[发明专利]用于检测水稻白叶枯病菌的引物、方法以及试剂盒无效
申请号: | 201110035412.5 | 申请日: | 2011-02-01 |
公开(公告)号: | CN102618628A | 公开(公告)日: | 2012-08-01 |
发明(设计)人: | 何晨阳;陈华民;吴茂森;李波 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京瑞恒信达知识产权代理事务所(普通合伙) 11382 | 代理人: | 曹津燕 |
地址: | 100094 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 水稻 白叶枯 病菌 引物 方法 以及 试剂盒 | ||
1.一种用于检测水稻白叶枯病菌菌株GD414的引物,该引物的上游引物核苷酸序列为SEQ ID NO:4,下游引物核苷酸序列为SEQ ID NO:3。
2.一种用于检测水稻白叶枯病菌菌株GD414的方法,该方法包括以下步骤:
(1)挑取待测菌株菌落或提取待测菌株基因组DNA作为PCR扩增模板,采用根据权利要求1所述的引物进行PCR扩增;
(2)对PCR扩增的产物进行琼脂糖凝胶电泳分析。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应体系为20μl反应体系,包括:10×PCR缓冲液2μL,dNTP(各2.5mM)1μL,引物(10μM)各1μL,Taq酶1U,待测菌株基因组DNA 10ng,补ddH2O至反应总体积为20μL。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述方法挑取待测菌株菌落作为PCR扩增模板,PCR扩增的条件为94℃下变性5分钟;94℃下变性30秒,58℃下退火30秒,72℃下延伸1分钟,30-35个循环;72℃延伸10分钟。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述方法提取待测菌株基因组DNA作为PCR扩增模板,PCR扩增的条件为94℃下变性3分钟;94℃下变性30秒,58℃下退火30秒,72℃下延伸1分钟,30-35个循环;72℃延伸10分钟。
6.根据权利要求2至5中任一项所述的方法,其特征在于,所述琼脂糖凝胶的浓度为0.8-2%(g/mL)。
7.根据权利要求2至6中任一项所述的方法,其特征在于,所述琼脂糖凝胶电泳的电压为4-6v/cm。
8.根据权利要求2至6中任一项所述的方法,其特征在于,所述水稻白叶枯病菌菌株GD414的琼脂糖凝胶电泳特异性条带出现在985bp处。
9.一种用于检测水稻白叶枯病菌菌株GD414的试剂盒,该试剂盒包含根据权利要求1所述的引物。
10.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括Taq酶、dNTP和10×PCR缓冲液。
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