[发明专利]一种CDKAL1基因多态性检测特异性引物和液相芯片无效
申请号: | 201110153876.6 | 申请日: | 2011-06-09 |
公开(公告)号: | CN102191337A | 公开(公告)日: | 2011-09-21 |
发明(设计)人: | 许嘉森;吴诗扬;甘丹翠 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香;曾旻辉 |
地址: | 510663 广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 cdkal1 基因 多态性 检测 特异性 引物 芯片 | ||
1.一种CDKAL1基因多态性检测液相芯片,其特征是,主要包括有:
A.针对CDKAL1基因的不同多态性位点分别设计的野生型和突变型特异性ASPE引物,每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端的针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列分别选自:针对A107C的SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10、针对G323C的SEQID NO.11及SEQ ID NO.12、针对A210G的SEQ ID NO.13及SEQ ID NO.14、针对A75G的SEQ IDNO.15及SEQ ID NO.16中的一对以上;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.8中的序列;
B.分别包被有特异的anti-tag序列的微球,所述anti-tag序列能相应地与A中所选tag序列互补配对,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.17~SEQ ID NO.24中的序列,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列,上述每种微球具有不同颜色编码;
C.用于扩增具有A107C、G323C、A210G和A75G中的一个以上多态性位点目标序列的引物。
2.根据权利要求1所述的CDKAL1基因多态性检测液相芯片,其特征是,所述扩增引物选自:针对A107C和/或G323C的SEQ ID NO.25和SEQ ID NO.26、针对A210G的SEQ ID NO.27和SEQ ID NO.28、针对A75G的SEQ ID NO.29和SEQ ID NO.30中的一对以上。
3.根据权利要求1所述的CDKAL1基因多态性检测液相芯片,其特征是,所述ASPE引物选自:针对A107C的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.9组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ IDNO.10组成的序列、针对G323C的由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.11组成的序列及由SEQ IDNO.4和SEQ ID NO.12组成的序列、针对A210G的由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.13组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.14组成的序列、针对A75G的由SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.15组成的序列及由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.16组成的序列中的一对以上。
4.根据权利要求1所述的CDKAL1基因多态性检测液相芯片,其特征是,主要包括有:
A.特异性ASPE引物:针对A107C的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.9组成的序列及由SEQID NO.2和SEQ ID NO.10组成的序列、针对G323C的由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.11组成的序列及由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.12组成的序列、针对A210G的由SEQ ID NO.5和SEQ IDNO.13组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.14组成的序列、和针对A75G的由SEQ IDNO.7和SEQ ID NO.15组成的序列及由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.16组成的序列;
B.分别包被有特异的anti-tag序列的微球,所述anti-tag序列能相应地与A中所选tag序列互补配对,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.17~SEQ ID NO.24中的序列,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;
C.所述扩增引物为:针对A107C和G323C的SEQ ID NO.25和SEQ ID NO.26、针对A210G的SEQ ID NO.27和SEQ ID NO.28、和针对A75G的SEQ ID NO.29和SEQ ID NO.30。
5.根据权利要求1-4任一项所述的CDKAL1基因多态性检测液相芯片,其特征是,所述间隔臂序列为5-10个T。
6.一种用于CDKAL1基因多态性检测的特异性引物,其特征在于,所述特异性引物序列为:针对A107C的SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10、针对G323C的SEQ ID NO.11及SEQ IDNO.12、针对A210G的SEQ ID NO.13及SEQ ID NO.14、针对A75G的SEQ ID NO.15及SEQ IDNO.16中的一对以上。
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