[发明专利]检测结肠腺癌相关基因启动子甲基化引物有效
申请号: | 201110383433.6 | 申请日: | 2011-11-28 |
公开(公告)号: | CN102373286A | 公开(公告)日: | 2012-03-14 |
发明(设计)人: | 王树;杨琼;吴蔚 | 申请(专利权)人: | 中国科学院化学研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 100080 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 结肠 腺癌 相关 基因 启动子 甲基化 引物 | ||
1.一种检测待测DNA甲基化的引物,为如下1)或2):
1)所示的引物由引物对A-引物对F组成;
所述引物对A由引物1和引物2组成;
所述引物对B由引物3和引物4组成;
所述引物对C由引物5和引物6组成;
所述引物对D由引物7和引物8组成;
所述引物对E由引物9和引物10组成;
所述引物对F由引物11和引物12组成;
所述引物1-引物12的核苷酸序列依次分别为序列表中的序列1-12;
2)所示的引物为所述引物对A-引物对F中的至少一种。
2.根据权利要求1所述的引物,其特征在于:
所述引物对A用于检测VIM基因的甲基化;所述引物对A具体用于检测VIM基因CpG位点的甲基化;
所述引物对B用于检测MGMT基因的甲基化;所述引物对B具体用于检测MGMT基因CpG位点的甲基化;
所述引物对C用于检测TMEFF2或HPP1基因的甲基化;所述引物对C具体用于检测TMEFF2或HPP1基因CpG位点的甲基化;
所述引物对D用于检测ESR1基因的甲基化;所述引物对D具体用于检测ESR1基因CpG位点的甲基化;
所述引物对E用于检测APC基因的甲基化;所述引物对E具体用于检测APC基因CpG位点的甲基化;
所述引物对F用于检测MLH1基因的甲基化;所述引物对F具体用于检测MLH1基因CpG位点的甲基化。
3.一种检测待测DNA的甲基化的PCR试剂,为如下1)或2):
1)所示的PCR试剂包括PCR试剂A1-PCR试剂F1;
所述PCR试剂A1由所述引物对A、dNTPs、PCR扩增缓冲液和DNA聚合酶组成;
所述PCR试剂B1由所述引物对B、dNTPs、PCR扩增缓冲液和DNA聚合酶组成;
所述PCR试剂C1由所述引物对C、dNTPs、PCR扩增缓冲液和DNA聚合酶组成;
所述PCR试剂D1由所述引物对D、dNTPs、PCR扩增缓冲液和DNA聚合酶组成;
所述PCR试剂E1由所述引物对E、dNTPs、PCR扩增缓冲液和DNA聚合酶组成;
所述PCR试剂F1由所述引物对F、dNTPs、PCR扩增缓冲液和DNA聚合酶组成;
2)所示的PCR试剂包括PCR试剂A1-F1中的至少一种。
4.根据权利要求3所述的试剂,其特征在于:
1)所示的PCR试剂还包括PCR试剂A2-PCR试剂F2;
2)所示的PCR试剂还包括PCR试剂A2-PCR试剂F2中的至少一种;
所述PCR试剂A2-PCR试剂F2为将所述PCR试剂A1-PCR试剂F1中的dNTPs替换为dNTPs’;
所述dNTPs’由荧光素标记的dATP、荧光素标记的dGTP、dATP、dCTP和dTTP组成。
5.根据权利要求3或4所述的试剂,其特征在于:
每条所述引物在对应的所述PCR试剂中的终浓度均为400nM;
所述引物对A用于检测VIM基因的甲基化;所述引物对A具体用于检测VIM基因CpG位点的甲基化;
所述引物对B用于检测MGMT基因的甲基化;所述引物对B具体用于检测MGMT基因CpG位点的甲基化;
所述引物对C用于检测TMEFF2或HPP1基因的甲基化;所述引物对C具体用于检测TMEFF2或HPP1基因CpG位点的甲基化;
所述引物对D用于检测ESR1基因的甲基化;所述引物对D具体用于检测ESR1基因CpG位点的甲基化;
所述引物对E用于检测APC基因的甲基化;所述引物对E具体用于检测APC基因CpG位点的甲基化;
所述引物对F用于检测MLH1基因的甲基化;所述引物对F具体用于检测MLH1基因CpG位点的甲基化。
6.根据权利要求3-5中任一所述的试剂,其特征在于:
1)所示的PCR试剂由PCR试剂A1-F1和PCR试剂A2-F2组成;
2)所示的PCR试剂由PCR试剂A1-F1中的至少一种及其对应的PCR试剂A2-F2中的至少一种组成。
7.含有权利要求1或2的所述引物或含有权利要求3-6中任一所述试剂的试剂盒。
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