[发明专利]一种定量检测乙型肝炎病毒(HBV)的方法及其试剂盒无效
申请号: | 201110099880.9 | 申请日: | 2011-04-21 |
公开(公告)号: | CN102140558A | 公开(公告)日: | 2011-08-03 |
发明(设计)人: | 李望丰;李静芝;周凯;刘立侠 | 申请(专利权)人: | 东北制药集团辽宁生物制药有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 沈阳智龙专利事务所(普通合伙) 21115 | 代理人: | 宋铁军 |
地址: | 110027 辽宁省*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 定量 检测 乙型肝炎 病毒 hbv 方法 及其 试剂盒 | ||
1.一种定量检测乙型肝炎病毒(HBV)的方法,其特征在于:所述方法包括以下步骤:
采用纳米磁珠法提取样品中乙肝病毒核酸作为模板,应用TaqMan 荧光探针技术完成对该标本模板实时PCR检测过程,并设计竞争性内标,通过检测内标是否正常来监测待测样本中是否具有PCR抑制物,避免PCR假阴性;其中:通过专用软件,根据分析比较乙型肝炎病毒目的基因序列,设计高保守性、特异性和高效性的TaqMan荧光探针和引物以及竞争性内标的探针和引物,所述TaqMan荧光探针和竞争性内标分别标记下列其中一种不同颜色的荧光基团:FAM、Alexa546、JOE、HEX、TET;所述实时PCR产物在60-120个碱基对范围;在实时PCR反应液中,加入一种前述TaqMan荧光探针和引物,通过监测实时PCR反应体系中荧光信号的变化情况实现对样品中乙型肝炎病毒(HBV)的定量检测。
2.根据权利要求1所述一种定量检测乙型肝炎病毒(HBV)的方法,其特征在于:所述纳米磁珠法提取样品中乙型肝炎病毒(HBV)核酸的步骤为:首先,取冻存的样品溶化,加入裂解液重悬样品沉淀,65℃ 水浴10min,裂解液与样品的体积比为1:2;然后,加入与样品等体积的结合液混匀,加入25μl磁珠,置于磁力架上吸附磁珠,吸掉上清;加入3倍样品体积的洗液于离心管中,置于磁力架上吸附磁珠,吸掉废液;在离心管中加入洗脱液,65℃水浴2min,吸附磁珠,吸取上清,即为目的总核酸,置于4℃或-20℃保存。
3.根据权利要求1或2所述一种定量检测乙型肝炎病毒(HBV)的方法,其特征在于:
所述实时PCR反应体系为:包括5mM 的MgCl2,0.6mg/ml的BSA,pH8.3的20mM Tris-HCl,75 mM 的KCl,2.5 mM 的dNTP,HotStar Taq酶,PCR增强剂,保护剂, 10-50 nM HBV荧光探针, 10-50 nM内标荧光探针, 10-50 nM HBV上下游引物。
4.根据权利要求3所述一种定量检测乙型肝炎病毒(HBV)的方法,其特征在于:所述样品包括人源或动物源的血液、精液、唾液。
5.一种如权利要求1所述定量检测乙型肝炎病毒(HBV)方法的试剂盒,包括核酸提取试剂、核酸扩增试剂、对照品、标准品、内标,其特征在于:所述核酸提取试剂中包括蛋白酶K、纳米磁珠、裂解液、结合液、洗液A、洗液B、洗脱液;其中裂解液组成为:其中裂解液组成为:pH8.0的50 mM Tris-HCl、pH8.0的10 mM EDTA、1%SDS、4 M异硫氰酸胍;结合液组成为:5M异硫氰酸胍、pH6.6的20 mM Tris-HCl、37.5%乙醇;洗液A、B组成为:20 mM NaCl、pH7.5的2 mM Tris-HCl、70%乙醇;洗脱液组成为:pH8.0的10 mM Tris-HCl、pH8.0的1 mM EDTA;所述核酸扩增试剂由HBV PCR 反应液、酶混合液-Taq酶& UDG酶、探针1、探针2组成,所述HBV PCR 反应液中包含针对乙型肝炎病毒(HBV)核酸而设计的引物;所述对照品中的阳性对照为非感染性乙型肝炎病毒DNA,阴性对照为无菌双蒸水,强阳性对照为非感染性病毒DNA;所述标准品为含有乙型肝炎病毒(HBV)DNA序列质粒的梯度稀释物;所述内标为竞争性内标,内标探针与HBV目标基因探针采用不同的荧光报告基团标记,通过检测内标是否正常来监测待测样本中是否具有PCR抑制物,避免PCR假阴性。
6.根据权利要求5所述的定量检测乙型肝炎病毒(HBV)方法的试剂盒,其特征在于:所述核酸扩增试剂中针对乙肝病毒HBV和竞争性内标设计的TaqMan荧光探针和引物的序列如下:
HBV 探针:FAM-5’TGCGTGGAACCTTTGTGGCTCCTCTGCCG’3-BHQ-1
上游引物:5’ ACACCTCCTTTCCATGGCTGC’3;
下游引物:5’ agcgccgacgggacgtagac’3;
内标探针:HEX-5’CGAGCATCCTGCAGCTGCTCGCCTC’3-BHQ-1。
7.根据权利要求5所述定量检测乙型肝炎病毒(HBV)方法的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒为检测乙型肝炎病毒(HBV)核酸的单一试剂盒。
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