[发明专利]一种预测干扰素治疗慢性乙型肝炎疗效的血浆miRNA谱及检测试剂盒有效

专利信息
申请号: 201110041465.8 申请日: 2011-02-21
公开(公告)号: CN102643803A 公开(公告)日: 2012-08-22
发明(设计)人: 袁正宏;张小楠;邬敏;陈良;张继明;张欣欣;张占卿;吴景迪;王介非;陈晓蓉;黄涛 申请(专利权)人: 上海市公共卫生临床中心
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/68
代理公司: 上海元一成知识产权代理事务所(普通合伙) 31268 代理人: 吴桂琴
地址: 201508 上*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 预测 干扰素 治疗 慢性 乙型肝炎 疗效 血浆 mirna 检测 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种预测干扰素治疗慢性乙型肝炎疗效的血浆miRNA谱,其特征在于,该miRNA谱包括SEQ ID NO 1-11中一个或多个miRNA。

2.一种预测干扰素治疗慢性乙型肝炎疗效的试剂盒,其特征在于,该试剂盒含有针对SEQ ID NO 1-11中一个或多个miRNA特异性探针核苷酸。

3.一种预测干扰素治疗慢性乙型肝炎疗效的芯片,其特征在于,该芯片含有针对SEQ ID NO 1-11中一个或多个miRNA特异性探针核苷酸。

4.如权利要求3所述的芯片,其特征在于,该芯片含有针对SEQ ID NO 1-11的miRNA特异性探针核苷酸。

5.一种预测干扰素治疗慢性乙型肝炎疗效的方法,其特征在于,在使用干扰素前,检测血浆、血清样品中SEQ ID NO 1-11中一个或多个miRNA的表达水平,与治疗前ALT水平比较,预测干扰素疗效。

6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述miRNA中至少一种的表达水平高于或者低于已知的标准水平。

7.如权利要求5所述的方法,其特征在于,ALT水平高于或者低于已知的标准水平。

8.如权利要求5所述的方法,其特征在于,该方法包括步骤:(1)血浆、血清样本小RNA的抽提,(2)核酸样本与具有如SEQ ID No.1-11中一个或多个miRNA特异性探针的芯片进行杂交,(3)对杂交信号与对照样本的杂交结果进行比较。

9.如权利要求5所述的方法,其特征在于,利用统计方法分析样品中表达水平与标准水平差异的显著性。

10.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的统计方法包括:(1)miRNA表达谱通过 OneR 方法对每个miRNA评分,(2)支持向量机作为预测引擎进行类别判断,(3)特征值递增分析法和留一法交叉验证优化入选miRNA的数量。

11.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的统计方法使用logistic回归分析结合miRNA SVM 预测模型进行类别判断。

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