[发明专利]一种检测血液中转移肝癌细胞的试剂盒、标志物及方法无效
申请号: | 201110077693.0 | 申请日: | 2011-03-29 |
公开(公告)号: | CN102206708A | 公开(公告)日: | 2011-10-05 |
发明(设计)人: | 林明 | 申请(专利权)人: | 北京大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人: | 史双元 |
地址: | 100871*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 血液 转移 肝癌 细胞 试剂盒 标志 方法 | ||
1.一种利用甲基化原理检测血液中转移肝癌细胞的试剂盒,包括dNTP、10x PCR buffer、MgCl2、ddH2O,其特征在于,还包括标准血液DNA、热启动TaqDNA聚合酶、引物F 1、引物B1、引物F 2、引物B2、引物B3、引物R1、引物L1、引物R2、引物L2、引物L3;上述引物用于做甲基化特异性PCR,PCR时,引物的配对方案为:
引物F1、B1配对,引物F1、B2配对,引物F2、B1配对,引物F2、B3配对,用于检测ASS基因(GeneBank NG_011542,精氨酸代琥珀酸合成酶基因)甲基化情况;
引物R1、L1配对,引物R1、L2配对,引物R2、L3配对,用于检测ASL基因(GeneBank NG_009288,精氨酸代琥珀酸裂解酶基因)甲基化情况。
2.根据权利要求1所述一种利用甲基化原理检测血液中转移肝癌细胞的试剂盒,其特征在于,所述标准血液DNA为取自无肝癌健康人血液提取的基因组DNA并经过重亚硫酸盐处理。
3.根据权利要求1所述一种利用甲基化原理检测血液中转移肝癌细胞的试剂盒,其特征在于,引物F 1具有序列表中SEQ ID No.6所示的核苷酸序列,引物B1具有序列表中SEQ ID No.7所示的核苷酸序列,引物F2具有序列表中SEQ ID No.8所示的核苷酸序列,引物B2具有序列表中SEQ ID No.9所示的核苷酸序列,引物B3具有序列表中SEQ ID No.10所示的核苷酸序列,引物R1具有序列表中SEQ IDNo.11所示的核苷酸序列,引物L1具有序列表中SEQ ID No.12所示的核苷酸序列,引物R2具有序列表中SEQ ID No.13所示的核苷酸序列,引物L2具有序列表中SEQ ID No.14所示的核苷酸序列,引物L3具有序列表中SEQ ID No.15所示的核苷酸序列。
4.一种利用甲基化原理检测血液中转移肝癌细胞的标志物,其特征在于,所述标志物包括肝癌特异性低调控基因ASS(GeneBank NG_011542,精氨酸代琥珀酸合成酶基因)或ASL(GeneBank NG_009288,精氨酸代琥珀酸裂解酶基因)的甲基化的第一外显子和启动子区域;所述ASS(GeneBank NG_011542,精氨酸代琥珀酸合成酶基因)基因甲基化的第一外显子和启动子区域核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.1所示;所述ASL(GeneBank NG_009288,精氨酸代琥珀酸裂解酶基因)基因的甲基化的第一外显子和启动子区域核苷酸序列如序列表中SEQ IDNo.2所示。
5.检测血液中转移肝癌细胞的标志物,其特征在于,所述标志物包括一个或多个甲基化的CpG岛并由SEQ ID No.3表示。
6.根据权利要求5所述检测血液中转移肝癌细胞的标志物,其特征在于,衍生于肝癌特异性表达降低的基因ASS(GeneBank NG_011542,精氨酸代琥珀酸合成酶基因)。
7.检测血液中转移肝癌细胞的标志物,其特征在于,所述标志物包括一个或多个甲基化的CpG岛并由SEQ ID No.4表示。
8.检测血液中转移肝癌细胞的标志物,其特征在于,所述标志物包括一个或多个甲基化的CpG岛并由SEQ ID No.5表示。
9.根据权利要求7-8任何一项所述检测血液中转移肝癌细胞的标志物,其特征在于,衍生于肝癌特异性表达降低的基因ASL(GeneBank NG_009288,精氨酸代琥珀酸裂解酶基因)。
10.一种利用甲基化原理检测血液中转移肝癌细胞的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)从血液样品中提取基因组DNA;
(2)将基因组DNA经重亚硫酸盐处理,使未甲基化的胞嘧啶全部转变为尿嘧啶;
(3)利用权利要求1所述试剂盒及引物配对方案,以ddH2O、标准血液DNA、经重亚硫酸盐处理的血液样品基因组DNA为模板,进行甲基化特异性PCR反应;
(4)用1.5%琼脂糖凝胶电泳检测PCR结果,如果以ddH2O、标准血液DNA为模板的PCR无扩增条带,而以经重亚硫酸盐处理的血液样品基因组DNA为模板的PCR扩增有扩增条带,且扩增条带与预测的条带大小一致,则认为所检测的血液样品中含有转移肝癌细胞。
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