[发明专利]一种鉴别牛分枝杆菌的PCR引物及方法无效
申请号: | 201110391925.X | 申请日: | 2011-11-30 |
公开(公告)号: | CN102409102A | 公开(公告)日: | 2012-04-11 |
发明(设计)人: | 周向梅;赵德明;李华;林敬钧;杨利峰;尹晓敏;杨春华 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/32 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王朋飞;王加岭 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴别 分枝杆菌 pcr 引物 方法 | ||
1.一种用于PCR鉴别牛分枝杆菌的特异性引物组合,其特征在于,其分别能对分枝杆菌属细菌的16SrRNA保守区、结核分枝杆菌复合群MTBC的Rv0577基因,结核分枝杆菌RD7区域的Rv1970,牛分枝杆菌pncA基因和RD1区基因进行扩增,生成特异性扩增片段。
2.如权利要求1所述的PCR鉴别用引物组合,包括:
116SrRNA-F 5’-ACGGTGGGTACTAGGTGTGGGT T TC-3’;
16SrRNA-R 5’-TCTGCGATTAGCGACTAAGACTTCA-3’;
2MTBC-F 5’-ATGCCCAAGAGAAGCGAATACAGGCAA-3’;
MTBC-R 5’-CTATTGCTGCGGTGCGGGCTTCAA-3’;
3MT-F 5’-GCGCAGCTGCCGGATGTCAAC-3’;
MT-R 5’-CGCCGGCAGCCTCACGAAATG-3’;
4PncA-F 5’-CTCAGCTGGTCATGTTCCCGAT-3’;
PncA-R 5’-CGGTGTGCCGGAGAAGCCG-3’;
5RD1-F 5’-AAGCGGTTGCCGCCGACCGACC-3’;
RD1-R 5’-GAGGCGATCTGGCGGTTTGGGG-3’。
3.一种鉴别牛分枝杆菌的PCR方法,其特征在于,以样品总DNA为模板,利用权利要求1或2所述的引物分别进行PCR扩增,反应结束后根据琼脂糖凝胶电泳判定结果。
4.如权利要求3所述的方法,还包括:当待测菌为未知菌时,以样品总DNA为模板,利用权利要求2所述的第1~5对引物组合,分别进行PCR扩增;或
当待测菌为分枝杆菌属细菌时,以样品总DNA为模板,利用权利要求2所述的第2~5对引物组合,分别进行PCR扩增;或
当待测菌为结核分枝杆菌复合群细菌时,以样品总DNA为模板,利用权利要求2所述的第3~5对引物组合,分别进行PCR扩增;或
当待测菌为结核分枝杆菌时,以样品总DNA为模板,利用权利要求2所述的第4~5对引物组合,分别进行PCR扩增;或
当待测菌为牛分枝杆菌细菌时,以样品总DNA为模板,利用权利要求2所述的第5对引物,进行PCR扩增;反应结束后根据琼脂糖凝胶电泳判定结果。
5.如权利要求3或4所述的PCR方法,其特征在于,
含有16SrRNA、MTBC、PncA引物对的PCR的反应程序为:预变性94℃、5min,再经94℃变性40s,60℃退火40s,72℃延伸40s,31个循环,最后72℃延伸10min;或
含有MT引物对的PCR的反应程序为:预变性94℃、5min,再经94℃变性40s,61℃退火40s,72℃延伸40s,31个循环,最后72℃延伸10min;或
含有RD1引物对的PCR的反应程序为:预变性94℃、5min,再经94℃变性40s,62℃退火40s,72℃延伸40s,31个循环,最后72℃延伸10min。
6.如权利要求5所述的PCR方法,其特征在于,所述PCR扩增反应体系,其中20μl反应液的具体配置为:
7.如权利要求3或4所述的方法,其特征在于,样品总DNA来自分离的菌种资源或动物组织。
8.一种鉴别牛分枝杆菌的试剂盒,其包括,权利要求1或2所述的引物组合。
9.权利要求1或2所述的引物对在制备用于检测及鉴别牛分枝杆菌试剂中的用途。
10.权利要求1~2所述的引物或权利要求3~4所述的方法在制备预防结核病疫苗中的应用。
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