[发明专利]青虾MnSG基因、其扩增方法及扩增引物组无效
申请号: | 201110303792.6 | 申请日: | 2011-10-10 |
公开(公告)号: | CN102367449A | 公开(公告)日: | 2012-03-07 |
发明(设计)人: | 傅洪拓;卜宪飞;乔慧;吴滟;龚永生 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 |
主分类号: | C12N15/57 | 分类号: | C12N15/57;C12N15/11;C12N15/10 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 李纪昌 |
地址: | 214081*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 青虾 mnsg 基因 扩增 方法 引物 | ||
技术领域
本发明涉及基因克隆领域,特别涉及青虾MnSG基因、其扩增方法及扩增引物组。
背景技术
在真核生物中,受精是指两性生殖细胞的相互融合。受精包括精子获能,顶体反应,结合穿越透明带,和卵膜的相互融合等一系列复杂的生理过程。而精子表面的蛋白酶在这些过程中起着重要的调节作用。Honda等对老鼠的研究表明,老鼠的精子上存在一种具有水解明胶活性的蛋白酶,该蛋白酶被认为在精子穿越卵膜时发挥重要作用。Stambaugh等在兔子的研究中发现,兔精子顶体上一种胰蛋白酶是精子成功穿越卵膜所必需的。Kodama等对海鞘的研究表明,海鞘(Halocynthia roretzi)精子上的一种类胰蛋白酶spermosin,在海鞘精子穿越卵膜的过程中起了重要的协助作用。目前,关于甲壳类动物精子蛋白酶的研究非常有限, Li等对罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)的研究中发现,M. rosenbergii精子中一种明胶酶蛋白是雄性生殖道特有的,被认为可能参与受精过程。Rios等对正型动额虾(Rhynchocinetes typus)的研究表明,R. typus的精子提取物中,一种具有胰蛋白酶活性的蛋白被认为参与精子穿越卵膜的过程。
青虾(Macrobrachium nipponense)是我国重要的淡水养殖经济品种。目前青虾的分子研究多集中在群体遗传多样性方面,其基因克隆研究较少,而对青虾精子蛋白酶相关基因克隆的研究尚未见报道。本研究拟以青虾为实验材料,根据本实验室青虾精巢cDNA文库中筛选到的一个青虾精子类明胶酶(Macrobrachium nipponense sperm gelatinase, MnSG)基因片段,通过RACE技术克隆出该基因全长cDNA序列,以期为后续青虾MnSG基因功能的研究奠定基础,同时为甲壳类生殖研究积累背景资料。
发明内容
有鉴于此,本发明提供青虾MnSG基因、其扩增方法及扩增引物组。利用本发明提供的引物组从青虾精巢组织中克隆到了MnSG基因序列,对青虾MnSG基因功能的研究奠定基础,同时为甲壳类生殖研究积累背景资料。
为了实现上述发明目的,本发明提供以下技术方案:
本发明提供了青虾MnSG基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
本发明还提供了用于扩增青虾MnSG基因的引物组,其由如下引物组成:
引物组:
正向外引物3 MnSG 1的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;
正向内引物3 MnSG 2的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示;
反向外引物5 MnSG 1的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;
反向内引物5 MnSG 2的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示。
本发明还提供了一种扩增青虾MnSG基因的方法,包括如下步骤:
步骤1:获得青虾脑组织总RNA;
步骤2:合成cDNA;
步骤3:从本实验室构建的青虾精巢cDNA文库中筛选到MnSG基因片段,以此作为中间序列;
步骤4:用引物组扩增获得青虾MnSG基因片段的3’端和5’端片段;所述引物组由如下引物组成:
正向外引物3 MnSG 1的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;
正向内引物3 MnSG 2的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示;
反向外引物5 MnSG 1的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;
反向内引物5 MnSG 2的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示。
步骤5:将所述MnSG基因cDNA序列的中间片段、所述MnSG基因的3’端和5’端片段拼接,即得。
作为优选,步骤4所述扩增为套式两轮PCR。
本发明以青虾精巢组织为材料,分离了青虾MnSG基因全长cDNA序列,利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)、嵌套聚合酶链反应(Nested-PCR)、3’端cDNA快速扩增(3’-RACE)以及5’端cDNA快速扩增(5’-RACE)的方法,对青虾MnSG基因进行了研究,首次从青虾精巢组织中克隆到了MnSG基因全长cDNA序列,并对其所编码的MnSG的序列特征、同源性、进化地位进行了分析,为进一步研究青虾MnSG基因的表达、功能研究奠定了基础,同时也为甲壳类生殖研究提供了新的材料。
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