[发明专利]NCSTN突变型基因、其鉴定方法和工具有效
申请号: | 201110035188.X | 申请日: | 2011-01-30 |
公开(公告)号: | CN102618549A | 公开(公告)日: | 2012-08-01 |
发明(设计)人: | 张学军;任韵清;杨森;蒋涛;张青;李瑞强 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因科技有限公司;安徽医科大学第一附属医院 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C12N15/63;C12N5/10;C12N1/15;C12N1/19;C12N1/21;C12Q1/68 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 程泳 |
地址: | 518083 广东省深圳市盐田*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | ncstn 突变型 基因 鉴定 方法 工具 | ||
1.分离的NCSTN的突变型序列,其在NCSTN基因IVS11+1位置上的核苷酸,由鸟苷酸突变为腺苷酸;和/或其在NCSTN基因第3号外显子第19位核苷酸C及其后的G之间存在核苷酸A和G的缺失。
2.权利要求1的突变型序列,其中所述的NCSTN基因第11个内含子序列如SEQ ID NO:1所示;和/或所述的NCSTN基因第3号外显子序列如SEQ ID NO:2所示。
3.重组载体,其含有权利要求1或2所述的突变型序列。
4.重组细胞,其含有权利要求3所述的重组载体。
5.筛选或鉴定NCSTN突变型序列的方法,包括步骤:
1)测定待测样品中NCSTN基因中的内含子和外显子的序列;
2)与野生型相比较,如果存在缺失、替换、插入则认定该基因存在突变;
优选地,在步骤1)中采用SEQ ID NO:3-26中的各对引物分别扩增内含子或外显子序列。
6.筛选或鉴定样品中NCSTN基因突变的方法,包括步骤:
1)测定待测样品中NCSTN基因第11个内含子IVS11+1位置上的序列,和/或NCSTN基因第3号外显子第19位核苷酸C及其后的G之间的序列;
2)NCSTN基因第11个内含子IVS11+1位置上的核苷酸序列为G,则为野生型,核苷酸序列为A,则为突变型;NCSTN基因第3号外显子第19位核苷酸C及其后的G之间的核苷酸序列有AG,则为野生型,没有AG,则为突变型。
7.权利要求6的方法,其中所述的核苷酸序列的测定采用PCR扩增再测序的方法,所述PCR引物对分别为SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示序列;和/或SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示序列。
8.逆向性痤疮相关基因的检测剂,其至少包括根据NCSTN基因所有17条外显子及其外显子-内含子交界区序列设计的PCR引物,所述引物用于PCR扩增,其扩增产物包含NCSTN基因中NCSTN基因IVS11+1位置上的核苷酸序列,和/或NCSTN基因第3号外显子第19位核苷酸C及其后的G之间的核苷酸序列;所述引物例如分别为SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示序列,和/或SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示序列,或选自SEQ ID NO:7~SEQ ID NO:26所示序列中的至少一对。
9.试剂盒,所述试剂盒至少包括:
1)根据NCSTN基因所有17条外显子及其外显子-内含子交界区序列设计的PCR引物,所述引物用于PCR扩增,其扩增产物包含NCSTN基因中NCSTN基因IVS11+1位置上的核苷酸序列,和/或NCSTN基因第3号外显子第19位核苷酸C及其后的G之间的核苷酸序列;所述引物例如为SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示序列,和/或SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示序列,或选自SEQ ID NO:7~SEQ ID NO:26所示序列中的至少1对引物;
2)任选地,包含用于PCR的DNA扩增酶和相应缓冲液。
10.权利要求1-2的序列、选自SEQ ID NO:3-26中的至少一对引物在制备用于鉴定逆向性痤疮相关基因的试剂盒中的用途。
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