[发明专利]用于指导铂类药物个体化治疗的基因组合

说明书

技术领域

本发明属于基因技术领域，涉及一组用于指导铂类药物个体化治疗的基因组合。

背景技术

铂类化疗药物(顺铂、卡铂、奥沙利铂等)是肿瘤化疗领域的最常用药物之一，其抗癌活性是通过在DNA双链上形成共价交联，并与DNA绑定形成铂-DNA加合物，从而引起一系列细胞内事件的发生，最终导致肿瘤细胞死亡。然而部分肿瘤细胞对铂类药物的敏感性差是导致化疗失败，病情进展的主要原因。因此，临床医生在使用铂类药物前，迫切需要一份对疗效、耐药性及预后具有前瞻性指导意义的信息。

GSTP1属于多功能II相代谢酶家族，能催化谷胱甘肽与多种毒性复合物(包括铂类制剂)结合，形成低毒高水溶性物质排出细胞外，达到促进药物排泄而降低抗癌效果的作用。GSTP1外显子5的第313位碱基存在A/G单核苷酸多态，导致其编码的氨基酸发生Ile-Val改变，显著降低GSTP1的活性，从而使化疗药的清除率降低和药物对肿瘤作用的时间延长。

MRP2：MRP2(ABCC2)属于多药耐药相关蛋白(multidrug resistance associated proteins，MRPs)家族，MRPs定位于细胞膜，是一类能量依赖性转运蛋白，主要转运疏水性、不带电荷分子或水溶性阴离子化合物。已经证实MRP2与铂类药物的耐药有关。MRP2表达增强时，顺铂-DNA复合物的形成减少，C2阻滞减少，细胞对铂类的耐药性增强；而当SNP导致MRP2发生氨基酸替换时，这一作用减弱，细胞对铂类敏感性增强。另有研究表明，MRP2可能通过促进GSH结合的铂离子排出细胞外，来增强肿瘤细胞对铂类的耐药性。MRP第10外显子(G1249A)的突变使MRP2的功能降低，从而增加肿瘤患者对铂类药物的敏感性。XRCC1：XRCC1(X-ray repair cross-complementing gene 1)是碱基切除修复系统(BER)和单链断裂修复系统(ssBR)中的重要成分，参与顺铂或卡铂引起的DNA损伤修复过程，其进化保守区有SNP，导致其编码区密码子194和399的取代改变，从而影响XRCC1蛋白的正常功能，改变DNA的修复能力。多项研究表明，在XRCC1 Arg194Trp基因表达中，携带至少1个194Trp等位基因患者化疗有效率是携带野生基因型Arg/Arg患者的3倍；携带XRCC1 399Arg/Arg基因型患者治疗的有效率是Arg/Gln或Gln/Gln基因型者的2.7倍；在联合基因型中，既携带194 Arg/Trp又携带399 Arg/Arg基因型患者化疗有效率进一步提高。

ERCC1：ERCC1(excision repair cross-complementation group 1)是核苷酸切除修复途径的限速酶，在核酸损伤修复过程和凋亡过程中起着重要作用。ERCC1基因的表达产物与DNA修复酶缺乏互补基因F(XPF)形成紧密的异二聚体(ERCC1-XPF)，该二聚体具有识别损伤和5’端切除的双重作用，在核苷酸切除修复中起到限速或调节的重要作用。ERCC1的表达量直接影响DNA修复的生理过程。所有肿瘤细胞中都有ERCC1表达，而且表达水平差异很大。核苷酸切除修复(nucleotide excision repair，NER)是铂类药物耐药的重要机制之一。临床研究已证实ERCC1参与铂类化疗耐药发生，其表达水平与多种癌症铂类化疗疗效和生存期呈负相关，既表达水平低的患者对铂类药物敏感，表达水平高的患者表现耐药。ERCC1基因中118位密码子CC野生型对铂类药物化疗反应性较好，有较好的预后。ERCC1TT突变型会导致ERCC1蛋白表达水平增高，增强修复顺铂对DNA的损伤的能力，因此突变患者对铂类药物耐药。

ERCC2：着色性干皮病基因D(XPD)/切除修复交叉互补基因2(ERCC2)是参与受损DNA核苷酸切除修复(NER)过程的一种重要的酶，其活性直接影响铂类药物的化疗效果。ERCC2存在多个单核苷酸多态性(SNP)，312Asp/Asn和751Lys/Gln多态性比较常见。最常见的为第751位密码子由赖氨酸(Lys)变为谷氨酰胺(Gln)，此多态性影响奥沙利铂(L-OHP)的治疗效果。研究显示，C/C基因型病人缓解率明显比C/A和A/A基因型病人高，C/C基因型病人对铂类药物敏感性更好。