[发明专利]快速检测NDM-1基因的专用引物及其应用无效
申请号: | 201110108495.6 | 申请日: | 2011-04-28 |
公开(公告)号: | CN102154506A | 公开(公告)日: | 2011-08-17 |
发明(设计)人: | 朱宝利;张苑怡;武娜;王志云;李奉京 | 申请(专利权)人: | 中国科学院微生物研究所;北京蓝谱生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;C12N9/78 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 100101 北京市朝阳区北辰*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 快速 检测 ndm 基因 专用 引物 及其 应用 | ||
1.辅助检测NDM-1蛋白的编码基因的专用引物,由序列表的序列1所示DNA、序列表的序列2所示DNA、序列表的序列3所示DNA、序列表的序列4所示DNA、序列表的序列5所示DNA和序列表的序列6所示DNA组成;
所述NDM-1蛋白是如下(a)或(b)的蛋白质:
(a)由序列表中序列7所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(b)将序列7的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由序列7衍生的蛋白质。
2.一种辅助检测NDM-1蛋白的编码基因的试剂盒,包括权利要求1所述的专用引物;
所述NDM-1蛋白是如下(a)或(b)的蛋白质:
(a)由序列表中序列7所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(b)将序列7的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由序列7衍生的蛋白质。
3.权利要求1所述专用引物在制备辅助检测NDM-1蛋白的编码基因的试剂盒中的应用;
所述NDM-1蛋白是如下(a)或(b)的蛋白质:
(a)由序列表中序列7所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(b)将序列7的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由序列7衍生的蛋白质。
4.权利要求1所述专用引物或权利要求2所述试剂盒在辅助检测NDM-1蛋白的编码基因中的应用;
所述NDM-1蛋白是如下(a)或(b)的蛋白质:
(a)由序列表中序列7所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(b)将序列7的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由序列7衍生的蛋白质。
5.权利要求1所述专用引物或权利要求2所述试剂盒在辅助鉴定含有NDM-1蛋白的编码基因的生物样本中的应用;
所述NDM-1蛋白是如下(a)或(b)的蛋白质:
(a)由序列表中序列7所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(b)将序列7的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由序列7衍生的蛋白质。
6.如权利要求1所述的专用引物,如权利要求2所述的试剂盒,或如权利要求3至5中任一所述的应用,其特征在于:所述NDM-1蛋白的编码基因为如下(1)或(2)或(3)或(4)所述的DNA分子:
(1)序列表中序列8所示的DNA分子;
(2)序列表的序列8自5’末端第14至826位核苷酸所示的DNA分子;
(3)在严格条件下与(1)或(2)限定的DNA序列杂交且编码相同功能蛋白的DNA分子;
(4)与(1)或(2)限定的DNA序列至少具有90%以上同源性且编码相同功能蛋白的DNA分子。
7.一种辅助鉴定待测生物样本是否含有NDM-1蛋白的编码基因的方法,包括如下步骤:
(1)提取所述待测生物样本的基因组DNA;
(2)以步骤(1)的基因组DNA为模板,用权利要求1所述的专用引物进行环介导恒温扩增;
(3)根据步骤(2)的扩增产物鉴定所述待测生物样本是否含有NDM-1蛋白的编码基因;
所述NDM-1蛋白是如下(a)或(b)的蛋白质:
(a)由序列表中序列7所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(b)将序列7的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由序列7衍生的蛋白质。
8.如权利要求7所述的方法,其特征在于:所述NDM-1蛋白的编码基因为如下(1)或(2)或(3)或(4)所述的DNA分子:
(1)序列表中序列8所示的DNA分子;
(2)序列表的序列8自5’末端第14至826位核苷酸所示的DNA分子;
(3)在严格条件下与(1)或(2)限定的DNA序列杂交且编码相同功能蛋白的DNA分子;
(4)与(1)或(2)限定的DNA序列至少具有90%以上同源性且编码相同功能蛋白的DNA分子。
9.如权利要求7或8所述的方法,其特征在于:所述环介导恒温扩增的反应程序为:65℃1小时,80℃5分钟。
10.如权利要求7或8或9所述的方法,其特征在于:所述环介导恒温扩增的反应体系中,序列表的序列1所示DNA和序列表的序列2所示DNA的浓度均为0.2μmol/L,序列表的序列3所示DNA和序列表的序列4所示DNA的浓度均为1.6μmol/L,序列表的序列5所示DNA和序列表的序列6所示DNA的浓度均为0.8μmol/L。
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