号107的碱基序列构成的寡核苷酸中的至少一个寡核苷酸。
9.根据权利要求5所述的试剂,所述探针为荧光标记探针。
10.一种多态性解析方法,其特征在于,其为解析NAT2基因的检测对象位点的多态性的方法,包括下述(i)~(iv)工序:
(i)以试样中的核酸为模板,在反应液中扩增NAT2基因中含有检测对象位点的区域的工序,
(ii)准备含有上述(i)工序的扩增产物和权利要求1所述的探针的反应液的工序,
(iii)改变所述反应液的温度,测定所述扩增产物与所述试剂中的探针的杂交产物显示融解状态的信号值的工序,
(iv)由伴随温度变化的所述信号值的变动,确定所述检测对象位点的多态性的工序。
11.根据权利要求10所述的多态性解析方法,其中,在所述(i)工序中,在扩增反应之前,向所述反应液中添加权利要求1所述的探针。
12.根据权利要求10所述的多态性解析方法,所述试样为生物体试样。
13.根据权利要求12所述的多态性解析方法,所述生物体试样为全血。
14.根据权利要求10所述的多态性解析方法,在所述(i)工序中,使用下述引物对(1),在反应液中进行所述NAT2的扩增,
引物对(1):
含有包含下述(F1)的寡核苷酸的正向引物和包含下述(R1)的寡核苷酸的反向引物的一对引物对:
(F1):与序列号1的碱基序列中的、以第1038位的鸟嘌呤碱基(G)作为第1碱基朝向5’方向至第20~32个碱基的区域序列相同的至少一个寡核苷酸,该寡核苷酸以上述鸟嘌呤碱基(G)为3’末端,
(R1):与序列号1的碱基序列中的、以第1096位的胞嘧啶碱基(C)作为第1碱基朝向3’方向至第17~24个碱基的区域互补的至少一个寡核苷酸,该寡核苷酸以与上述第1096位的胞嘧啶碱基(C)互补的鸟嘌呤碱基(G)为3’末端。
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