[发明专利]用于检测EGFR外显子21多态性的引物组及其应用在审
申请号: | 201110341761.X | 申请日: | 2011-10-28 |
公开(公告)号: | CN102453764A | 公开(公告)日: | 2012-05-16 |
发明(设计)人: | 井口亚希 | 申请(专利权)人: | 爱科来株式会社 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 11258 | 代理人: | 肖善强 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 egfr 外显子 21 多态性 引物 及其 应用 | ||
1.用于检测EGFR外显子21中多态性的引物组,所述引物组包含P1寡核苷酸和P2寡核苷酸,并且所述引物组能够通过使用SEQ ID NO:1中的区域作为模板进行扩增,所述区域包含SEQ ID NO:1的第172792个碱基,
所述P1寡核苷酸具有10个碱基到50个碱基的长度,并且具有胞嘧啶作为与SEQ ID NO:1的第172792个碱基互补的碱基,
所述P2寡核苷酸具有10个碱基到50个碱基的长度,并且具有腺嘌呤作为与SEQ ID NO:1的第172792个碱基互补的碱基,和
所述P1寡核苷酸和所述P2寡核苷酸满足下述相关性中的至少一种:所述P1寡核苷酸的解链温度高于P2寡核苷酸的解链温度;或所述P1寡核苷酸比P2寡核苷酸长一个或多个碱基。
2.权利要求1所述的引物组,其中所述P1寡核苷酸或P2寡核苷酸中的至少一个在不同于与SEQ ID NO:1的第172792个碱基互补的碱基位置的位置包含至少一个与SEQ ID NO:1的碱基序列不互补的碱基。
3.权利要求1所述的引物组,其中所述P1寡核苷酸或P2寡核苷酸中的至少一个在不同于与SEQ ID NO:1的第172792个碱基互补的碱基位置的位置包含额外的序列,所述额外的序列由连续的2到10个不与SEQ IDNO:1的碱基序列互补的碱基形成,并且位于寡核苷酸链的5′末端。
4.权利要求1所述的引物组,其中所述P1寡核苷酸或P2寡核苷酸中的至少一个在同于与SEQ ID NO:1的第172792个碱基互补的碱基位置的位置包含错配碱基或包含与SEQ ID NO:1的碱基序列不互补的2到20个错配碱基的序列。
5.权利要求1所述的引物组,其中所述P1寡核苷酸或P2寡核苷酸中的至少一个在从其3′末端起的第1位到第3位中的一处包含与SEQ ID NO:1的第172792个碱基互补的碱基。
6.权利要求1所述的引物组,其中所述P1寡核苷酸的解链温度比所述P2寡核苷酸的解链温度高0.1℃到20℃。
7.权利要求1所述的引物组,所述引物组还包含与下述序列同源的引物,所述序列处于位于SEQ ID NO:1碱基序列中的模板核酸序列的5′末端侧的区域中,其中所述模板核酸序列与所述P1寡核苷酸或P2寡核苷酸互补。
8.权利要求1所述的引物组,所述引物组包含SEQ ID NO:2到SEQID NO:11的寡核苷酸中的至少一个作为P1寡核苷酸,和SEQ ID NO:12到SEQ ID NO:21的寡核苷酸中的至少一个作为P2寡核苷酸。
9.用于检测EGFR外显子21中多态性的引物,所述引物能够通过使用SEQ ID NO:1中的区域作为模板进行扩增,所述区域包含SEQ ID NO:1的第172792个碱基,并且,所述引物是下述寡核苷酸,所述寡核苷酸具有10个碱基到50个碱基的长度,并且具有胞嘧啶作为与SEQ ID NO:1的第172792个碱基互补的碱基。
10.权利要求9所述的引物,所述引物在不同于与SEQ ID NO:1的第172792个碱基互补的碱基位置的位置包含至少一个与SEQ ID NO:1的碱基序列不互补的碱基。
11.权利要求9所述的引物,所述引物在不同于与SEQ ID NO:1的第172792个碱基互补的碱基位置的位置包含一个或多个与SEQ ID NO:1的碱基序列不互补的碱基,所述一个或多个不互补的碱基选自由下组,所述组由:
额外的序列,所述序列由连续的2到10个碱基形成,且位于所述引物5′末端;
错配碱基;和
2到20个错配碱基的序列
组成。
12.权利要求9所述的引物,所述引物在从其3′末端起的第1位到第3位中的一处包含与SEQ ID NO:1的第172792个碱基互补的碱基。
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