[发明专利]DNA标签及其在构建和测序配对末端标签文库中的应用有效

专利信息
申请号: 201110071176.2 申请日: 2011-03-24
公开(公告)号: CN102690809A 公开(公告)日: 2012-09-26
发明(设计)人: 程磊 申请(专利权)人: 深圳华大基因科技有限公司;深圳华大基因研究院
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/68;C40B50/06;C40B40/06
代理公司: 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 代理人: 罗菊华
地址: 518083 广东省深圳市盐田*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: dna 标签 及其 构建 配对 末端 文库 中的 应用
【权利要求书】:

1.一组标签,其包含选自SEQ ID NO:1-24的至少2种,优选地至少4种、或至少6种、或至少8种、或至少10种、或至少12种、或至少16种、或至少20种或24种标签;更优选地,其包括至少SEQ ID NO:1和2,或SEQ ID NO:3和4,或SEQ ID NO:5和6,或SEQ ID NO:7和8,或SEQ ID NO:9和10,或SEQ ID NO:11和12,或SEQ ID NO:13和14,或SEQ ID NO:15和16,或SEQ ID NO:17和18,或SEQ ID NO:19和20,或SEQ ID NO:21和22,或SEQ ID NO:23和24所示的标签,或者其任何两个或者多个的组合;优选地,所述标签用于标记帽接头,所述帽接头的两条链的序列分别为SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26。

2.权利要求1的一组标签的用途,其用于制备标签帽接头和/或用于构建和测序配对末端标签文库。

3.权利要求1的一组标签在制备试剂盒中的用途,所述试剂盒用于制备标签帽接头和/或用于构建和测序配对末端标签文库。

4.一种标签帽接头,其具有下式的结构:

5′-ACAGCAG(N)5

5′-phos-(N′)5CTGCTGTAC,或

5′-phos-ACAGCAG(N)5

5′-phos-(N′)5CTGCTGTAC,

其中,(N)5表示选自SEQ ID NO:1-24的标签序列,(N′)5表示所述标签序列的互补序列。

5.权利要求4的标签帽接头的用途,其用于构建和测序配对末端标签文库或者制备试剂盒,所述试剂盒用于构建和测序配对末端标签文库。

6.一种试剂盒,其包含权利要求1的一组标签,或权利要求5的标签帽接头,优选其还包含其他试剂,例如,其两条链的序列分别为SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26的帽接头。

7.权利要求6的试剂盒用于构建和测序配对末端标签文库的用途。

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