[发明专利]甲亢疾病的易感基因及其应用有效
申请号: | 201110161696.2 | 申请日: | 2011-06-15 |
公开(公告)号: | CN102827834A | 公开(公告)日: | 2012-12-19 |
发明(设计)人: | 宋怀东;潘春明;赵双霞 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 祝莲君;雷芳 |
地址: | 200025 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 甲亢 疾病 基因 及其 应用 | ||
技术领域
本发明涉及分子生物学和医学领域。更具体地,本发明涉及人类基因组中20个单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)及其与甲亢疾病的相关性。本发明还涉及检测这些SNP和甲亢易感性的方法和试剂盒。
背景技术
甲状腺功能亢进症(Hyperthyroidism,简称甲亢)系指由多种病因导致甲状腺激素(TH)分泌过多引起的临床综合征。甲亢病人较复杂,其中以弥漫性甲状腺肿伴甲亢(Graves病,GD)为最多见。GD是一种伴甲状腺激素分泌增多的、器官特异性自身免疫性疾病,它是机体的免疫系统功能亢进,从而产生抗自身甲状腺的抗体(免疫球蛋白)而引起的,这种特异性的抗体刺激甲状腺增生、并使其分泌大量的甲状腺激素。一般Graves病多见于女性,男女患病率之比为1∶4-7,特别是青春发育期、妊娠期和更年前期。
经研究,Graves病是一种器官特异性自身免疫疾病,一种常见的多基因疾病,因此其发病具有较强的遗传基础。Graves病的发病原因一般被认为是由多种易感基因和环境因素共同造成的。已经发现人白细胞抗原(HLA)-II基因、细胞毒性T淋巴细胞抗原4(CTLA-4)基因,促甲状腺受体(TSH-R)基因和甲状腺球蛋白(Tg)基因等多个基因与Graves病存在一定的联系。此外,还有其它的免疫相关基因,如白介素-1受体拮抗基因、肿瘤坏死因子β基因和甲状腺过氧化物酶基因等,但很多结果存在争议。
群体中可能存在多于一种的称为“多态位点”的核酸序列,多态位点可以允许序列基于取代、插入或缺失而存在差异。因此取代、插入或缺失可以导致移码、产生过早终止密码子、多核苷酸所编码的一个或多个氨基酸的缺失、添加、改变剪切位点。以及影响mRNA的转运或稳定性。当多态位点长度为单独一个氨基酸时,将该位点称为单核苷酸多态性(SNP)。
SNP是造成疾病易感性和药物反应差异的最普遍的遗传变异形式。SNP可以直接促成许多表型如患者间的疾病危险或药物反应差异,或者更普遍地作为所述表型的标记。
由于甲亢疾病本身的复杂性、多个基因之间的相互作用,以及环境因素对甲亢疾病发展的影响,使甲亢易感基因的确定十分困难。因此,本领域迫切需要深入研究人类基因组,以期找到导致Graves病发生和发展的易感基因,并研发出可用于诊断和检测Graves病的试剂盒,以及相关的治疗药物。
发明内容
本发明人经过长期深入的研究,发现20个单核苷酸位点(SNP)与甲亢疾病的易感性密切相关。本发明的一个目的是证实20个单核苷酸多态性位点与甲亢疾病密切相关。本发明的另一个目的是证明所述SNP可用于检测甲亢易感性、制备检测甲亢疾病易感性试剂及试剂盒、筛选甲亢药物等。
在本发明的第一方面,提供一种分离的含单核苷酸多态性(SNP)位点的多核苷酸,所述多核苷酸中的SNP位点对应于选自下组的SNP:
1号染色体155908307位 rs10908583 C→T;
1号染色体155935902位 rs3761959 G→A;
2号染色体204416891位 rs231804 C→T;
2号染色体204429997位 rs1024161 C→T;
2号染色体204449111位 rs231726 C→T;
2号染色体204471289位 rs10197319 A→G;
4号染色体39998408位 rs6832151 T→G;
6号染色体31166157位 rs4947296 T→C;
6号染色体31458683位 rs1521 C→T;
6号染色体32536263位 rs6903608 T→C;
6号染色体32771829位 rs6457617 C→T;
6号染色体33168096位 rs2281388 C→T;
6号染色体167293698位 rs9366076 T→C;
6号染色体167303065位 rs9355610 A→G;
14号染色体80438570位 rs12050151 T→C;
14号染色体80502299位 rs179247 G→A;
14号染色体80514120位 rs2284722 G→A;
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