[发明专利]一种CDKAL1基因多态性检测特异性引物和液相芯片

说明书

技术领域

本发明屈于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种CDKAL1基因多态性检测特异性引物和液相芯片。

背景技术

CDK5调节亚单位相关蛋白1类似物1(cyckin-dependent kinase 5 regulatorysubunit-associated protein 1-like 1，CDKAL1)基因是CDK5(细胞周期素依赖激酶5)调节亚单位相关蛋白1的编码基因，位于第6号染色体短臂22.3区，其信号区位于第5个内含子上，在人类胰腺和骨骼肌细胞中高度表达。CDK5在保护β细胞功能、降低血糖方面发挥重要的作用，CDK5在高糖毒性的作用下可导致β细胞变性，而CDKAL1基因编码的蛋白质能够抑制CDK5的活化。若CDKAL1基因位点发生变异，则对CDK5的抑制作用减弱，导致β细胞功能受损，胰岛素分泌减少。CDKAL1基因通过影响胰岛β细胞的分泌功能，从而影响胰岛素的分泌。

本发明目标检测的CDKAL1基因突变位点，如表所示：

  序号  CDKAL1位点突变的内容  简写  1  SEQ ID NO 31的第107位核苷酸，发生A→C突变 A107C  2  SEQ ID NO 31的第323位核苷酸，发生G→C突变 G323C  3  SEQ ID NO 32的第210位核苷酸，发生A→G突变 A210G  4  SEQ ID NO 33的第75位核苷酸，发生A→G突变 A75G

目前，对CDKAL1基因多态性进行检测、分析的方法很多，如：直接测序法、荧光定量PCR、PCR-RFLP分析法、TaqMan技术等等，其中最常用的方法有荧光定量PCR和PCR-RFLP分析法。荧光定量PCR具有操作简便、结果快捷、量化等优点，但是，该技术存在样品易污染，易发生交叉反应，假阳性率高的缺点；而PCR-RFLP法是基于基因突变造成的限制性内切酶识别位点的改变，如位点丢失或产生新位点，通过PCR扩增某一特定片段，再用限制性内切酶酶切扩增产物，电泳观察片段的大小，这种方法用于检测酶切位点改变的基因突变，可直接判断基因型，但该法不能用于没有产生新酶切位点的基因突变检测。再次，以上这些方法都存在着检测通量的局限性，每次只能检测一种突变类型，不能满足实际应用的需要。

发明内容

本发明的目的之一是提供CDKAL1基因多态性检测液相芯片，该液相芯片可用于检测CDKAL1基因四种常见基因型A107C、G323C、A210G和A75G的野生型和突变型。

一种CDKAL1基因多态性检测液相芯片，主要包括有：