[发明专利]通过基因记数方法对大肠癌术后无复发生存预测的检测方法、探针组和诊断试剂盒有效
申请号: | 201110113489.X | 申请日: | 2011-05-04 |
公开(公告)号: | CN102766678A | 公开(公告)日: | 2012-11-07 |
发明(设计)人: | 黄薇;蔡三军;王志敏;彭俊杰;王海丰;徐烨;牛振民 | 申请(专利权)人: | 上海人类基因组研究中心;复旦大学附属肿瘤医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 上海浦一知识产权代理有限公司 31211 | 代理人: | 刘昌荣 |
地址: | 201203 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 通过 基因 记数 方法 肠癌 术后 复发 生存 预测 检测 探针 诊断 试剂盒 | ||
1.一种通过基因记数方法对大肠癌术后无复发生存预测的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)采集大肠癌患者的手术切除癌组织标本;
(2)抽提RNA样本;
(3)纯化该RNA样本;
(4)检测4个探针在该RNA样本中的表达,所述探针分别具有如SEQ ID No:1,SEQ IDNo:2,SEQ ID No:3及SEQ ID No:4所示的序列或其互补链;
(5)计算上述4个探针中,呈高表达状态的探针数目,并对该患者手术后的预后进行评价。
2.如权利要求1所述的检测方法,其特征在于:步骤(2)中,使用RNeasy Mini ColumnKit抽提RNA样本,抽提后的RNA样本保存在-70℃的深低温冰箱中。
3.如权利要求1所述的检测方法,其特征在于:步骤(3)中,使用High Pure RNA ParaffinKit纯化RNA样本。
4.如权利要求1所述的检测方法,其特征在于:步骤(4)中,采用cDNA介导退火、选择、延伸、连接反应技术,检测探针的表达。
5.如权利要求1所述的检测方法,其特征在于:步骤(5)中,所述预后评价包括复发率和无复发生存时间的评价。
6.如权利要求5所述的检测方法,其特征在于:所述高表达的探针数目越多,该患者术后的复发率越高,无复发生存时间越短。
7.一种用于通过基因记数方法对大肠癌术后无复发生存预测的探针组,其特征在于:包括4个探针,这4个探针分别具有如SEQ ID No:1、SEQ ID No:2、SEQ ID No:3及SEQ IDNo:4所示的序列或其互补链。
8.一种用于通过基因记数方法对大肠癌术后无复发生存预测的诊断试剂盒,其特征在于:该诊断试剂盒包含有如权利要求7所述的探针组。
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