[发明专利]一种检测结核分枝杆菌北京基因型的方法无效
申请号: | 201110055475.7 | 申请日: | 2011-03-09 |
公开(公告)号: | CN102154492A | 公开(公告)日: | 2011-08-17 |
发明(设计)人: | 张鹭;王洪海;刘鼎乾;胡鼎;刘岩岩;王文婕;麦俊滔;张敬;徐亦薇 | 申请(专利权)人: | 复旦大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 上海正旦专利代理有限公司 31200 | 代理人: | 陆飞;盛志范 |
地址: | 200433 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 结核 分枝杆菌 北京 基因型 方法 | ||
1.一种检测结核分枝杆菌北京基因型的方法,其特征在于,在结核分枝杆菌Rv2629和Rv0444c的基因片段中, 根据Rv2629(191位)A→C和Rv0444c(242位)G→C同时发生单核苷酸突变,判定待检菌株为北京基因型菌株。
2.如权利要求1所述的检测结核分枝杆菌北京基因型的方法,其特征在于,具体操作步骤为:
根据结核分枝杆菌全基因组Rv2629、Rv0444c基因的序列,设计测序引物,扩增基因片段:
对于Rv2629基因,扩增片段为:SEQ.ID.NO.1; 为468bp ;
设计的测序引物为:
SeUP PRIMER 5' CGACGACTCGCACGACACT 3'
SeDOWN PRIMER 5' CAGTTCATTCGGATGGCTTCTT 3'
对于Rv0444c基因,扩增片段为:SEQ.ID.NO.2;为346bp ;
设计的测序引物为:
SeUP PRIMER 5' AACGACGAAGTTCGAGCCG 3'
SeDOWN PRIMER 5' ACATTGTTCATCACCAGCAGACC 3'
对扩增产物进行纯化,然后用自动序列分析仪进行序列分析;
如果同时检测到Rv2629基因的191位A→C突变和Rv0444c基因242位G→C突变,则确定该结核杆菌分枝为北京基因型分型。
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