[发明专利]一种检测黄牛Dapperl基因单核苷酸多态性的方法无效

专利信息
申请号: 201110062694.8 申请日: 2011-03-18
公开(公告)号: CN102206706A 公开(公告)日: 2011-10-05
发明(设计)人: 陈宏;王辰;王璟;蓝贤勇;张茜茜;赖新生;胡沈荣 申请(专利权)人: 西北农林科技大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 712100 *** 国省代码: 陕西;61
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 黄牛 dapperl 基因 核苷酸 多态性 方法
【权利要求书】:

1.一种检测黄牛Dapper1基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于,以包含Dapper1基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1、P2、P3、P4为引物,PCR扩增黄牛Dapper1基因;用限制性内切酶MspI、HindII、NcoI、HhaI分别消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛Dapper1基因第8344位、第8428位、第10513位、第10765位的单核苷酸多态性,

所述的引物对P1为:

上游引物:gttgactgtt ccccctccac accac

下游引物:gaggaacatt gggctctgca cggcccc;

所述的引物对P2为:

上游引物:gaggagcggc ttggtaacca tgtca

下游引物:cagcgttcac actggtcctc gg;

所述的引物对P3为:

上游引物:tgtgaagcag atacaagggg cagcc

下游引物:gtggcaaagg ttttagcgaa tcc;

所述的引物对P4为:

上游引物:tacccaacat tgatgccttt ttcgc

下游引物:caagacaggg tcagtggtcc aatc。

2.如权利要求1所述的检测黄牛Dapper1基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于,所述的PCR扩增反应程序为:

94℃预变性5min;30~34个循环94℃变性30s,65℃退火30s,72℃延伸30s;72℃延伸10min。

3.如权利要求1所述的检测黄牛Dapper1基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于,所述的琼脂糖凝胶的质量浓度为3.0%。

4.如权利要求1所述的检测黄牛Dapper1基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛Dapper1基因第8344位的单核苷酸多态性为:TT基因型表现为159bp条带;CT基因型表现为159bp、131bp和28bp条带;CC基因型表现为131bp和28bp条带。

5.如权利要求1所述的检测黄牛Dapper1基因单核苷酸多态性的方法,第8428位的单核苷酸多态性为:TT基因型表现为211bp条带;CT基因型表现为211bp、187bp和24bp条带;CC基因型表现为187bp和24bp。

6.如权利要求1所述的检测黄牛Dapper1基因单核苷酸多态性的方法,第10513位的单核苷酸多态性为:GG基因型表现为206bp条带;AG基因型表现为206bp、183bp和23bp条带;AA基因型表现为183bp和23bp。

7.如权利要求1所述的检测黄牛Dapper1基因单核苷酸多态性的方法,第10765位的单核苷酸多态性为:CC基因型表现为242bp条带;CG基因型表现为242bp、219bp和23bp条带;GG基因型表现为219bp和23bp。

8.权利要求1至7中任意一项权利要求所述的检测黄牛Dapper1基因单核苷酸多态性的方法在鉴定不同黄牛群体多态性中的诊断应用。

9.权利要求8所述的诊断应用,其特征在于,鉴定不同黄牛多态性是,黄牛Dapper1基因第8344位和第10513位的SNP作为在黄牛分子育种中辅助选择的分子标记,第8344位的CC基因型以及第10513位的AA基因型为提高黄牛体重和日增重的候选分子遗传标记。

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