[发明专利]转基因大豆子叶RNA和DNA的同步抽提方法

说明书

技术领域

本发明涉及转基因大豆子叶的RNA和DNA的同步分离纯化，具体说是使用不同蛋白变性剂和氯化锂(LiCl)同步抽提转基因大豆子叶RNA和DNA的方法。

背景技术

大豆是极重要的一种经济作物，富含优质蛋白、不饱和脂肪酸、钙质和保健因子。除了直接食用外，大豆还可以制成豆腐、豆油、酱油、豆瓣酱、大豆蛋白和磷脂等加工品。随着食用油和植物蛋白需求量的不断增加和大豆应用领域的不断扩大，大豆栽培和加工已逐步成为重要的支柱产业。

随着大豆产业的发展，在分子生物学领域开展大豆品质、产量及功能性食品的研发等相关研究显得尤为重要。核酸抽提是上述研究的必要且重要的一步，因为核酸质量对后续的反转录、PCR、限制性内切酶酶切、Northern杂交、文库构建等诸多实验都有显著影响。

在核酸抽提上已有一些相关的技术报道，例如在DNA抽提技术上有CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)法、SDS(十二烷基磺酸钠)-蛋白酶K法、LiCl法等，在RNA抽提技术上有CTAB法、异硫氰酸胍法以及改进的TRIZOL法等。不同生物或不同组织的细胞组分和次级代谢产物不尽相同，因此不同材料需要不同的核酸抽提方法。目前尚无转基因大豆子叶RNA和DNA同步抽提方法的报道。

通常转基因大豆的分子检测是以叶片为材料，分别独立抽提转基因大豆叶片的RNA和DNA，需要较多样品、试剂和工序，而同步抽提RNA和DNA既能节约材料又能节约时间。以子叶代替叶片做核酸分析还能提早对转基因大豆是否获得外源基因以及外源基因是否表达进行检测。所以有必要研发适合转基因大豆子叶RNA和DNA同步抽提的方法。

发明内容

本发明的目的在于提供一种适用于转基因大豆子叶RNA和DNA同时抽提的方法，实验简便、省时、省料，实验结果理想。获得的高纯度的核酸可以用于PCR、RT-PCR、Northern杂交、限制性内切酶酶切、文库构建等后续实验。

经过多次实验探索，得出符合此目的的实验方法，各种方法及其具体步骤如下：

(1)使用含蛋白变性剂(如SDS、异硫氰酸胍或CTAB中的一种或多种试剂)的偏碱性(pH范围7.0～8.5)裂解液裂解样品；

(2)加入等体积的Tris饱和苯酚/氯仿(体积比＝1∶1)，混匀，离心后取上清；

(3)加入等体积氯仿，混匀，离心后取上清；

(4)加入LiCl(终浓度为1～3mol/L)，离心后RNA沉淀在管底；

(5)转移第(4)步的上清至新管，加入乙醇(终浓度为65％～70％(体积比))，离心后得到DNA沉淀；

(6)DNA沉淀经漂洗后，溶于含RNase A水中；

[7]RNA溶液中加入DNase I处理，然后常规苯酚/氯仿抽提，乙醇沉淀，沉淀经漂洗后，于适量RNase-free水中溶解，此步为可选做步骤。

具体实施方式

方案一：SDS裂解与LiCl选择沉淀

(1)100mg新鲜样品液氮研磨，加入1mLSDS裂解液(0.1mol/LTris-Cl(pH8.0)，0.5mol/LNaCl，0.05mol/L EDTA，1.5％(w/v)SDS)，室温放置10min；

(2)加入等体积的Tris饱和酚(PH8.0)与氯仿混合液(体积比＝1∶1)混匀，12000rpm离心5min后取上清；

(3)加入等体积的氯仿并混匀，12000rpm离心5min后取上清；

(4)加入1/4体积10mol/L LiCl，静置30min，12000rpm离心10min后RNA沉淀在管底；

(5)转移第(4)步的上清至新管，加入2倍体积的无水乙醇，12000rpm离心5min后得到DNA沉淀；

(6)RNA和DNA沉淀分别用75％乙醇漂洗，室温干燥；

(7)RNA沉淀溶于适量RNase-free水，-70℃保存，备用；

[8]DNA沉淀溶于含RNase A水中，37℃温浴30min，-20℃保存，备用；

(9)经1.0％非变性琼脂糖电泳检测RNA和DNA，电泳条带清晰完整，无明显拖带，点样孔无明显残留；通过Bio-red核酸蛋白定量仪测得DNA的260/230＝2.0～2.4，260/280＝1.8～2.0，RNA的260/230＝2.0～2.5，260/280＝1.9～2.0。

方案二：异硫氰酸胍裂解与LiCl选择沉淀