[发明专利]同步检测SPFMV、SPVC、SPVG和SPV2的方法无效
申请号: | 201110156722.2 | 申请日: | 2011-06-10 |
公开(公告)号: | CN102230027A | 公开(公告)日: | 2011-11-02 |
发明(设计)人: | 李凡;陈海如;许东林;王海宁;左瑞娟;谭冠林;包改丽 | 申请(专利权)人: | 云南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
代理公司: | 昆明今威专利代理有限公司 53115 | 代理人: | 刘明哲 |
地址: | 650201 云南*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 同步 检测 spfmv spvc spvg spv2 方法 | ||
1.一种同步检测SPFMV、SPVC、SPVG和SPV2的方法,其步骤为:
(1)引物设计合成:
(a)设计合成检测SPFMV、SPVC、SPVG和SPV2的通用反向引物SPFCG2R:5’-TCGGGACTGAARGAYACGAATTTAA-3’,R=A或G,Y=C或T;
(b)分别设计合成检测SPFMV、SPVC、SPVG和SPV2的正向引物SPFF、SPCF、SPGF和SP2F,引物序列如下:
SPFF:5’-GGATTAYGGTGTTGACGACACA-3’,
SPCF:5’-GTGAGAAAYCTATGCGCTCTGTT-3’,
SPGF:5’-GTATGAAGACTCTCTGACAAATTTTG-3’,
SP2F:5’-CGTACATTGAAAAGAGAAACAGGATA-3’,
其中,Y=C或T;
(c)每对引物扩增片段大小及待测病毒为:
(2)CTAB法提取感病植物组织的总核酸,作为RT-PCR扩增模板;
(3)一步法RT-PCR扩增;
(4)琼脂糖凝胶电泳检测扩增结果。
2.根据权利要求1所述的同步检测SPFMV、SPVC、SPVG和SPV2的方法,其特征在于,所述CTAB法提取感病植物组织的总核酸为:将3~5片病叶叠加在一起,称取100mg左右至研钵中,加入1.2mL CTAB缓冲液(2%CTAB,2%PVP-40,100mMTris-HCl,pH 8.0,1.4MNaCl,20mMEDTA,0.2%巯基乙醇);充分研磨后,转入1.5mL离心管中,65℃温浴15~60min;13000r/min离心15min,取750μL上清至一新的1.5mL离心管,加入等体积氯仿/异戊醇(24∶1),涡旋震荡混匀30s;13000r/min离心10min,小心转移600μL上清液至一新的1.5mL离心管中,加入等体积异丙醇,轻轻颠倒离心管充分混匀液体,室温放置10min,13000r/min离心15min,小心地用微量移液器吸出上清;沉淀加入500μL 70%乙醇,13000r/min离心10min,小心地用微量移液器吸出上清,室温下自然干燥沉淀10~15min;加入100μL 20mmol/L Tris-HCl(pH8.0)并置于冰上10min,用微量移液器反复吹打液体使沉淀充分溶解,-20℃保存备用,也可以将所获得的总核酸以干粉状态放入-86℃进行长期保存。
3.根据权利要求1所述的同步检测SPFMV、SPVC、SPVG和SPV2的方法,其特征在于,所述一步法RT-PCR的反应体系为20μL,包括10μL 2×Reaction mix(含0.4mM各dNTP,2.4mM MgSO4的buffer)、2μL 10μM引物SPFF、0.4μL 10μM引物SPCF、2.5μL 10μM引物SPGF、0.2μL 10μM引物SP2F、2μL 10μM引物SPFCG2R、0.7μL ddH2O、1μL RNA模板和1.2μL Enzyme mix(含SuperScriptTM III RT及Taq High Fidelity)。
4.根据权利要求1所述的同步检测SPFMV、SPVC、SPVG和SPV2的方法,其特征在于,所述一步法RT-PCR的反应条件为:50℃反转录30min,94℃2min,94℃ 30s、60℃ 30s、65~68℃ 1~3min,扩增30个循环,72℃延伸5min后4℃保存。
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