[发明专利]抗结核抑制剂筛选的靶标基因Rv2498c及应用

权利要求书

1.结核分枝杆菌基因Rv2498c在筛选抗结核抑制剂靶标中的应用，其特征在于，该基因的核苷酸序列如序列表SEQ.ID NO：1所示。

2.结核分枝杆菌基因Rv2498c在筛选抗结核抑制剂靶标中的应用，其特征在于，该基因编码的蛋白质的序列如序列表SEQ.ID NO：2所示。

3.如权利要求1或2所述的一种结核分枝杆菌Rv2498c基因作为药物靶标的应用，其特征在于包含以下步骤：

(1)从PBD蛋白质数据库获得结核分枝杆菌Rv2498c蛋白质结构，Rv2498c蛋白质与草酰乙酸离子复合物结合的空腔被选作对接化合物的活性位点；

(2)建立针对结核分枝杆菌Rv2498c的计算机药物筛选系统；

(3)运用步骤(2)的计算机药物筛选系统针对结核分枝杆菌Rv2498c蛋白质活性位点，从ZINC数据库中筛选出20个与结核分枝杆菌Rv2498c活性位点有高亲和力的化合物；

(4)利用小分子化合物进行抑菌试验，测定有抑菌活性的小分子的最小抑菌浓度；

其中：

步骤(1)中的结核分枝杆菌Rv2498c蛋白质的序列如序列表SEQ ID NO：2所示；

步骤(3)的20个与结核分枝杆菌Rv2498c活性位点有高亲和力的化合物如下所述，且具有以下特征：

化合物43#

英文名称：6-(3，4-dihydro-2(1H)-isoquinolinyl)hexylamine

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC02029199；

化合物44#

英文名称：6-(1-piperidinyl)hexylamine

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC02029173；

化合物46#

英文名称：2-(4-imidazo[1，2-a]pyridin-2-ylbenzylidene)hydrazinecarboximidamide

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC00337551；

化合物47#

英文名称：6-(4-{2-[amino(imino)methyl]carbohydrazonoyl}phenyl)-7-methylimidazo[2，1-b][1，3]thiazol-7-ium

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC00337555；

化合物64#

英文名称：

2-(1，3-benzoxazol-2-yl)-3-(1，3，5-triazatricyclo[3.3.1.1～3，7～]dec-7-ylamino)acrylaldehyde

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC19329936；

化合物65#

英文名称：2-amino-4-(4-chloroanilino)-6-oxo-1，6-dihydro-5-pyrimidinylformamide

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC04938764；

化合物66#

英文名称：-anilino-6-piperidin-1-yl-1，3，5-triazin-2(1H)-one hydrazone

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC34633360；

化合物67#

英文名称：N-{3-[[(acetyloxy)imino](amino)methyl]thien-2-yl}acetamide

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC17111243；

化合物68#

英文名称：N～6～-[(2，2，2-trichloroethoxy)carbonyl]lysine

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC02028782；

化合物69#

英文名称：4-(methylsulfanyl)-1H-imidazo[4，5-d]pyridazin-7-yl hydrosulfide

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC18096847；

化合物70#

英文名称：N-allyl-N-[3-(allylimino)-1，4-dihydro-2-quinoxalinylidene]amine

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC13281923；

化合物71#

英文名称：N-phenyl-N-(3-(phenylimino)-1，4-benzodithiin-2(3H)-ylidene)amine

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC17255860；

化合物72#

英文名称：

4-methylspiro(pentacyclo[4.3.0.0～2，5～.0～3，8～.0～4，7～]nonane-9，2′-[1，3]-dioxolane)-1-ylamine

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC04085800；

化合物73#

英文名称：6-(1-pyrrolidinyl)hexylamine

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC02029191；

化合物74#

英文名称：2-(2-benzyl-1H-indol-3-yl)ethanamine

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC00332045；

化合物75#

英文名称：2-{2-[amino(imino)methyl]carbohydrazonoyl}-1-methylimidazo[1，2-a]pyridin-1-ium

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC00337558；

化合物76#

英文名称：3-{4-[6-(3-oxo-1-propenyl)imidazo[1，2-a]pyridin-2-yl]phenyl}acrylaldehyde

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC17111559；

化合物77#

英文名称：5-hydrazino-3-methyl-1H-pyrazole-4-carbohydrazide

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC00967162；

化合物78#

英文名称：2-hydroxy-N-(2-piperazin-1-ylethyl)benzamide

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC19901616；

化合物79#

英文名称：N″-(5-chloro-2-hydroxybenzoyl)N-(2-phenylethyl)guanidine

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC04087190；

其中

步骤(4)测定有抑菌活性的小分子化合物66#的最小抑菌浓度分别如下：

结核分枝杆菌      4μg/ml；

牛结核分枝杆菌    2～4μg/ml；

步骤(4)测定有抑菌活性的小分子化合物即抑制剂70#的最小抑菌浓度分别如下：

结核分枝杆菌      8μg/ml；

牛结核分枝杆菌    8μg/ml。