[发明专利]用于检测Ⅰ型新德里金属β-内酰胺酶基因的组合物和试剂盒有效
申请号: | 201110077025.8 | 申请日: | 2011-03-30 |
公开(公告)号: | CN102719519A | 公开(公告)日: | 2012-10-10 |
发明(设计)人: | 叶锋;宋玉亮 | 申请(专利权)人: | 北京鑫诺美迪基因检测技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京银龙知识产权代理有限公司 11243 | 代理人: | 钟晶;李昆岐 |
地址: | 100176 北京市北京经济技*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 新德里 金属 内酰胺 基因 组合 试剂盒 | ||
1.用于检测I型新德里金属β-内酰胺酶基因的组合物,其特征在于,所述组合物包括以下序列:
1)长度为10-19个核苷酸的用于PCR扩增I型新德里金属β-内酰胺酶基因的第一引物,该引物的序列包括:
a)SEQ ID No:1所示的序列,
b)SEQ ID No:1所示的序列的至少10个核苷酸连续的片段,或者
c)与a)或b)具有至多5个核苷酸差异的序列;
2)长度为10-18个核苷酸的用于PCR扩增I型新德里金属β-内酰胺酶基因的第二引物,该引物的序列包括:
a)SEQ ID No:2所示的序列,
b)SEQ ID No:2所示的序列的至少10个核苷酸连续的片段,或者
c)与a)或b)具有至多5个核苷酸差异的序列;
3)长度为10-24个核苷酸的与1)和2)所述引物的PCR扩增产物杂交的寡核苷酸探针,该探针的序列包括:
a)SEQ ID No:3所示的序列或其互补序列,或者
b)SEQ ID No:3所示的序列的至少10个核苷酸连续的片段,
c)SEQ ID No:3所示序列的互补序列的至少10个核苷酸连续的片段,
或者d)与a)或b)或c)具有至多5个核苷酸差异的序列;
其中,3)所述的探针在5’端带有互不相同的荧光报告基团,并且在除5′端外的任意一个位置上带有荧光淬灭基团。
2.根据权利要求1所述的组合物,其特征在于,所述组合物包括以下序列:
1)长度为15-19个核苷酸的用于PCR扩增I型新德里金属β-内酰胺酶基因的第一引物,该引物的序列包括:
a)SEQ ID No:1所示的序列,
b)SEQ ID No:1所示的序列的至少15个核苷酸连续的片段,或者
c)与a)或b)具有至多2个核苷酸差异的序列;
2)长度为15-18个核苷酸的用于PCR扩增I型新德里金属β-内酰胺酶基因的第二引物,该引物的序列包括:
a)SEQ ID No:2所示的序列,
b)SEQ ID No:2所示的序列的至少15个核苷酸连续的片段,或者
c)与a)或b)具有至多2个核苷酸差异的序列;
3)长度为15-24个核苷酸的与1)和2)所述引物的PCR扩增产物杂交的寡核苷酸探针,该探针的序列包括:
a)SEQ ID No:3所示的序列或其互补序列,或者
b)SEQ ID No:3所示的序列的至少15个核苷酸连续的片段,
c)SEQ ID No:3所示序列的互补序列的至少15个核苷酸连续的片段,
或者d)与a)或b)或c)具有至多2个核苷酸差异的序列;
其中,3)所述的探针在5’端带有互不相同的荧光报告基团,并且在除5′端外的任意一个位置上带有荧光淬灭基团。
3.根据权利要求1所述的组合物,其中,所述组合物由以下序列组成:
1)用于PCR扩增I型新德里金属β-内酰胺酶基因第一引物,该引物的序列为如SEQ ID No:1所示的序列;
2)用于PCR扩增I型新德里金属β-内酰胺酶基因第二引物,该引物的序列为如SEQ ID No:2所示的序列;
3)与1)和2)所述引物的PCR扩增产物杂交的寡核苷酸探针,该探针的序列为如SEQ ID No:3所示的序列或其互补序列;
其中,3)所述的探针在5’端带有互不相同的荧光报告基团,并且在除5′端外的任意一个位置上带有荧光淬灭基团。
4.根据权利要求1-3中任意一项所述的组合物,其中,所述荧光报告基团的发射波长小于所述荧光淬灭基团的吸收波长;并且所述荧光报告基团和所述荧光淬灭基团选自由6-羧基荧光素、四氯-6-羧基荧光素、六氯-6-甲基荧光素、6-羧基四甲基罗丹明、磺酰罗丹明、羧基-X-罗丹明、花菁3、花菁3.5、花菁5、花菁5.5、BHQ1、BHQ2、BHQ3、4-(4-二甲基氨基苯偶氮基)苯甲酸、6-羧基-4’,5’-二氯-2’,7’-二甲氧基荧光素琥珀酰亚胺酯和VIC荧光染料所组成的组中。
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