[发明专利]通过基因记数方法对大肠癌术后无复发生存预测的检测方法、探针组和诊断试剂盒有效

专利信息
申请号: 201110113489.X 申请日: 2011-05-04
公开(公告)号: CN102766678A 公开(公告)日: 2012-11-07
发明(设计)人: 黄薇;蔡三军;王志敏;彭俊杰;王海丰;徐烨;牛振民 申请(专利权)人: 上海人类基因组研究中心;复旦大学附属肿瘤医院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 上海浦一知识产权代理有限公司 31211 代理人: 刘昌荣
地址: 201203 上*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 通过 基因 记数 方法 肠癌 术后 复发 生存 预测 检测 探针 诊断 试剂盒
【说明书】:

技术领域

发明涉及大肠癌的预后领域,尤其涉及一种通过基因记数方法对大肠癌术后无复发生存进行预测的检测方法。本发明还涉及用于该方法的探针组及诊断试剂盒。

背景技术

大肠癌泛指发生在直肠和全部结肠(升结肠、横结肠、降结肠、乙状结肠)的恶性肿瘤,是临床上常见的恶性肿瘤之一。目前,国内大肠癌每年的新发病例约为80万例,每年有50万人死于大肠癌。由于生活条件和生活习惯的改变,大肠癌的发病率还在呈逐年上升趋势,与上世纪90年代和70年代相比,大肠癌的发病率,在城市上升了31.95%,在农村上升了8.51%,在全国五大城市(北京、天津、上海、武汉、哈尔滨)中,北京的大肠癌发病率最高,其次为上海;上海的大肠癌发病率正以每年4.2%左右的速度上升。同时,大肠癌的发病平均年龄越来越低,可以预见,随着人口的进一步老龄化,老年人口的大肠癌发病率还将大幅上升。

根据美国癌症协会2005年的统计数据,早期大肠癌的五年生存率为90%;一旦肿瘤侵犯周围的淋巴结或者脏器,其五年生存率就降为67%;假如肿瘤发生远处转移,则其五年生存率就只有9%。但是,由于大肠癌的早期症状不明显,缺乏特异性临床表现,加上患者的自我保健意识较差或讳疾忌医,因此,大肠癌的早期发现和诊断比较困难,临床上,有60~70%以上的患者确诊时已是大肠癌的中晚期,而在能够进行结直肠癌根治手术的II期和III期患者中,约20%和50%的患者会在术后发生复发和转移,需要根据病情再接受化疗或放疗等辅助治疗。但是,肿瘤的复发和转移,涉及到众多基因的变化,其过程相当复杂,因此,对患者术后发生复发转移危险度的预测比较困难。

发明内容

本发明要解决的技术问题是提供一种通过基因记数方法对大肠癌术后无复发生存预测的检测方法,它有助于提高大肠癌患者术后的生存率。

为解决上述技术问题,本发明的通过基因记数方法对大肠癌术后无复发生存预测的检测方法,包括以下步骤:

(1)采集大肠癌患者的手术切除癌组织标本;

(2)抽提RNA样本;

(3)纯化该RNA样本;

(4)检测4个探针在该RNA样本中的表达,所述探针分别具有如SEQ ID No:1,SEQ IDNo:2,SEQ ID No:3及SEQ ID No:4所示的序列或其互补链;

(5)计算上述4个探针中,呈高表达状态的探针数目,并对该患者手术后的预后进行评价。

本发明要解决的另一技术问题是提供一种用于上述方法的探针组。

为解决上述技术问题,本发明的用于通过基因记数方法对大肠癌术后无复发生存预测的探针组,包括有4个探针,这4个探针分别具有如SEQ ID No:1、SEQ ID No:2、SEQ ID No:3及SEQ ID No:4所示的序列或其互补链。

本发明要解决的再一技术问题是提供一种用于上述方法的诊断试剂盒。

为解决上述技术问题,本发明的用于通过基因记数方法对大肠癌术后无复发生存预测的诊断试剂盒,包含有上述探针组。

本发明通过对4个特异性探针的检测和联合分析,来快速诊断大肠癌患者术后发生复发和转移的危险度,从而可以在术后及早筛查出复发转移危险度较高的大肠癌患者,对其进行相应的辅助治疗,以提高患者术后的生存率,延长患者的生存时间。

附图说明

图1为本发明实施例中用SAM软件分析得到的散点图;

图2为本发明实施例的对数生存函数曲线图。

具体实施方式

以下实施例仅用于说明本发明,而不用于限制本发明的范围。实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件,例如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(New York:Cold Spring Harbor Laboratory Press,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。

1.实验对象

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