[发明专利]应用代谢组学技术评价与预测药物毒性和药效的方法无效
申请号: | 201110182900.9 | 申请日: | 2011-07-01 |
公开(公告)号: | CN102339356A | 公开(公告)日: | 2012-02-01 |
发明(设计)人: | 谢洪平;牟红元;吕天 | 申请(专利权)人: | 苏州大学 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00;G01N30/72;G01N27/62 |
代理公司: | 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 | 代理人: | 陶海锋;陆金星 |
地址: | 215123 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 应用 代谢 技术 评价 预测 药物 毒性 药效 方法 | ||
技术领域
本发明涉及一种通过消除生物样本中外源性代谢物信号以准确获取其内源性代谢物信号,并基于内源性代谢物信号评价与预测代谢组学药物毒性和药效的方法。
背景技术
药物毒性和药效评价方法主要是基于实验动物对药物的某些反应,评估药物的毒性和药效。对于这种评估手段,传统的方法只能采用一个或几个指标表征其药效和毒性反应,缺乏整体全面的评价,并且对毒性和药效的反应灵敏度较低。对于低毒性药物、甚至亚毒性药物(特别是对于传统中药)也就不可能评价其毒性,最终导致某些药物进入临床试验或进入临床使用时出现一些预料之外的毒副反应,最为明显的即是中药注射剂在临床使用时频频出现问题。
代谢组学(metabonomics)因其能够灵敏而全面地测定不同生理、病理状态下内源性代谢产物的改变,给出生物体对药物毒性和药效的整体信息,从而有利于全面认识和评价药物,现已广泛地应用到了药物研发领域。众所周知,由英国帝国理工学院与Pfizer等六大国际知名制药公司启动的COMET1(theConsortium on Metabonomic Toxicology)计划建立了约150种肝肾毒性模型的专家系统,应用于毒性化合物的发现及高通量筛选。2006年启动的COMET2拟在研究标准毒物分子机制的基础上,建立具预测性的构效关系专家系统。核磁共振(NMR)作为COMET计划使用的分析平台具有显著的特点,但因其灵敏度低、检测动态范围窄而导致应用受限,虽已有很多改进技术,但因成本太高,很难得到普遍应用。相对于NMR而言,高效液相色谱-质谱联用(HPLC-MS/MS)技术具有灵敏度高、专属性强、动态范围宽、获得比NMR更多的化合物结构信息、设备购置费用相对较低的特点,因此已越来越多地被应用于代谢组学,特别是药效温和、毒性极低的中药,基于HPLC-MS/MS技术的代谢组学更有显著的优势。
以空白对照组与给药组的内源性代谢物的浓度差异为基础的代谢组学中,常常需要对所获得的样本数据中存在的干扰组分信号进行消除,以保证代谢组学模型的稳健性和良好的预测能力。代谢物中的成分可分为两大类,即内源性代谢物和外源性代谢物。
内源性代谢物表现的特征为:在空白对照组与给药组之间,在药物刺激下其浓度水平发生相应改变(增加或减少),并在代谢组学模型中能对样本正常、异常的分类产生影响,包括能够反映毒理或病理状态的潜在生物标志物,其浓度改变是药物毒性或药效的直接反映,它是代谢组学模型建立的基础,即是代谢组学对药物毒性和药效评价与预测的信号源。
外源性代谢物表现的特征为:在代谢组学中它包括两类外源性物质的代谢物,即饲料和药物;对于饲料的代谢物,在空白对照组与给药组之间一般来说它们是基本相同的;对于药物的代谢物,仅存在于给药组之中,而空白对照组是不存在的。由于代谢组学是基于空白对照组与给药组之间的内源性代谢物的“差异性”信号对药物的毒性和药效进行评价和预测,在空白对照组与给药组之间的“等同的”饲料代谢物信号则对代谢组学不会构成明显的影响,而“差异性”的药物代谢物信号则会对代谢组学构成显著影响,甚至造成药物毒性和药效评价结果的错误,特别是对未知组分众多、药效组分复杂的中药代谢组学的影响更为显著。因此,从给药组的样本检测信号中消除外源性代谢物(即药物代谢物)(注:以下所述“外源性代谢物”即指“药物代谢物”)信号即为代谢组学对药物毒性和药效评价的重要问题,基于此发展的代谢组学药物毒性和药效的评价方法才能全面、准确地对其进行评价。
但是现有技术中未见从给药组的样本检测信号中消除外源性代谢物信号以准确获取内源性代谢物信号,并评价代谢组学药物毒性和药效的报道。
发明内容
本发明的发明目的是提供一种应用代谢组学技术评价与预测药物毒性和药效的方法,包括一种应用代谢组学技术评价与预测药物特定毒性的方法,一种应用代谢组学技术评价与预测药物非特定毒性的方法,一种应用代谢组学技术评价与预测药效的方法。
为达到上述发明目的,本发明采用的技术方案是:一种应用代谢组学技术评价与预测药物特定毒性的方法,在代谢组学中所设定的空白对照组、模型毒物组和毒性试验组,将获得代谢组学所依赖的生物样本,通过液相色谱-质谱、气相色谱-质谱、毛细管电泳-质谱中的一种方法检测获取样本量测信号矩阵,据此对药物毒性评价与预测,具体包括以下步骤:
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于苏州大学,未经苏州大学许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201110182900.9/2.html,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 同类专利
- 专利分类
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用