[发明专利]用于指导铂类药物个体化治疗的基因组合无效
申请号: | 201110261587.8 | 申请日: | 2011-09-06 |
公开(公告)号: | CN102367438A | 公开(公告)日: | 2012-03-07 |
发明(设计)人: | 楼敬伟 | 申请(专利权)人: | 上海宝藤生物医药科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
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地址: | 201203 上海市浦东新*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 指导 类药物 个体化 治疗 基因 组合 | ||
1.一组用于指导铂类药物个体化治疗的基因组合,其特征在于该基因组合包含:GSTP1,MRP2,XRCC1-Exon6,XRCC1-Exon10,ERCC1,ERCC2基因。
2.根据权利要求1所述的基因组合,其特征在于针对GSTP1位点设计的正向引物序列为:CTGCTGTGTGGCAGTCTCTC(SEQ ID No.1),反向引物序列为:CCGTTACTTGGCTGGTTGAT(SEQ ID No.2);针对MRP2位点设计的正向引物序列为:GGGCAAAGAAGTGTGTGGAT(SEQ ID No.3),反向引物序列为:AGGGTCCCAACTCTCTCCAT(SEQ ID No.4);针对XRCC1-Exon6位点设计的正向引物序列为:ATACTGACCTTGCGGGACCT(SEQ ID No.5),反向引物序列为:CAGCCTCCAGACCTCTCAAC(SEQ ID NO.6);针对XRCC1-Exon10位点设计的正向引物序列为:TCCACTATGCTGCATGCTTT(SEQ ID No.7),反向引物序列为:ATTGCCCAGCACAGGATAAG(SEQ ID NO.8);针对ERCC1位点设计的正向引物序列为:TGAGCCAATTCAGCCACT(SEQ ID No.9),反向引物序列为:TAGTTCCTCAGTTTCCCG(SEQ ID NO.10);针对ERCC2位点设计的正向引物序列为:GATGGCCCGCTCTGGATT(SEQ ID No.11),反向引物序列为:CCTGCGATTAAAGGCTGTGG(SEQ ID NO.12)。
3.如权利要求2所述的引物序列在检测其相应的基因突变中的应用。
4.如权利要求3所述的应用,其特征在于检测方法如下:
4.1提取病人待测肿瘤组织基因组DNA;
4.2以待测肿瘤组织基因组DNA为模板,用权利要求2所述的扩增引物进行PCR扩增;
4.3PCR扩增产物凝胶电泳分析;
4.4PCR扩增产物测序。
5.如权利要求4所述的应用,其特征在于所述步骤4.2中PCR反应体系每20μl组成如下:待测病人肿瘤组织基因组DNA 50~100ng,Taq酶0.125μl,上下游引物(10μM)各1μl,dNTP(2.5mM)2μl,10×PCR缓冲液(含Mg2+)2μl,余下为无菌蒸馏水。
6.如权利要求4所述的应用,其特征在于所述步骤4.2中用于检测GSTP1的PCR扩增反应条件是:95℃预变性2min,随后95℃变性30sec,55℃退火30sec,72℃延伸30sec,进行40个循环,最后72℃延伸7min,4℃保存。
7.如权利要求4所述的应用,其特征在于所述步骤4.2中用于检测MRP2的PCR扩增反应条件是:95℃预变性2min,随后95℃变性30sec,64℃退火30sec,72℃延伸30sec,进行40个循环,最后72℃延伸7min,4℃保存。
8.如权利要求4所述的应用,其特征在于所述步骤4.2中用于检测XRCC1-Exon6的PCR扩增反应条件是:95℃预变性2min,随后95℃变性30sec,58℃退火30sec,72℃延伸30sec,进行40个循环,最后72℃延伸7min,4℃保存。
9.如权利要求4所述的应用,其特征在于所述步骤4.2中用于检测XRCC1-Exon10的PCR扩增。反应条件是:95℃预变性2min,随后95℃变性30sec,58℃退火30sec,72℃延伸30sec,进行40个循环,最后72℃延伸7min,4℃保存。
10.如权利要求4所述的应用,其特征在于所述步骤4.2中用于检测ERCC1的PCR扩增反应条件是:95℃预变性2min,随后95℃变性30sec,58℃退火30sec,72℃延伸1min,进行40个循环,最后72℃延伸30sec,4℃保存。
11.如权利要求4所述的应用,其特征在于所述步骤4.2中用于检测ERCC2的PCR扩增反应条件是:95℃预变性2min,随后95℃变性30sec,60℃退火30sec,72℃延伸1min,进行40个循环,最后72℃延伸30sec,4℃保存。
12.如权利要求4所述的应用,其特征在于所述步骤4.4中测序PCR扩增的反应条件为:95℃预变性4min,随后95℃变性30sec,50℃退火15sec,进行35个循环,最后60℃延伸4min,4℃保存。
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