[发明专利]JAK2基因的外显子12中的突变的检测方法、以及用于所述检测方法的核酸探针和试剂盒有效

专利信息
申请号: 201110110594.8 申请日: 2011-04-29
公开(公告)号: CN102234690A 公开(公告)日: 2011-11-09
发明(设计)人: 小森真理子 申请(专利权)人: 爱科来株式会社
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 中国专利代理(香港)有限公司 72001 代理人: 熊玉兰;高旭轶
地址: 日本京都*** 国省代码: 日本;JP
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摘要:
搜索关键词: jak2 基因 外显子 12 中的 突变 检测 方法 以及 用于 核酸 探针 试剂盒
【权利要求书】:

1.多态性检测用探针,该探针用于检测JAK2 外显子12基因的多态性,其特征在于,由下列(a)-(c)中至少一种寡核苷酸构成:

(a)由与包含序列编号1中示出的碱基序列中碱基编号114至132的19~50个碱基长度的碱基序列互补的序列相同的序列构成的寡核苷酸,

(b)由与包含序列编号1中示出的碱基序列中碱基编号122至143的22~50个碱基长度的碱基序列互补的序列相同的序列构成的寡核苷酸,和

(c)由与包含序列编号11中示出的碱基序列中碱基编号41至50的10~50个碱基长度的碱基序列相同的序列构成的寡核苷酸。

2.权利要求1所述的多态性检测用探针,其中:

所述(a)中示出的寡核苷酸在从3’末端计数第1-3位置处具有用荧光染料标记的对应于碱基编号114的碱基,

所述(b)中示出的寡核苷酸在从5’末端计数第1-3位置处具有用荧光染料标记的对应于碱基编号143的碱基,

所述(c)中示出的寡核苷酸在从3’末端计数第1-3位置处具有用荧光染料标记的对应于碱基编号50的碱基。

3.利要求1或2所述的多态性检测用探针,其中所述(a)中示出的寡核苷酸在3’末端具有用荧光染料标记的对应于碱基编号114的碱基,

所述(b)中示出的寡核苷酸在5’末端具有对应于碱基编号143的碱基,以及

所述(c)中示出的寡核苷酸在3’末端具有对应于碱基编号50的碱基。

4.权利要求1~3中任一项所述的多态性检测用探针,其中与未与目标序列杂交时相比,所述寡核苷酸在与目标序列杂交时荧光强度减少或增加。

5.权利要求4所述的多态性检测用探针,其中所述寡核苷酸在与目标序列杂交时荧光强度减少。

6.权利要求1~5中任一项所述的探针,其中所述(a)中示出的寡核苷酸为24~30个碱基长度、所述(b)中示出的寡核苷酸为29~35个碱基长度、和/或所述(c)中示出的寡核苷酸为16~22个碱基长度。

7.权利要求1~5中任一项所述的探针,其中所述(a)中示出的寡核苷酸由序列编号6中示出的碱基序列组成、所述(b)中示出的寡核苷酸由序列编号5中示出的碱基序列组成、和/或所述(c)中示出的寡核苷酸由序列编号4中示出的碱基序列组成。

8.权利要求1~7中任一项所述的探针,其中JAK2 外显子12基因的多态性为选自K539L(sub1)、H538QK539L(sub2)、N542-E543del(del6)和F537-K539delinsL(del6inL)的至少一种突变。

9.一种检测突变的方法,其针对具有JAK2 外显子12基因的多态性部位的核酸,应用以荧光染料标记的核酸探针,通过测定荧光染料的荧光进行解链曲线分析,基于解链曲线分析的结果检测突变,其中所述核酸探针是权利要求1~8中任一项所述的核酸探针。

10.权利要求9所述的方法,其包括:扩增样品所含的核酸中包含多态性部位的区域,得到具有多态性的核酸。

11.权利要求10所述的方法,其中通过应用DNA聚合酶的方法进行扩增。

12.权利要求11所述的方法,其中在核酸探针存在的条件下进行扩增。

13.用于检测JAK2 外显子12基因的多态性的试剂盒,其包含权利要求1~8中任一项所述的多态性检测用探针。

14.权利要求13所述的试剂盒,其进一步包含引物,所述引物用于通过利用DNA聚合酶的方法扩增含有JAK2 外显子12基因的多态性部位的区域。

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