[发明专利]3’硫代-2’脱氧核糖-3’硝基吡咯亚磷酰胺单体及其合成方法和应用有效

专利信息
申请号: 201110341249.5 申请日: 2011-11-02
公开(公告)号: CN102516337A 公开(公告)日: 2012-06-27
发明(设计)人: 肖鹏峰;钱晓婷;王文捷;谢宏梅;陆祖宏 申请(专利权)人: 东南大学
主分类号: C07H19/044 分类号: C07H19/044;C07H1/02;C12Q1/68;G01N33/68
代理公司: 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 代理人: 李纪昌
地址: 210096 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 脱氧 核糖 硝基 吡咯 亚磷酰胺 单体 及其 合成 方法 应用
【权利要求书】:

1.3’硫代-2’脱氧核糖-3’硝基吡咯亚磷酰胺单体,其特征在于结构为:

该分子由硝基吡咯基团、3’硫代脱氧核糖基团和亚磷酸基团构成,亚磷酸基团中连接R1和R2基团构成亚磷酰胺基团,脱氧核糖基团的5’羟基位置上连接着基团R3,R1选自于:R2选自于:

-OCH3、-OCH2CH3、-OCH2CH2CN、-OC(CH3)2CH2CN、-OC(CH3)2CCl3、R3选自于:

2.权利要求1所述的3’硫代-2’脱氧核糖-3’硝基吡咯亚磷酰胺单体的合成方法,其特征在于具有如下结构:

具体合成步骤为:

式2化合物1-(2’-脱氧-3’,5’-二-O-甲苯酰基-β-D-呋喃核糖)-3-硝基吡咯的合成:将2.20g,19.62mmol的3-硝基吡咯溶解于245mL乙睛中,在氮气气氛搅拌下加入0.66g,27.5mmol的氢化钠,当反应液变成清晰时,加入式1化合物:1-氯-2-脱氧-3’,5’-二-O-甲苯酰基-α-D-呋喃核糖7.62g,19.62mmol;将上述混合物搅拌1小时,过滤,固体物用乙睛洗涤,滤液蒸发至干,然后经硅胶柱色谱纯化,正己烷-丙酮作为洗提液,最后得到白色固体式2化合物;

式3化合物1-(2’-脱氧-3’,5’-β-D-呋喃核糖)-3-硝基吡咯的合成:将6.0g,12.92mmol的式2化合物放入溶解于甲醇的浓氨水溶液的压力容器中,55℃过夜,氨水和甲醇通过真空蒸发清除,固体物经硅胶柱色谱纯化分离,正己烷-丙酮作为洗提液,得到白色固体式3化合物3;

式4化合物1-(2’-脱氧-5’-二甲氧基三苯基-β-D-呋喃核糖)-3-硝基吡咯的合成:1.32g,5.80mmol的式3化合物和2.0g,5.92mmol的氯化对甲氧基三苯甲烷一同溶解在12mL吡啶中,室温放置1小时,然后不断加入氯化对甲氧基三苯甲烷,直到反应完全,然后将反应液倒入水中,产物用乙醚萃取,并用水洗涤3次,硫酸钠干燥,并用硅胶柱色谱纯化分离,正己烷-丙酮作为洗提液,得到白色泡沫式4化合物4;

2.50g,4.71mmol的式4化合物和17.7g,65.5mmol的硫代苯甲酸铯,溶于16.35mL无水二甲DMF中,加热到110℃反应5小时,反应完成后,溶剂真空脱出,用200毫升乙酸乙酯悬浮残余物,并用饱和碳酸氢钠溶液洗涤3次,有机相用硫酸镁干燥,并在减压下蒸发溶剂得到浓缩物;750mg,2.67mmol硫代苯甲酸铯和200mg,0.77mmol的18-冠醚-6悬浮,在真空脱气、搅拌下溶于5毫升无水乙腈中,将浓缩物分批加入到上述乙腈溶液中搅拌反应2小时,产物冷着至室温后转移到分液漏斗中,用20mL体积比1∶1的乙酸乙酯和水萃取,有机相用硫酸钠干燥,过虑,并在减压下蒸发溶剂得到式5化合物:5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-3’苯甲酰-硫代-次黄嘌呤脱氧核苷;

1.98g,3.04mmol式5化合物在搅拌,同时伴随氩气鼓泡的作用下加入到400毫升乙醇和18.7mL,187mmol的NaOH混合溶液中室温反应1小时,然后将800mL,1M KH2PO4加入到反应液,沉淀物通过过虑、蒸馏水洗涤,并经用P2O5干燥48小时,得到式6化合物5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-3’巯基-次黄嘌呤脱氧核苷;

700mg,1.28mmol的式6化合物溶解在40毫升四氢呋喃、30mL甲醇和10mL水的溶剂中,在氩气保护下用冰的盐和甲醇冷着液冷至-10℃,加入脱气的0.5M,10mL氢氧化钠溶液,在0℃下搅拌10分钟;反应产物经减压浓缩至5毫升,加200毫升乙酸乙酯,用10%wt碳酸钠水溶液萃取3次,有机相用硫化钠干燥,过虑,真空干燥得到泡沫状固体,20毫升乙酸乙酯溶解上述泡沫状固体,并在搅拌下加入到250毫升正己烷中,放置于冷冻柜中冷至-78℃,沉淀物过虑分离,并在真空下干燥,得到式7化合物3’硫代-次黄嘌呤脱氧核苷亚磷酰胺分子。

3.权利要求1所述3’硫代-2’脱氧核糖-3’硝基吡咯亚磷酰胺单体在核酸、蛋白质生物大分子检测中的应用。

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