[发明专利]环介导等温扩增多重耐药cfr基因的引物及检测多重耐药cfr基因的试剂盒及检测方法有效
申请号: | 201110190471.X | 申请日: | 2011-07-08 |
公开(公告)号: | CN102230019A | 公开(公告)日: | 2011-11-02 |
发明(设计)人: | 齐静;刘玉庆;杜以军;白华;骆延波;朱晓玲;胡明;胡新新;张秀美 | 申请(专利权)人: | 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/02;C12N15/11 |
代理公司: | 济南泉城专利商标事务所 37218 | 代理人: | 李桂存 |
地址: | 250100 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 环介导 等温 扩增 多重 耐药 cfr 基因 引物 检测 试剂盒 方法 | ||
1.一种环介导等温扩增多重耐药cfr基因的引物,其特征在于包括一对外引物,一对内引物和一个环引物,引物核苷酸序列如下:
外引物F3:5’-TCTTGAGCATGCAAACGA-3’,
外引物B3:5’-TCAATATCAATCCCAAATTGACT-3’,
内引物FIP:5’-TGCACTTATTGTAGGATTGTATCGTGTTGTTAGCCTTCTTAAAAGTCG-3’,
内引物BIP:5’-CCTGAGATGTATGGAGAAGCAAACAATTGTGACATGGATACCAGC-3’,
环引物L:5’-GAAGGGCAGGTAGAAGCCT-3’,
其中,外引物与内引物的摩尔比为1:8,外引物与环引物的摩尔比为1:4。
2.一种检测多重耐药cfr基因的试剂盒,其特征是包括若干个装有反应液的LAMP反应管,
其中,每25 μL反应液中含有:12.5 μL 2×等温反应缓冲液、1.0 μL Bst DNA聚合酶、40 pmol内引物FIP、40 pmol内引物BIP、5 pmol外引物F3、5 pmol外引物B3、20 pmol 环引物L、余量为灭菌双蒸水;其中,Bst DNA聚合酶的活性单位为8U/μL;
2×等温反应缓冲液中含有40 mM pH为8.8的Tris-HCl、20 mM KCl、16 mM MgSO4、20 mM (NH4)2SO4、0.2wt% Tween20、1.6 M甜菜碱、2.8 mM dNTP。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于还包括1 μL钙黄绿素。
4.一种检测多重耐药cfr基因的检测方法,其特征是包括以下步骤:
(1)提取待检细菌基因组总DNA;
(2)使用权利要求2或3所述的试剂盒进行检测,具体操作为:将待检细菌基因组DNA加入LAMP反应管的反应液内,混匀,同时设阴性对照和阳性对照,阳性对照中加入反应液内的为含有多重耐药cfr基因的松鼠葡萄球菌基因组DNA,阴性对照中加入反应液内的为灭菌双蒸水,将LAMP反应管置水浴锅中进行扩增,扩增条件为:63℃水浴恒温反应35 min。
5.根据权利要求4所述的检测方法,其特征是步骤(2)中待检细菌基因组DNA为含DNA的浓度为0.003-300 ng/μL的DNA溶液。
6.根据权利要求4所述的检测方法,其特征是LAMP反应管中出现白色沉淀为阳性结果,不出现白色沉淀为阴性结果。
7.根据权利要求4所述的检测方法,其特征是在扩增反应前的反应管中加入1 μL钙黄绿素,反应结束后扩增产物变为绿色的为阳性结果,橙色的是阴性结果。
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