[发明专利]一种检测肺癌易感基因的方法及试剂盒有效
申请号: | 201110391964.X | 申请日: | 2011-11-30 |
公开(公告)号: | CN102373287A | 公开(公告)日: | 2012-03-14 |
发明(设计)人: | 盛司潼 | 申请(专利权)人: | 盛司潼 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 518057 广东省深圳市南山区*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 肺癌 基因 方法 试剂盒 | ||
1.一种检测肺癌易感基因的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
A.利用肺癌易感基因特异性引物,对待测样品中的多个目标区域进行扩增,并基于扩增产物构建测序文库;
B.对测序文库进行单分子扩增,得到与所述多个目标区域对应的多个单分子扩增产物;
C.同时对所述多个单分子扩增产物进行高通量基因测序,得到所述多个目标区域的序列信息。
2.根据权利要求1所述的检测肺癌易感基因的方法,其特征在于,所述步骤A包括:
A1.利用肺癌易感基因特异性引物,对待测样品中的多个目标区域进行扩增,得到与所述多个目标区域对应的扩增产物;
A2.利用接头元件,与所述多个目标区域对应的扩增产物进行连接,得到测序文库;所述接头元件采用平末端接头、突出末端接头、带茎环结构的接头和分叉接头中的至少一种。
3.根据权利要求2所述的检测肺癌易感基因的方法,其特征在于,所述步骤A2包括以下步骤:
A21.对与所述多个目标区域对应的扩增产物进行片段化,得到片段化产物;
A22.利用接头元件,与所述片段化产物进行连接,构建测序文库。
4.根据权利要求3所述的检测肺癌易感基因的方法,其特征在于,所述步骤A22包括以下步骤:
A221.利用第一接头与片段化产物的两端连接,得第一连接产物;
A222.环化第一连接产物,得环化产物;
A223.II s型限制性内切酶酶切环化产物,得酶切产物;
A224.在酶切产物两端接上第二接头和第三接头,得测序文库。
5.根据权利要求3所述的检测肺癌易感基因的方法,其特征在于,所述步骤A22包括以下步骤:
A221’.利用第四接头与片段化产物连接,得第二连接产物;
A222’.II s型限制性内切酶酶切第二连接产物,得带有第四接头的酶切片段;
A223’.带有第四接头的酶切片段与第五接头连接,形成测序文库。
6.根据权利要求2至5任一项所述的检测肺癌易感基因的方法,其特征在于,步骤A2所述接头元件中的至少一个接头包含有第一标签序列,用于在文库构建过程中,对不同待测样品的测序文库做上相应的标记。
7.根据权利要求1至5任一项所述的检测肺癌易感基因的方法,其特征在于,步骤A与每个目标区域对应的特异性引物中,至少有一条引物与目标区域部分互补,且该引物的5’端带有第二标签序列,用于在扩增目标区域过程中,对不同待测样品的目标区域扩增产物做上相应的标记。
8.根据权利要求1至5任一项所述的检测肺癌易感基因的方法,其特征在于,所述肺癌易感基因包括APE1、CASP7、CASP8、CASP9、CHEK2、COX-2、CYP1A1、CYP2E1、ERCC1、ERCC2、ERCC6、Exo1、GSTP1、Hmlh1、IL-1β、MDM2、MPO、MTHFR、NQO1、OGG1、P73、RASSF1、TERT、TGFB1、TP53、TP63、XPC和XRCC1中的至少一个。
9.根据权利要求1所述的检测肺癌易感基因的方法,其特征在于,所述方法还包括步骤:
D.利用GSTM1及GSTT1的扩增引物对待测样品的核酸进行PCR扩增,凝胶电泳检测GSTM1和GSTT1基因的缺失情况;步骤D与步骤A、B、C无先后关系。
10.一种肺癌易感基因检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:
肺癌易感基因特异性引物,用于对待测样品中的多个目标区域进行扩增;
接头元件,用于与扩增产物结合构建测序文库。
11.根据权利要求10所述的肺癌易感基因检测试剂盒,其特征在于,所述接头元件采用平末端接头、突出末端接头、带茎环结构的接头和分叉接头中的至少一种。
12.根据权利要求10所述的肺癌易感基因检测试剂盒,其特征在于,所述接头元件中的至少一个接头包含有第一标签序列,用于在文库构建过程中,对不同待测样品的测序文库做上相应的标记。
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