[发明专利]一种鉴定耐盐棉花的方法及专用SSR标记有效
申请号: | 201110163907.6 | 申请日: | 2011-06-17 |
公开(公告)号: | CN102251029A | 公开(公告)日: | 2011-11-23 |
发明(设计)人: | 叶武威;张丽娜;王俊娟;王德龙;樊保相;王帅 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院棉花研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 455000 河*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 棉花 方法 专用 ssr 标记 | ||
1.一种用于辅助鉴定耐盐棉花的引物组合物,为如下中任意一种:
(1)HAU1918、HAU1058和TMB1288
(2)HAU1918、NAU1085和HAU773
(3)HAU1918、HAU1058和NAU1085
(4)HAU1918、HAU1058和TMB1288
(5)HAU1918、HAU1058、HAU773和NAU1085
(6)HAU1918、NAU1085、HAU773和TMB1288
(7)HAU1918、HAU1058、NAU1085和TMB1288
(8)HAU1918、HAU1058、HAU773、NAU1085和TMB1288
(9)HAU1918和TMB1288
(10)NAU1085和TMB1288
(11)HAU773和TMB1288
(12)HAU1058和TMB1288;
所述HAU1918的一条引物序列如SEQ ID NO:3所示,另一条引物序列如SEQ ID NO:4所示;
所述HAU1058的一条引物序列如SEQ ID NO:5所示,另一条引物序列如SEQ IDNO:6所示;
所述TMB1288的一条引物序列如SEQ ID NO:1所示,另一条引物序列如SEQ IDNO:2所示;
所述NAU1085的一条引物序列如SEQ ID NO:7所示,另一条引物序列如SEQ IDNO:8所示;
所述HAU773的一条引物序列如SEQ ID NO:9所示,另一条引物序列如SEQ ID NO:10所示。
2.权利要求1所述引物组合物在辅助鉴定耐盐棉花中的应用。
3.一种辅助鉴定耐盐棉花的方法,包括如下步骤:
分别用权利要求1所述引物组合物中的每对引物对待测棉花单株进行PCR扩增,获得PCR扩增产物,对所述PCR扩增产物进行检测,根据如下方法确认所述待测棉花单株为耐盐棉花还是盐敏感棉花:
若所述引物组合物对应的所有PCR扩增产物中含有耐盐特征带T且无敏盐特征带S1,则确认所述待测棉花单株候选为耐盐棉花;
若所述引物组合物对应的所有PCR扩增产物中含有敏盐特征带S1,则确认所述待测棉花候选为盐敏感棉花;
若所述引物组合物对应的所有PCR扩增产物中不含有敏盐特征带S1也不含有任何耐盐特征带T,则确认所述待测棉花候选为盐敏感棉花;
所述敏盐特征带S1为60bp的DNA;
所述耐盐特征带T为T4、T3A、T3B、T5和T2中的至少一种;
所述T4为210bp的DNA;所述T3A为280bp的DNA;所述T3B为240bp的DNA;所述T5为220bp的DNA;所述T2为160bp的DNA。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:所述PCR扩增的体系由10×PCRbuffer、dNTP、Taq DNA聚合酶、SSR标记中的一条DNA分子、SSR标记中的另一条DNA分子和模板DNA组成;dNTP在体系中的浓度为0.2mmol/L,Taq DNA聚合酶在体系中的浓度为0.05U/μl,SSR标记中的一条DNA分子在体系中的浓度为0.5μmol/l,SSR标记中的另一条DNA分子在体系中的浓度为0.5μmol/l,模板DNA在体系中的浓度为5.0ng/μl。
5.根据权利要求3或4所述的方法,其特征在于:所述对所述PCR扩增产物进行检测的方法为测序或非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳。
6.一种辅助鉴定耐盐棉花的方法,包括如下步骤:
取待测棉花的15个单株,按照权利要求3-5中任一所述方法对每株棉花进行检测,若15个单株中有8株以上被鉴定为耐盐棉花,则确认所述待测棉花候选为耐盐棉花;若15个单株中有7株以下被鉴定为盐敏感棉花,则确认所述待测棉花候选为盐敏感棉花。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:所述待测棉花为棉花常规种或棉花杂交种。
8.权利要求3-7中任一所述方法在耐盐棉花品种的选育中的应用。
9.权利要求3-7中任一所述方法在棉花的遗传育种中的应用。
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