[发明专利]一种大肠癌预后预测模型的建立方法

说明书

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体地说，涉及一种以SPARCL1与P53作为标志物的大肠癌预后预测模型的建立方法。

背景技术

大肠癌是一种常见的恶性肿瘤，在我国和西方发达国家其发病率及死亡率均居恶性肿瘤谱前列。2000年到2004年，在美国大肠癌的发病率在所有恶性肿瘤中居第三位，而死亡率亦高居第三位。在我国，随着生活水平的提高和饮食习惯的改变，大肠癌的发病率也日渐增高, 已跃居第4位，每年新发大肠癌病例达40万例，上升速度接近5%，其中很多是30-40岁的中年人。上世纪90 年代与70 年代相比，我国大肠癌的发病率在城市上升了31.95% , 在农村上升了8.51%，死亡率位居恶性肿瘤死亡谱的第4或第5位。可以预见，我国大肠癌的发病率与死亡率在今后很长一段时期内还将继续稳步上升, 成为我国最常见的、发病率上升最快的恶性肿瘤之一。

近年来，随着科学技术的飞速发展，手术治疗、化学治疗、放射治疗等传统治疗手段不断发展，生物靶向治疗新药不断研发，但大肠癌的5年生存率仍然只有63.4% 左右，其改善速度明显跟不上治疗手段的进步。目前判断大肠癌预后的方法，主要还是依靠传统的分期方法，但临床工作中的许多问题，已经是用这些传统的分期方法无法完全解释的：为什么同一分期大肠癌病人的生存情况常存在着较大差异？为什么初诊时Ⅰ期的病人后来却发生了远处转移？因此，极其重要的一点就是寻找到更多的大肠癌预后相关标志物及模型，更准确的预测大肠癌病人预后及对不同治疗的敏感性，寻找干预阻断的靶点，以施行不同的治疗策略，最终实现对病人的个体化治疗。

P53是迄今为止发现的最重要的抑癌基因，定位于人染色体17p13，含有 11个外显子和 10个内含子。分为野生型和突变型两种，野生型P53基因不仅作为抑癌基因发挥负调控作用，还参与转录、DNA损伤与修复、细胞周期凋控、细胞凋亡、细胞增殖及细胞分化等多个过程，具有“分子警察”的功能。突变型P53蛋白不易水解，有较长的半衰期，在恶性肿瘤细胞中堆积，突变型P53蛋白可与野生型P53蛋白结合而使其负调控细胞生长的作用丧失。突变型P53蛋白的过度表达与P53基因突变紧密相关。既往研究P53与影响患者的分期、多药耐药、对化疗或放疗的反应以及术后复发转移等情况相关。

SPARCL1属于介导细胞基质相互作用的粘附分子。SPARCL1最早在1993年Schraml等人在非小细胞肺癌的研究中发现，命名为MAST9。SPARCL1蛋白属于SPARC家族，与SPARC（secreted protein acidic and rich in cysteine）序列有62%的同源性。两者都拥有cysteine rich follistatin-like (FS) 结构域和extracellular calcium binding (EC)结构域，但SPARCL1的N端远较SPARC为长，它也因与SPARC这种在结构上的高度同源性而得名SPARC-like 1。SPARCL1的功能目前尚未完全明确。SPARCL1在非小细胞肺癌、转移性前列腺癌、大肠癌、膀胱癌、胰腺导管癌中表达下调，但在肝癌中表达上调。但SPARCL1在大肠癌中的表达及与大肠癌的预后等临床特征的关系未见明确报道。

生物信息学是一门利用计算机对生命科学研究中的生物信息进行存储、检索和分析的新兴交叉学科。其基本的研究过程为：利用计算机存储核酸或蛋白质信息，研究科学的算法，编制相应的软件对其信息进行分析、比较和预测，从中发现规律。支持向量机（support vector machine, SVM）是Vapnik等1995提出的一种新的分类技术，现已广泛应用于面部识别、基因组学等多个领域。

发明内容

本发明的目的是提供一种大肠癌预后预测模型的建立方法。即是一种通过免疫组化检测、标志物组合及支持向量机分析的联合应用来建立标志物组合模型的方法。该方法通过以下步骤实现：